More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2768 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3744  putative protein serine-threonine phosphatase  52.75 
 
 
852 aa  925    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614096  normal  0.060115 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1723  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  53.62 
 
 
853 aa  952    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000078095  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0921  metallophosphoesterase  54.76 
 
 
847 aa  967    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168883  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4542  metallophosphoesterase  60.59 
 
 
859 aa  1138    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5514  metallophosphoesterase  52.46 
 
 
870 aa  924    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.425865  normal  0.108613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3285  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  56.08 
 
 
847 aa  1004    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153744 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1593  metallophosphoesterase  61 
 
 
858 aa  1136    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.97058  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2392  metallophosphoesterase  44.38 
 
 
852 aa  722    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.949066  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0483  metallophosphoesterase  48.62 
 
 
830 aa  861    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1977  metallophosphoesterase  62.76 
 
 
850 aa  1170    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.350042  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3502  metallophosphoesterase  52.3 
 
 
834 aa  894    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4014  metallophosphoesterase  50.52 
 
 
864 aa  879    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.248508 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2983  metallophosphoesterase  55.57 
 
 
854 aa  997    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0167  metallophosphoesterase  54.37 
 
 
852 aa  968    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.500527 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37630  predicted kinase  52.93 
 
 
877 aa  951    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2768  metallophosphoesterase  100 
 
 
870 aa  1799    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3131  metallophosphoesterase  52.86 
 
 
857 aa  953    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000324494  hitchhiker  0.000110445 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0942  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  53.28 
 
 
852 aa  968    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6752  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase(symmetrical)  53.62 
 
 
847 aa  937    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1195  metallophosphoesterase  54.49 
 
 
863 aa  978    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827204  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2592  putative phosphatase  53.65 
 
 
447 aa  457  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.739631  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0838  metallophosphoesterase  43.56 
 
 
448 aa  335  3e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2565  metallophosphoesterase  53.01 
 
 
261 aa  272  2e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.887956  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2179  metallophosphoesterase  51.59 
 
 
258 aa  249  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1664  metallophosphoesterase  47.86 
 
 
269 aa  231  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0848196 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0778  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  48.35 
 
 
245 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1633  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  47.45 
 
 
245 aa  215  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0918  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  43.19 
 
 
246 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.562168  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1362  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  44.31 
 
 
246 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1324  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  43.53 
 
 
246 aa  197  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4084  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  45.42 
 
 
246 aa  197  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1124  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  43.53 
 
 
246 aa  197  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1099  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  43.92 
 
 
246 aa  196  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1217  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  43.53 
 
 
246 aa  197  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1286  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  43.53 
 
 
246 aa  196  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1105  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  43.92 
 
 
246 aa  196  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1257  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  44.17 
 
 
246 aa  195  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1112  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  41.96 
 
 
246 aa  187  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3122  metallophosphoesterase  23.13 
 
 
856 aa  159  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304463  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1217  metallophosphoesterase  34.66 
 
 
248 aa  129  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.370724  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3090  metallophosphoesterase  29.48 
 
 
220 aa  99.4  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108769  normal  0.0608782 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34060  Metallophosphoesterase protein  37.18 
 
 
328 aa  91.3  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0103996  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1989  metallophosphoesterase  30.23 
 
 
236 aa  90.9  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0187  metallophosphoesterase  31.12 
 
 
209 aa  89.7  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0160617  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0526  Luciferase-like monooxygenase  34.69 
 
 
484 aa  90.1  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2943  metallophosphoesterase  39.75 
 
 
324 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0111879  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1573  metallophosphoesterase  36.71 
 
 
323 aa  86.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24274 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2013  metallophosphoesterase  38.06 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3729  metallophosphoesterase  36.71 
 
 
323 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2071  diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatase  35.8 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125008  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1545  metallophosphoesterase  36.71 
 
 
323 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.556937  normal  0.552799 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1308  hypothetical protein  36.42 
 
 
335 aa  84.3  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1734  serine/threonine protein phosphatase  36.2 
 
