136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_902 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_902  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  412  1e-114  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00277515  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0914  kinase-like protein  75.5 
 
 		 200 aa  318  3.9999999999999996e-86  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1031  hypothetical protein  76.37 
 
 		 182 aa  297  8e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0138831  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_455  hypothetical protein  31.82 
 
 		 520 aa  77.8  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000133416  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0514  hypothetical protein  31.17 
 
 		 520 aa  76.3  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0345862  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0912  hypothetical protein  29.33 
 
 		 544 aa  72  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2265  hypothetical protein  30.77 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1681  hypothetical protein  30.94 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0490  hypothetical protein  28.57 
 
 		 520 aa  66.6  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.180685  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0913  hypothetical protein  28.48 
 
 		 516 aa  64.3  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2379  hypothetical protein  28.76 
 
 		 509 aa  63.2  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0203614  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0750  hypothetical protein  26.09 
 
 		 520 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000461346  decreased coverage  0.00000000000202029 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0861  hypothetical protein  27.16 
 
 		 532 aa  62.4  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1298  hypothetical protein  26.36 
 
 		 520 aa  62  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1873  hypothetical protein  26.26 
 
 		 521 aa  61.6  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.00595e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1232  hypothetical protein  25.42 
 
 		 525 aa  60.8  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.100547 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0841  hypothetical protein  26.99 
 
 		 556 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000255062  decreased coverage  0.0000936176 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2646  uncharacterized protein-like protein  30.23 
 
 		 518 aa  60.1  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00596928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1588  aminoglycoside phosphotransferase  29.65 
 
 		 518 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.062948 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5417  hypothetical protein  26.9 
 
 		 520 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1244  hypothetical protein  26.24 
 
 		 522 aa  58.5  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2047  hypothetical protein  28.57 
 
 		 520 aa  58.2  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00434824  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2811  hypothetical protein  29.84 
 
 		 533 aa  58.2  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00343166  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0379  hypothetical protein  23.78 
 
 		 527 aa  58.2  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62230  hypothetical protein  25.73 
 
 		 520 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.051332  normal  0.186531 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1431  hypothetical protein  28.21 
 
 		 527 aa  57  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.882787  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0976  hypothetical protein  27.15 
 
 		 512 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0180634  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2808  hypothetical protein  27.56 
 
 		 513 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1001  hypothetical protein  25.45 
 
 		 551 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0358581  hitchhiker  1.18173e-16 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3285  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  27.61 
 
 		 847 aa  55.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153744 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3292  hypothetical protein  26.92 
 
 		 513 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.234842  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0802  hypothetical protein  23.95 
 
 		 520 aa  55.8  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4721  hypothetical protein  30.54 
 
 		 519 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358451  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1531  hypothetical protein  27.45 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.348224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1115  hypothetical protein  25 
 
 		 579 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1369  hypothetical protein  35.92 
 
 		 547 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2376  hypothetical protein  27.88 
 
 		 178 aa  54.3  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1725  hypothetical protein  26.95 
 
 		 508 aa  53.9  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1197  hypothetical protein  23.02 
 
 		 530 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.636152  normal  0.688701 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1782  hypothetical protein  25.77 
 
 		 506 aa  53.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.632003  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2783  hypothetical protein  26.62 
 
 		 523 aa  53.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.633184  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2828  hypothetical protein  25.15 
 
 		 179 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1222  hypothetical protein  28.76 
 
 		 525 aa  52.8  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484175  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2392  metallophosphoesterase  32.04 
 
 		 852 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.949066  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4684  hypothetical protein  23.5 
 
 		 502 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0278201  hitchhiker  0.000250166 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1180  hypothetical protein  26.71 
 
 		 161 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1230  hypothetical protein  25.85 
 
 		 504 aa  52.8  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.022585  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42570  hypothetical protein  25.91 
 
 		 533 aa  51.6  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0138648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5514  metallophosphoesterase  25.82 
 
 		 870 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.425865  normal  0.108613 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4548  hypothetical protein  23.5 
 
