111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2265 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2265  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  344  4e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1681  hypothetical protein  35.51 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1873  hypothetical protein  30.94 
 
 		 521 aa  77  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.00595e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1725  hypothetical protein  36.11 
 
 		 508 aa  74.3  0.0000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1197  hypothetical protein  33.1 
 
 		 530 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.636152  normal  0.688701 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0914  kinase-like protein  31.47 
 
 		 200 aa  72  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1244  hypothetical protein  33.33 
 
 		 522 aa  70.9  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0934  conserved hypothetical gluconokinase  35.76 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000044285  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0861  hypothetical protein  30.56 
 
 		 532 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_902  hypothetical protein  30.77 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00277515  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1232  hypothetical protein  29.14 
 
 		 525 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.100547 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2047  hypothetical protein  27.93 
 
 		 520 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00434824  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1431  hypothetical protein  30.72 
 
 		 527 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.882787  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0802  hypothetical protein  32.26 
 
 		 520 aa  67.8  0.00000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0634  hypothetical protein  32.08 
 
 		 498 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_002936  DET1031  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0138831  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1195  hypothetical protein  31.76 
 
 		 482 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1571  hypothetical protein  30.81 
 
 		 540 aa  65.9  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3574  hypothetical protein  31.79 
 
 		 504 aa  65.5  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.662023 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1298  hypothetical protein  31.78 
 
 		 520 aa  65.1  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2783  hypothetical protein  33.12 
 
 		 523 aa  64.7  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.633184  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3456  hypothetical protein  33.12 
 
 		 523 aa  64.3  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2811  hypothetical protein  34.96 
 
 		 533 aa  63.9  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00343166  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0912  hypothetical protein  31.82 
 
 		 544 aa  63.5  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2657  hypothetical protein  34.13 
 
 		 519 aa  63.5  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000160126  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3522  adenylylsulfate kinase  34.11 
 
 		 508 aa  62.4  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0913  hypothetical protein  31.39 
 
 		 516 aa  62.4  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0651  aminoglycoside phosphotransferase  30.07 
 
 		 509 aa  62.4  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0470  hypothetical protein  32.48 
 
 		 505 aa  62  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2392  kinase-like protein  32.14 
 
 		 505 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42432  normal  0.238047 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0379  hypothetical protein  31.21 
 
 		 527 aa  61.2  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0490  hypothetical protein  25.68 
 
 		 520 aa  60.8  0.000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.180685  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0514  hypothetical protein  25.14 
 
 		 520 aa  59.3  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0345862  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1190  hypothetical protein  33.99 
 
 		 518 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5918  hypothetical protein  30 
 
 		 536 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223446  normal  0.571754 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3292  hypothetical protein  29.41 
 
 		 513 aa  59.7  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.234842  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2122  hypothetical protein  33.58 
 
 		 505 aa  58.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_455  hypothetical protein  25.14 
 
 		 520 aa  58.5  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000133416  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2808  hypothetical protein  29.41 
 
 		 513 aa  58.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2628  hypothetical protein  30.56 
 
 		 517 aa  57.8  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1115  hypothetical protein  29.14 
 
 		 579 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2056  hypothetical protein  34.85 
 
 		 510 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2165  aminoglycoside phosphotransferase  31.97 
 
 		 518 aa  54.7  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1868  hypothetical protein  31.58 
 
 		 549 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0299085  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2379  hypothetical protein  30.5 
 
 		 509 aa  54.7  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0203614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4837  gluconate kinase  32.33 
 
 		 533 aa  54.7  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2646  uncharacterized protein-like protein  31.06 
 
 		 518 aa  54.3  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00596928  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0492  hypothetical protein  30.51 
 
 		 535 aa  54.3  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2028  hypothetical protein  31.67 
 
 		 600 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1052  hypothetical protein  31.67 
 
 		 600 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1338  hypothetical protein  31.67 
 
 		 600 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3211  hypothetical protein  31.67 
 
 		 603 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3085  hypothetical protein  31.67 
 
