44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2137 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2137  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  264  2.9999999999999995e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1781  kinase-like protein  45.11 
 
 		 194 aa  97.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150793  normal  0.517333 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2088  hypothetical protein  34.85 
 
 		 150 aa  88.2  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000337325  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1512  hypothetical protein  35.11 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.140954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5796  putative kinase  29.77 
 
 		 148 aa  80.9  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4050  hypothetical protein  30.47 
 
 		 150 aa  76.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1589  hypothetical protein  30.16 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0106801 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05751  DNA kinase/phosphatase (Eurofung)  32.12 
 
 		 519 aa  60.5  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.396149  normal  0.010581 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2538  kinase-like protein  31.21 
 
 		 335 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5049  hypothetical protein  35.07 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3502  metallophosphoesterase  38.39 
 
 		 834 aa  57.8  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4542  metallophosphoesterase  34.78 
 
 		 859 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1593  metallophosphoesterase  30.63 
 
 		 858 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.97058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1977  metallophosphoesterase  31.53 
 
 		 850 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.350042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1195  metallophosphoesterase  36.04 
 
 		 863 aa  50.4  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827204  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0167  metallophosphoesterase  35.4 
 
 		 852 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.500527 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32308  predicted protein  33.09 
 
 		 207 aa  48.9  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.274895  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3131  metallophosphoesterase  34.82 
 
 		 857 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000324494  hitchhiker  0.000110445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6752  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase(symmetrical)  34.82 
 
 		 847 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2983  metallophosphoesterase  30.52 
 
 		 854 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0942  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  37.84 
 
 		 852 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44960  hypothetical protein  30.53 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5514  metallophosphoesterase  34.48 
 
 		 870 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.425865  normal  0.108613 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14600  predicted kinase  35.57 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0408324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2768  metallophosphoesterase  31.25 
 
 		 870 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1723  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  30.07 
 
 		 853 aa  44.7  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000078095  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0668  hypothetical protein  31.2 
 
 		 544 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.854444 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3321  hypothetical protein  25.6 
 
 		 347 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.630565  normal  0.105532 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3285  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  31.25 
 
 		 847 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153744 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37630  predicted kinase  34.51 
 
 		 877 aa  43.9  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0483  metallophosphoesterase  35.14 
 
 		 830 aa  43.5  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1031  hypothetical protein  29.66 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0138831  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1420  hypothetical protein  31.76 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6097  hypothetical protein  48.94 
 
 		 509 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0080021 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1599  polyA polymerase related protein  31.47 
 
 		 378 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.29317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0792  hypothetical protein  31.97 
 
 		 528 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346746 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1531  hypothetical protein  28.57 
 
 		 163 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.348224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2021  hypothetical protein  26.53 
 
 		 183 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.70012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1180  hypothetical protein  28.38 
 
 		 161 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1313  hypothetical protein  34.71 
 
 		 499 aa  41.6  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355493  normal  0.457249 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0526  Luciferase-like monooxygenase  32.11 
 
 		 484 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3561  hypothetical protein  32.21 
 
 		 185 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  0.0187655 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1844  hypothetical protein  30.33 
 
 		 163 aa  41.2  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000465325  normal  0.0211703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3744  putative protein serine-threonine phosphatase  32.74 
 
 		 852 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614096  normal  0.060115 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>