25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4301 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4301  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  353  7.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0177  hypothetical protein  33.73 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4373  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.82 
 
 		 368 aa  95.5  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1180  hypothetical protein  31.45 
 
 		 161 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3561  hypothetical protein  29.56 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  0.0187655 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1883  hypothetical protein  29.7 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1420  hypothetical protein  28.66 
 
 		 170 aa  67  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06028  hypothetical protein  27.04 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3180  hypothetical protein  33.08 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.942907  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2771  hypothetical protein  29.27 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380494 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1531  hypothetical protein  28.57 
 
 		 163 aa  60.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.348224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0986  cell division protein ZipA  26.79 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3271  cell division protein ZipA  27.85 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3355  cell division protein ZipA  26.79 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1008  cell division protein ZipA  26.35 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1020  cell division protein ZipA  26.95 
 
 		 188 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.594259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1206  hypothetical protein  28.57 
 
 		 513 aa  55.1  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128112 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1747  hypothetical protein  25.31 
 
 		 177 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.497705  normal  0.12531 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1847  cell division protein ZipA  23.9 
 
 		 165 aa  48.1  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.630805  normal  0.844154 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7516  hypothetical protein  24.39 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0678  hypothetical protein  25 
 
 		 526 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.986431  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0736  adenylate kinase  28.87 
 
 		 222 aa  43.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2783  hypothetical protein  23.93 
 
 		 523 aa  42  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.633184  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_455  hypothetical protein  24.22 
 
 		 520 aa  41.2  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000133416  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0914  kinase-like protein  24.52 
 
 		 200 aa  40.8  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>