 
338 aa  83.2  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24230  hypothetical protein  48.86 
 
 
326 aa  80.9  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000134322  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2051  hypothetical protein  48.86 
 
 
326 aa  80.9  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00546921  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2196  metallophosphoesterase  32.35 
 
 
323 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2701  metallophosphoesterase  29.63 
 
 
246 aa  80.5  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.41286  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1686  metallophosphoesterase  38.06 
 
 
321 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275545  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0029  metallophosphoesterase  28.39 
 
 
218 aa  79  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0458  metallophosphoesterase  27.31 
 
 
230 aa  78.6  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2800  metallophosphoesterase  31.3 
 
 
242 aa  78.2  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0227115  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09581  Serine/threonine specific protein phosphatase  28.33 
 
 
342 aa  78.2  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.392097 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2893  metallophosphoesterase  29.18 
 
 
242 aa  77.8  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.331732  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2674  metallophosphoesterase  29.91 
 
 
213 aa  76.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607795  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2203  metallophosphoesterase  36.43 
 
 
329 aa  76.3  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2707  metallophosphoesterase  29.28 
 
 
242 aa  75.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430014  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2344  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  30.8 
 
 
213 aa  75.1  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.448077  normal  0.141683 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3792  serine/threonine protein phosphatase  36.77 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.055034  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4972  metallophosphoesterase  44.57 
 
 
360 aa  75.1  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0412  protein phosphatase 1  28.89 
 
 
215 aa  73.9  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000414677  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2538  kinase-like protein  33.77 
 
 
335 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1741  metallophosphoesterase  25.69 
 
 
764 aa  73.9  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1753  metallophosphoesterase  27.87 
 
 
336 aa  73.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5182  metallophosphoesterase  46.67 
 
 
352 aa  73.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4095  metallophosphoesterase  38.33 
 
 
309 aa  72.8  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1680  serine/threonine protein phosphatase  26.75 
 
 
235 aa  72  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1028  metallophosphoesterase  25.74 
 
 
209 aa  72  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2347  metallophosphoesterase  28.92 
 
 
234 aa  72  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419284 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0345  metallophosphoesterase  27.35 
 
 
208 aa  71.6  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0100121  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2626  metallophosphoesterase  30.3 
 
 
224 aa  71.6  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.0771552 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3720  metallophosphoesterase  28.06 
 
 
229 aa  71.2  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4095  metallophosphoesterase  28.86 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.590494  normal  0.27033 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1311  metallophosphoesterase  39.17 
 
 
311 aa  71.2  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.452113  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1103  metallophosphoesterase  41.3 
 
 
350 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3932  diadenosine tetraphosphatase  24.75 
 
 
276 aa  69.7  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1654  serine/threonine specific protein phosphatase  27.43 
 
 
206 aa  69.7  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0069459  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5084  metallophosphoesterase  28.69 
 
 
221 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1121  metallophosphoesterase  29.05 
 
 
243 aa  68.9  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00136945  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5380  metallophosphoesterase  29.57 
 
 
221 aa  68.9  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43482  predicted protein  27.05 
 
 
1225 aa  68.9  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3312  metallophosphoesterase  26.34 
 
 
391 aa  68.6  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273661  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1796  metallophosphoesterase  29.22 
 
 
233 aa  68.6  0.0000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1620  metallophosphoesterase  30.41 
 
 
226 aa  68.2  0.0000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2593  metallophosphoesterase  26.4 
 
 
230 aa  68.6  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000136211  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5880  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  29.56 
 
 
267 aa  68.2  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0304  hypothetical protein  42.53 
 
 
314 aa  67.8  0.0000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0061  metallophosphoesterase  27.89 
 
 
284 aa  67.8  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562399  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1296  metallophosphoesterase  27.6 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2303  metallophosphoesterase  28.46 
 
 
224 aa  67.4  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254735  normal  0.040346 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1911  metallophosphoesterase  27.98 
 
 
223 aa  66.6  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000147352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>