27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2771 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2771  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  327  6e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380494 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1847  cell division protein ZipA  56.05 
 
 		 165 aa  182  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.630805  normal  0.844154 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3355  cell division protein ZipA  53.85 
 
 		 172 aa  176  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0986  cell division protein ZipA  53.85 
 
 		 172 aa  174  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1008  cell division protein ZipA  53.55 
 
 		 170 aa  173  7e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1020  cell division protein ZipA  51.59 
 
 		 188 aa  168  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.594259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3271  cell division protein ZipA  48.72 
 
 		 184 aa  161  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3212  cell division protein ZipA  52.7 
 
 		 164 aa  161  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1180  hypothetical protein  47.02 
 
 		 161 aa  144  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3561  hypothetical protein  45.45 
 
 		 185 aa  143  9e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  0.0187655 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1420  hypothetical protein  42.58 
 
 		 170 aa  136  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1883  hypothetical protein  38.16 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3180  hypothetical protein  43.33 
 
 		 164 aa  121  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.942907  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7516  hypothetical protein  37.74 
 
 		 181 aa  117  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1747  hypothetical protein  34.62 
 
 		 177 aa  116  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.497705  normal  0.12531 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1531  hypothetical protein  38.56 
 
 		 163 aa  110  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.348224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4301  hypothetical protein  29.27 
 
 		 169 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4505  hypothetical protein  40 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06028  hypothetical protein  24.32 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0613  adenylate kinase  25.44 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1681  hypothetical protein  25.42 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0177  hypothetical protein  26.49 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3731  hypothetical protein  34.62 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1912  adenylate kinase  26.23 
 
 		 207 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.298172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_902  hypothetical protein  24.03 
 
 		 200 aa  42.4  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00277515  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0270  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  26.92 
 
 		 211 aa  41.2  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0861  hypothetical protein  23.9 
 
 		 532 aa  40.4  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>