 		 533 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00671326  decreased coverage  0.0000000171948 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0491  chromatin associated protein KTI12  29.57 
 
 		 255 aa  50.8  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4682  hypothetical protein  22.5 
 
 		 520 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000555746  hitchhiker  0.000000000000343402 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1349  hypothetical protein  31.97 
 
 		 521 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0678  hypothetical protein  21.39 
 
 		 526 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.986431  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3456  hypothetical protein  25.97 
 
 		 523 aa  50.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1571  hypothetical protein  22.22 
 
 		 540 aa  50.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3574  hypothetical protein  27.52 
 
 		 504 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.662023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4837  gluconate kinase  24.85 
 
 		 533 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2657  hypothetical protein  27.56 
 
 		 519 aa  49.7  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000160126  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1190  hypothetical protein  22.88 
 
 		 518 aa  49.7  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1184  chromatin associated protein KTI12  30.11 
 
 		 264 aa  49.3  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.18154  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3180  hypothetical protein  28 
 
 		 164 aa  49.3  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.942907  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1206  hypothetical protein  24.68 
 
 		 513 aa  48.9  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128112 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0799  chromatin associated protein KTI12  29.47 
 
 		 260 aa  48.9  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2375  adenylylsulfate kinase  30.07 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755803  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2912  adenylylsulfate kinase  30.07 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137451  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2768  metallophosphoesterase  31.3 
 
 		 870 aa  48.9  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2676  adenylylsulfate kinase  30.07 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.607978  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2733  adenylylsulfate kinase  30.07 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.57754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1690  adenylylsulfate kinase  30.07 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.228231  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2628  hypothetical protein  24.1 
 
 		 517 aa  48.5  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1458  hypothetical protein  27.86 
 
 		 509 aa  48.5  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1593  metallophosphoesterase  28.7 
 
 		 858 aa  48.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.97058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1723  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  27.74 
 
 		 853 aa  48.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000078095  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2983  metallophosphoesterase  36.36 
 
 		 854 aa  48.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6183  hypothetical protein  24.5 
 
 		 514 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814041  normal  0.433204 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0637  adenylylsulfate kinase  30.22 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0921  metallophosphoesterase  28 
 
 		 847 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2799  adenylylsulfate kinase  30.22 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4793  hypothetical protein  23.53 
 
 		 518 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600328  unclonable  0.0000272859 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1952  adenylylsulfate kinase  27.48 
 
 		 497 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3131  metallophosphoesterase  30.51 
 
 		 857 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000324494  hitchhiker  0.000110445 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0936  kinase-like protein  26.76 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0087  seryl-tRNA(Sec) kinase  29.79 
 
 		 255 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0934  conserved hypothetical gluconokinase  28.57 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000044285  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6752  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase(symmetrical)  29.82 
 
 		 847 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13151  hypothetical protein  22.35 
 
 		 556 aa  46.2  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.309836 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0734  chromatin associated protein KTI12  29.79 
 
 		 257 aa  45.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.394826 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1420  hypothetical protein  24.48 
 
 		 170 aa  46.2  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4014  metallophosphoesterase  28.15 
 
 		 864 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.248508 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4542  metallophosphoesterase  29.06 
 
 		 859 aa  45.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4584  hypothetical protein  27.87 
 
 		 174 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.223628 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0792  hypothetical protein  31.16 
 
 		 528 aa  45.4  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346746 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2392  kinase-like protein  27.33 
 
 		 505 aa  45.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42432  normal  0.238047 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1313  hypothetical protein  29.2 
 
 		 499 aa  45.1  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355493  normal  0.457249 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0628  hypothetical protein  27.87 
 
 		 174 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2165  aminoglycoside phosphotransferase  27.22 
 
 		 518 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2332  hypothetical protein  23.93 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.440053  normal  0.950066 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5732  hypothetical protein  27.13 
 
 		 170 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4308  hypothetical protein  25.33 
 
 		 518 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>