20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1512 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1512  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  307  2.9999999999999997e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.140954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5796  putative kinase  50 
 
 
148 aa  167  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1589  hypothetical protein  52.35 
 
 
153 aa  163  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0106801 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2088  hypothetical protein  52.71 
 
 
150 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000337325  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4050  hypothetical protein  46.94 
 
 
150 aa  141  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1781  kinase-like protein  37.76 
 
 
194 aa  93.6  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150793  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2137  hypothetical protein  35.11 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2538  kinase-like protein  29.73 
 
 
335 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05751  DNA kinase/phosphatase (Eurofung)  26.81 
 
 
519 aa  56.6  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.396149  normal  0.010581 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0488  kinase-like protein  28.12 
 
 
155 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2021  hypothetical protein  26.9 
 
 
183 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.70012  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4619  hypothetical protein  34.62 
 
 
180 aa  46.6  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.420517  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2278  hypothetical protein  27.66 
 
 
715 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0799  chromatin associated protein KTI12  24.11 
 
 
260 aa  45.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1184  chromatin associated protein KTI12  24.11 
 
 
264 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.18154  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0734  chromatin associated protein KTI12  23.4 
 
 
257 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.394826 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0491  chromatin associated protein KTI12  23.4 
 
 
255 aa  42.4  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6277  hypothetical protein  23.81 
 
 
370 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4338  hypothetical protein  25.53 
 
 
717 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427391  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1257  metal dependent phosphohydrolase  25.93 
 
 
376 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>