 		 603 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2318  hypothetical protein  31.67 
 
 		 600 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469586  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1001  hypothetical protein  27.63 
 
 		 551 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0358581  hitchhiker  1.18173e-16 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0491  chromatin associated protein KTI12  34.26 
 
 		 255 aa  53.9  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1313  hypothetical protein  31.16 
 
 		 499 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355493  normal  0.457249 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2376  hypothetical protein  25.29 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1424  hypothetical protein  31.67 
 
 		 569 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1206  hypothetical protein  31.39 
 
 		 513 aa  53.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128112 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1915  hypothetical protein  29.91 
 
 		 526 aa  52.4  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294472  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13151  hypothetical protein  29.76 
 
 		 556 aa  52.4  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.309836 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1230  hypothetical protein  28.08 
 
 		 504 aa  50.8  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.022585  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4721  hypothetical protein  32.33 
 
 		 519 aa  50.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358451  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1349  hypothetical protein  34.75 
 
 		 521 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0488  kinase-like protein  28.21 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6183  hypothetical protein  27.15 
 
 		 514 aa  50.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814041  normal  0.433204 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42570  hypothetical protein  28.81 
 
 		 533 aa  50.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0138648  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0678  hypothetical protein  27.92 
 
 		 526 aa  49.7  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.986431  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1222  hypothetical protein  27.33 
 
 		 525 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484175  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2066  hypothetical protein  31.97 
 
 		 514 aa  48.5  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.695789 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1369  hypothetical protein  32.54 
 
 		 547 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5228  hypothetical protein  30.48 
 
 		 137 aa  48.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.557629  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1588  aminoglycoside phosphotransferase  34.15 
 
 		 518 aa  47.8  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.062948 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5125  hypothetical protein  29.32 
 
 		 497 aa  47.4  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.864315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2780  hypothetical protein  29.11 
 
 		 523 aa  47.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4308  hypothetical protein  28.36 
 
 		 518 aa  47  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1271  hypothetical protein  30.56 
 
 		 516 aa  47.4  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2221  hypothetical protein  26.67 
 
 		 520 aa  47  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4101  hypothetical protein  30 
 
 		 529 aa  46.2  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1184  chromatin associated protein KTI12  32.41 
 
 		 264 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.18154  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05751  DNA kinase/phosphatase (Eurofung)  27.19 
 
 		 519 aa  45.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.396149  normal  0.010581 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0841  hypothetical protein  25.44 
 
 		 556 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000255062  decreased coverage  0.0000936176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0263  hypothetical protein  26.92 
 
 		 490 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.168433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0734  chromatin associated protein KTI12  31.48 
 
 		 257 aa  45.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.394826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5417  hypothetical protein  26.92 
 
 		 520 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62230  hypothetical protein  26.92 
 
 		 520 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.051332  normal  0.186531 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4793  hypothetical protein  26.19 
 
 		 518 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600328  unclonable  0.0000272859 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5756  hypothetical protein  26.86 
 
 		 518 aa  44.7  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0087  seryl-tRNA(Sec) kinase  33.33 
 
 		 255 aa  44.3  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0976  hypothetical protein  28.7 
 
 		 512 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0180634  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1458  hypothetical protein  27.61 
 
 		 509 aa  44.3  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1782  hypothetical protein  27.39 
 
 		 506 aa  43.9  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.632003  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0750  hypothetical protein  26.45 
 
 		 520 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000461346  decreased coverage  0.00000000000202029 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8077  aminoglycoside phosphotransferase  29.29 
 
 		 526 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0981512  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1406  hypothetical protein  28.93 
 
 		 520 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345988  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4684  hypothetical protein  27.64 
 
 		 502 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0278201  hitchhiker  0.000250166 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6171  aminoglycoside phosphotransferase  28.47 
 
 		 524 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0167  metallophosphoesterase  34.51 
 
 		 852 aa  42.4  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.500527 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0792  hypothetical protein  27.78 
 
 		 528 aa  42.4  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346746 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>