22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3355 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3355  cell division protein ZipA  100 
 
 
172 aa  362  2e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0986  cell division protein ZipA  99.42 
 
 
172 aa  357  3e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1008  cell division protein ZipA  98.24 
 
 
170 aa  350  4e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1020  cell division protein ZipA  95.91 
 
 
188 aa  346  9e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.594259  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3271  cell division protein ZipA  63.58 
 
 
184 aa  230  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1847  cell division protein ZipA  54.37 
 
 
165 aa  179  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.630805  normal  0.844154 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2771  hypothetical protein  53.85 
 
 
158 aa  176  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00380494 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3212  cell division protein ZipA  50.63 
 
 
164 aa  169  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3561  hypothetical protein  45.4 
 
 
185 aa  138  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  0.0187655 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1747  hypothetical protein  40.83 
 
 
177 aa  134  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.497705  normal  0.12531 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1420  hypothetical protein  45.45 
 
 
170 aa  132  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1883  hypothetical protein  40.26 
 
 
163 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288724  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1180  hypothetical protein  40.13 
 
 
161 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1531  hypothetical protein  40 
 
 
163 aa  118  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.348224  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7516  hypothetical protein  42.76 
 
 
181 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3180  hypothetical protein  42.31 
 
 
164 aa  114  8.999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.942907  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06028  hypothetical protein  29.14 
 
 
159 aa  60.8  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3317  aminoglycoside phosphotransferase  29.14 
 
 
586 aa  58.5  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.479259  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4301  hypothetical protein  26.79 
 
 
169 aa  57.8  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4505  hypothetical protein  42.53 
 
 
93 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1431  hypothetical protein  28.48 
 
 
527 aa  44.7  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.882787  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4338  hypothetical protein  24.32 
 
 
717 aa  42  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427391  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>