127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0914 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0914  kinase-like protein  100 
 
 
200 aa  410  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_902  hypothetical protein  75.5 
 
 
200 aa  318  3.9999999999999996e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00277515  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1031  hypothetical protein  71.98 
 
 
182 aa  283  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0138831  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_455  hypothetical protein  31.25 
 
 
520 aa  79.3  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000133416  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0514  hypothetical protein  31.71 
 
 
520 aa  77.4  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0345862  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2047  hypothetical protein  32.9 
 
 
520 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00434824  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2828  hypothetical protein  29.76 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2265  hypothetical protein  31.47 
 
 
170 aa  72  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1232  hypothetical protein  29.27 
 
 
525 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.100547 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1681  hypothetical protein  30.94 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0490  hypothetical protein  28.57 
 
 
520 aa  67.8  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.180685  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0976  hypothetical protein  26.71 
 
 
512 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0180634  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1001  hypothetical protein  24.36 
 
 
551 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0358581  hitchhiker  1.18173e-16 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0861  hypothetical protein  27.16 
 
 
532 aa  64.7  0.0000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0912  hypothetical protein  24.7 
 
 
544 aa  64.7  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2628  hypothetical protein  27.78 
 
 
517 aa  63.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0841  hypothetical protein  26.62 
 
 
556 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000255062  decreased coverage  0.0000936176 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1588  aminoglycoside phosphotransferase  30 
 
 
518 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.062948 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1725  hypothetical protein  27.27 
 
 
508 aa  63.9  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2646  uncharacterized protein-like protein  30.67 
 
 
518 aa  63.2  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00596928  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1244  hypothetical protein  26.71 
 
 
522 aa  63.2  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0750  hypothetical protein  24.24 
 
 
520 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000461346  decreased coverage  0.00000000000202029 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1230  hypothetical protein  26.71 
 
 
504 aa  61.6  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.022585  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5417  hypothetical protein  24.34 
 
 
520 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1873  hypothetical protein  27.62 
 
 
521 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.00595e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5125  hypothetical protein  27.56 
 
 
497 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.864315  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0913  hypothetical protein  25.77 
 
 
516 aa  60.1  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62230  hypothetical protein  24.34 
 
 
520 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.051332  normal  0.186531 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0802  hypothetical protein  24.05 
 
 
520 aa  59.3  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0087  seryl-tRNA(Sec) kinase  29.51 
 
 
255 aa  59.3  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1222  hypothetical protein  28.72 
 
 
525 aa  59.3  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484175  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1197  hypothetical protein  23.57 
 
 
530 aa  58.9  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.636152  normal  0.688701 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0379  hypothetical protein  24.03 
 
 
527 aa  58.5  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2392  metallophosphoesterase  34.95 
 
 
852 aa  58.2  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.949066  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1298  hypothetical protein  25.38 
 
 
520 aa  58.5  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1115  hypothetical protein  30.32 
 
 
579 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136038  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2379  hypothetical protein  27.14 
 
 
509 aa  58.2  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0203614  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1206  hypothetical protein  25.97 
 
 
513 aa  57.4  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.128112 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2811  hypothetical protein  30.89 
 
 
533 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00343166  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1531  hypothetical protein  27.85 
 
 
163 aa  57.8  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.348224  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0678  hypothetical protein  22.41 
 
 
526 aa  56.6  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.986431  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4542  metallophosphoesterase  31.58 
 
 
859 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2165  aminoglycoside phosphotransferase  28.24 
 
 
518 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20279  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1431  hypothetical protein  25.64 
 
 
527 aa  55.8  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.882787  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2657  hypothetical protein  24.5 
 
 
519 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000160126  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3292  hypothetical protein  27.56 
 
 
513 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.234842  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0799  chromatin associated protein KTI12  27.64 
 
 
260 aa  54.7  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2983  metallophosphoesterase  39.13 
 
 
854 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1184  chromatin associated protein KTI12  28.69 
 
 
264 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.18154  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4684  hypothetical protein  22.47 
 
