18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2278 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2278  hypothetical protein  100 
 
 		 715 aa  1467    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5366  hypothetical protein  47.82 
 
 		 713 aa  625  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4338  hypothetical protein  36.3 
 
 		 717 aa  459  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1045  hypothetical protein  39.64 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2021  hypothetical protein  37.65 
 
 		 183 aa  96.3  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.70012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4619  hypothetical protein  37.4 
 
 		 180 aa  82.4  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.420517  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0167  metallophosphoesterase  31.25 
 
 		 852 aa  58.9  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.500527 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5228  hypothetical protein  43.04 
 
 		 137 aa  53.9  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.557629  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0488  kinase-like protein  29.51 
 
 		 155 aa  51.6  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1184  chromatin associated protein KTI12  26.12 
 
 		 264 aa  50.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.18154  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4050  hypothetical protein  28.97 
 
 		 150 aa  49.7  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0087  seryl-tRNA(Sec) kinase  26.12 
 
 		 255 aa  48.5  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1977  metallophosphoesterase  28.37 
 
 		 850 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.350042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1512  hypothetical protein  27.66 
 
 		 146 aa  46.2  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.140954  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2768  metallophosphoesterase  27.15 
 
 		 870 aa  45.8  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0734  chromatin associated protein KTI12  24.63 
 
 		 257 aa  45.4  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.394826 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1593  metallophosphoesterase  29.08 
 
 		 858 aa  45.8  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.97058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0799  chromatin associated protein KTI12  23.88 
 
 		 260 aa  45.1  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>