41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0087 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0087  seryl-tRNA(Sec) kinase  100 
 
 
255 aa  504  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1184  chromatin associated protein KTI12  85.49 
 
 
264 aa  431  1e-120  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.18154  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0734  chromatin associated protein KTI12  85.88 
 
 
257 aa  427  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.394826 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0799  chromatin associated protein KTI12  70.7 
 
 
260 aa  357  8e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0491  chromatin associated protein KTI12  59.06 
 
 
255 aa  266  2e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1043  adenylylsulfate kinase  26.75 
 
 
178 aa  64.7  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.727685  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02080  hypothetical protein  25.24 
 
 
275 aa  62  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2021  hypothetical protein  27.4 
 
 
183 aa  60.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.70012  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0914  kinase-like protein  29.51 
 
 
200 aa  59.3  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2538  kinase-like protein  25.9 
 
 
335 aa  53.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4619  hypothetical protein  27.01 
 
 
180 aa  53.1  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.420517  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5366  hypothetical protein  27.06 
 
 
713 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0488  kinase-like protein  21.8 
 
 
155 aa  52  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0664  putative kinase  23.97 
 
 
480 aa  49.3  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.432337  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31360  hypothetical protein  26.49 
 
 
409 aa  49.3  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.559839 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0266  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  25.79 
 
 
175 aa  49.3  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0596402  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19191  predicted protein  21.34 
 
 
289 aa  48.5  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2278  hypothetical protein  26.12 
 
 
715 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1031  hypothetical protein  26.02 
 
 
182 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0138831  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_902  hypothetical protein  29.79 
 
 
200 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00277515  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14600  predicted kinase  25.9 
 
 
166 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0408324  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44319  predicted protein  23.28 
 
 
291 aa  47  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.453921 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_16752  predicted protein  28.71 
 
 
245 aa  45.4  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.335346  normal  0.104693 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4338  hypothetical protein  27.69 
 
 
717 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427391  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5416  AAA ATPase  25.64 
 
 
393 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5592  AAA ATPase  25.64 
 
 
393 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0637  adenylylsulfate kinase  22.1 
 
 
204 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0633  Polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase  24.66 
 
 
316 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0439631 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2799  adenylylsulfate kinase  22.1 
 
 
204 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2265  hypothetical protein  33.33 
 
 
170 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2912  adenylylsulfate kinase  22.1 
 
 
206 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137451  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1690  adenylylsulfate kinase  22.1 
 
 
206 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.228231  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2375  adenylylsulfate kinase  22.1 
 
 
206 aa  43.9  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755803  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4450  adenylylsulfate kinase  24.66 
 
 
186 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2676  adenylylsulfate kinase  22.1 
 
 
206 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.607978  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2733  adenylylsulfate kinase  22.1 
 
 
206 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.57754  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3943  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  25.32 
 
 
170 aa  43.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1923  adenylylsulfate kinase  24.37 
 
 
175 aa  43.5  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.650575  normal  0.0299236 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1509  adenylyl-sulfate kinase  25.64 
 
 
196 aa  43.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00000674636  normal  0.655185 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1599  polyA polymerase related protein  22.14 
 
 
378 aa  42.4  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.29317  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4134  adenylylsulfate kinase  26.25 
 
 
181 aa  42  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000428078 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>