126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1915 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1915  hypothetical protein  100 
 
 		 526 aa  1067    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294472  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1349  hypothetical protein  60.31 
 
 		 521 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1369  hypothetical protein  58.22 
 
 		 547 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4047  hypothetical protein  57.29 
 
 		 526 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.237674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4721  hypothetical protein  55.62 
 
 		 519 aa  535  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358451  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5756  hypothetical protein  52.66 
 
 		 518 aa  484  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0668  hypothetical protein  43.93 
 
 		 544 aa  385  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.854444 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0661  aminoglycoside phosphotransferase  44.03 
 
 		 515 aa  365  1e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0314986 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2221  hypothetical protein  42.6 
 
 		 520 aa  355  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8077  aminoglycoside phosphotransferase  41.92 
 
 		 526 aa  343  5e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0981512  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6171  aminoglycoside phosphotransferase  42.33 
 
 		 524 aa  340  4e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2613  hypothetical protein  41 
 
 		 512 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.209456  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2122  hypothetical protein  41.27 
 
 		 505 aa  321  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0470  hypothetical protein  41.07 
 
 		 505 aa  319  7e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1313  hypothetical protein  38.75 
 
 		 499 aa  308  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355493  normal  0.457249 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2603  hypothetical protein  39.39 
 
 		 542 aa  298  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6097  hypothetical protein  41.19 
 
 		 509 aa  297  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0080021 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0792  hypothetical protein  40.61 
 
 		 528 aa  296  7e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346746 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2392  kinase-like protein  40.9 
 
 		 505 aa  295  1e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42432  normal  0.238047 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3997  aminoglycoside phosphotransferase  39.66 
 
 		 489 aa  278  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.219665  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0379  hypothetical protein  35.82 
 
 		 527 aa  272  9e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0678  hypothetical protein  35.94 
 
 		 526 aa  259  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.986431  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4549  hypothetical protein  34.25 
 
 		 516 aa  239  8e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.954799  normal  0.0134652 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4416  hypothetical protein  34.25 
 
 		 516 aa  239  8e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.768574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1782  hypothetical protein  36.03 
 
 		 506 aa  236  7e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.632003  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1406  hypothetical protein  36.11 
 
 		 520 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345988  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1206  hypothetical protein  34.97 
 
 		 513 aa  233  7.000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128112 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1230  hypothetical protein  34.58 
 
 		 504 aa  232  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.022585  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0912  hypothetical protein  33 
 
 		 544 aa  231  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1298  hypothetical protein  37.1 
 
 		 520 aa  230  4e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2780  hypothetical protein  34.26 
 
 		 523 aa  228  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0802  hypothetical protein  32.47 
 
 		 520 aa  224  4e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1197  hypothetical protein  31.74 
 
 		 530 aa  224  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.636152  normal  0.688701 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5125  hypothetical protein  34.77 
 
 		 497 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.864315  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2379  hypothetical protein  34.77 
 
 		 509 aa  221  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0203614  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2056  hypothetical protein  31.02 
 
 		 510 aa  221  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0913  hypothetical protein  33.05 
 
 		 516 aa  220  6e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3292  hypothetical protein  31.33 
 
 		 513 aa  217  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.234842  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1725  hypothetical protein  34.43 
 
 		 508 aa  216  7e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0861  hypothetical protein  33.06 
 
 		 532 aa  216  8e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0841  hypothetical protein  32.97 
 
 		 556 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000255062  decreased coverage  0.0000936176 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42570  hypothetical protein  32.46 
 
 		 533 aa  215  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0138648  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2808  hypothetical protein  31.33 
 
 		 513 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4548  hypothetical protein  30.98 
 
 		 533 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00671326  decreased coverage  0.0000000171948 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3574  hypothetical protein  30.83 
 
 		 504 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.662023 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4684  hypothetical protein  30.77 
 
 		 502 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0278201  hitchhiker  0.000250166 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62230  hypothetical protein  31.69 
 
