24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1847 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1847  cell division protein ZipA  100 
 
 		 165 aa  349  1e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.630805  normal  0.844154 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3212  cell division protein ZipA  63.19 
 
 		 164 aa  228  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2771  hypothetical protein  56.05 
 
 		 158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380494 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0986  cell division protein ZipA  55 
 
 		 172 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1008  cell division protein ZipA  55.26 
 
 		 170 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3355  cell division protein ZipA  54.37 
 
 		 172 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1020  cell division protein ZipA  53.12 
 
 		 188 aa  175  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.594259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3271  cell division protein ZipA  50.63 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3561  hypothetical protein  40.37 
 
 		 185 aa  135  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  0.0187655 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1180  hypothetical protein  38.85 
 
 		 161 aa  134  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1420  hypothetical protein  40.65 
 
 		 170 aa  123  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7516  hypothetical protein  39.35 
 
 		 181 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1747  hypothetical protein  37.34 
 
 		 177 aa  116  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.497705  normal  0.12531 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3180  hypothetical protein  39.51 
 
 		 164 aa  116  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.942907  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1531  hypothetical protein  38.65 
 
 		 163 aa  115  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.348224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1883  hypothetical protein  34.39 
 
 		 163 aa  107  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06028  hypothetical protein  28.66 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3317  aminoglycoside phosphotransferase  28.21 
 
 		 586 aa  50.4  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.479259  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4505  hypothetical protein  36.67 
 
 		 93 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4301  hypothetical protein  23.9 
 
 		 169 aa  48.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0177  hypothetical protein  23.31 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0270  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  27.69 
 
 		 211 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3731  hypothetical protein  23.65 
 
 		 177 aa  42.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0648  adenylate kinase  24.53 
 
 		 190 aa  41.2  0.007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>