14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5796 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_5796  putative kinase  100 
 
 
148 aa  307  2e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1512  hypothetical protein  50 
 
 
146 aa  167  5e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.140954  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1589  hypothetical protein  50.34 
 
 
153 aa  164  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0106801 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2088  hypothetical protein  52.67 
 
 
150 aa  145  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000337325  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4050  hypothetical protein  40.14 
 
 
150 aa  131  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1781  kinase-like protein  37.04 
 
 
194 aa  103  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150793  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2137  hypothetical protein  29.77 
 
 
134 aa  77  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05751  DNA kinase/phosphatase (Eurofung)  26.53 
 
 
519 aa  61.6  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.396149  normal  0.010581 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44960  hypothetical protein  33.8 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3321  hypothetical protein  25.41 
 
 
347 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.630565  normal  0.105532 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6277  hypothetical protein  25 
 
 
370 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5049  hypothetical protein  22.48 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0838  metallophosphoesterase  26.53 
 
 
448 aa  44.3  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6752  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase(symmetrical)  25.2 
 
 
847 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.326464 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>