 
502 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0278201  hitchhiker  0.000250166 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1593  metallophosphoesterase  28.95 
 
 
858 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.97058  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3131  metallophosphoesterase  32.46 
 
 
857 aa  53.1  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000324494  hitchhiker  0.000110445 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0491  chromatin associated protein KTI12  28.23 
 
 
255 aa  53.5  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3285  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  29.91 
 
 
847 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153744 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1458  hypothetical protein  24.32 
 
 
509 aa  52.8  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0734  chromatin associated protein KTI12  28.46 
 
 
257 aa  52.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.394826 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4308  hypothetical protein  25 
 
 
518 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4682  hypothetical protein  21.91 
 
 
520 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000555746  hitchhiker  0.000000000000343402 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2808  hypothetical protein  26.92 
 
 
513 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4793  hypothetical protein  23.42 
 
 
518 aa  52  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600328  unclonable  0.0000272859 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0934  conserved hypothetical gluconokinase  29.93 
 
 
159 aa  51.6  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000044285  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0634  hypothetical protein  24.4 
 
 
498 aa  51.2  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4548  hypothetical protein  21.35 
 
 
533 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00671326  decreased coverage  0.0000000171948 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42570  hypothetical protein  25.49 
 
 
533 aa  50.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0138648  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4837  gluconate kinase  26.59 
 
 
533 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5514  metallophosphoesterase  30.08 
 
 
870 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.425865  normal  0.108613 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6183  hypothetical protein  25.17 
 
 
514 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814041  normal  0.433204 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3305  hypothetical protein  27.63 
 
 
537 aa  50.1  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2538  kinase-like protein  27.59 
 
 
335 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4014  metallophosphoesterase  29.57 
 
 
864 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.248508 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3456  hypothetical protein  25.97 
 
 
523 aa  50.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0921  metallophosphoesterase  31.75 
 
 
847 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168883  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1406  hypothetical protein  25.15 
 
 
520 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345988  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1723  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  30.77 
 
 
853 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000078095  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2783  hypothetical protein  25.32 
 
 
523 aa  49.7  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.633184  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1782  hypothetical protein  24.54 
 
 
506 aa  49.3  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.632003  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1043  adenylylsulfate kinase  28.93 
 
 
178 aa  49.3  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.727685  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1420  hypothetical protein  25.61 
 
 
170 aa  49.3  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0792  hypothetical protein  27.08 
 
 
528 aa  48.9  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.346746 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8077  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 
526 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0981512  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6171  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 
524 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2768  metallophosphoesterase  26.85 
 
 
870 aa  48.5  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0651  aminoglycoside phosphotransferase  23.43 
 
 
509 aa  48.1  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1369  hypothetical protein  32.08 
 
 
547 aa  48.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1571  hypothetical protein  21.94 
 
 
540 aa  48.1  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1180  hypothetical protein  26.17 
 
 
161 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3180  hypothetical protein  26.4 
 
 
164 aa  47.8  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.942907  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2592  putative phosphatase  24.67 
 
 
447 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.739631  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4416  hypothetical protein  23.78 
 
 
516 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.768574  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4721  hypothetical protein  28.57 
 
 
519 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358451  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4549  hypothetical protein  23.78 
 
 
516 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.954799  normal  0.0134652 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1271  hypothetical protein  25 
 
 
516 aa  46.2  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1977  metallophosphoesterase  28.07 
 
 
850 aa  45.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.350042  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6752  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase(symmetrical)  30.43 
 
 
847 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0248  adenylyl-sulfate kinase  26.92 
 
 
196 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3574  hypothetical protein  24.83 
 
 
504 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.662023 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2376  hypothetical protein  24.73 
 
 
178 aa  45.4  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1195  metallophosphoesterase  29.82 
 
 
863 aa  44.7  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827204  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1349  hypothetical protein  30.39 
 
 
521 aa  44.7  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2021  hypothetical protein  30.11 
 
 
183 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.70012  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>