26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1180 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1180  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  327  6e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1883  hypothetical protein  49.36 
 
 		 163 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3561  hypothetical protein  51.3 
 
 		 185 aa  175  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  0.0187655 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1420  hypothetical protein  51.59 
 
 		 170 aa  171  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7516  hypothetical protein  50.65 
 
 		 181 aa  167  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3180  hypothetical protein  45.22 
 
 		 164 aa  159  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.942907  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1747  hypothetical protein  46.1 
 
 		 177 aa  153  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.497705  normal  0.12531 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1531  hypothetical protein  43.42 
 
 		 163 aa  145  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.348224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2771  hypothetical protein  47.02 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380494 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3271  cell division protein ZipA  44.52 
 
 		 184 aa  134  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1847  cell division protein ZipA  38.85 
 
 		 165 aa  134  5e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.630805  normal  0.844154 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1020  cell division protein ZipA  40.26 
 
 		 188 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.594259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0986  cell division protein ZipA  40.79 
 
 		 172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1008  cell division protein ZipA  40.13 
 
 		 170 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3355  cell division protein ZipA  40.13 
 
 		 172 aa  123  9e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3212  cell division protein ZipA  42.41 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4505  hypothetical protein  47.78 
 
 		 93 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4301  hypothetical protein  31.45 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06028  hypothetical protein  29.14 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5693  hypothetical protein  43.48 
 
 		 112 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201068  normal  0.494471 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0177  hypothetical protein  27.63 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_902  hypothetical protein  26.71 
 
 		 200 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00277515  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4373  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.83 
 
 		 368 aa  49.7  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0861  hypothetical protein  29.79 
 
 		 532 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0914  kinase-like protein  26.17 
 
 		 200 aa  47.4  0.00009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1031  hypothetical protein  24.31 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0138831  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>