 		 520 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.051332  normal  0.186531 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4682  hypothetical protein  31.62 
 
 		 520 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000555746  hitchhiker  0.000000000000343402 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5417  hypothetical protein  31.69 
 
 		 520 aa  212  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0750  hypothetical protein  31.05 
 
 		 520 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000461346  decreased coverage  0.00000000000202029 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0976  hypothetical protein  32.33 
 
 		 512 aa  209  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0180634  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2066  hypothetical protein  34.6 
 
 		 514 aa  207  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.695789 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1271  hypothetical protein  34.19 
 
 		 516 aa  204  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1244  hypothetical protein  30.43 
 
 		 522 aa  204  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3522  adenylylsulfate kinase  30.28 
 
 		 508 aa  204  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1001  hypothetical protein  30.98 
 
 		 551 aa  203  7e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0358581  hitchhiker  1.18173e-16 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0634  hypothetical protein  33.92 
 
 		 498 aa  201  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1868  hypothetical protein  33.89 
 
 		 549 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0299085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1571  hypothetical protein  30.77 
 
 		 540 aa  196  6e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1190  hypothetical protein  31.15 
 
 		 518 aa  196  7e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1458  hypothetical protein  33.75 
 
 		 509 aa  196  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1195  hypothetical protein  35.55 
 
 		 482 aa  195  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4793  hypothetical protein  31.38 
 
 		 518 aa  192  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600328  unclonable  0.0000272859 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3305  hypothetical protein  31.32 
 
 		 537 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4308  hypothetical protein  30.75 
 
 		 518 aa  189  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0492  hypothetical protein  32.34 
 
 		 535 aa  188  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0651  aminoglycoside phosphotransferase  30.93 
 
 		 509 aa  187  6e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3211  hypothetical protein  35.35 
 
 		 603 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2058  hypothetical protein  34.91 
 
 		 447 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.614847  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0514  hypothetical protein  29.66 
 
 		 520 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0345862  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0490  hypothetical protein  29.44 
 
 		 520 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.180685  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_455  hypothetical protein  28.99 
 
 		 520 aa  184  3e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000133416  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1424  hypothetical protein  34.95 
 
 		 569 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3085  hypothetical protein  34.95 
 
 		 603 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2028  hypothetical protein  34.72 
 
 		 600 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1052  hypothetical protein  34.72 
 
 		 600 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1338  hypothetical protein  34.72 
 
 		 600 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2318  hypothetical protein  34.72 
 
 		 600 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469586  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2628  hypothetical protein  32.2 
 
 		 517 aa  180  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5918  hypothetical protein  34.43 
 
 		 536 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223446  normal  0.571754 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1115  hypothetical protein  31.97 
 
 		 579 aa  178  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2984  hypothetical protein  36.54 
 
 		 345 aa  176  9e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.954869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2047  hypothetical protein  29.72 
 
 		 520 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00434824  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3456  hypothetical protein  31.79 
 
 		 523 aa  172  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2783  hypothetical protein  31.22 
 
 		 523 aa  166  9e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.633184  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2646  uncharacterized protein-like protein  31.9 
 
 		 518 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00596928  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2165  aminoglycoside phosphotransferase  31.7 
 
 		 518 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6183  hypothetical protein  33.78 
 
 		 514 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814041  normal  0.433204 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1232  hypothetical protein  29.26 
 
 		 525 aa  163  7e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.100547 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46200  hypothetical protein  37.25 
 
 		 336 aa  159  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.817829  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1873  hypothetical protein  28.93 
 
 		 521 aa  158  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.00595e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2314  hypothetical protein  34.31 
 
 		 613 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0148  hypothetical protein  29.89 
 
 		 514 aa  155  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.79926 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1588  aminoglycoside phosphotransferase  32.36 
 
 		 518 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.062948 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2657  hypothetical protein  29.65 
 
 		 519 aa  154  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000160126  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13151  hypothetical protein  26.43 
 
 		 556 aa  151  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.309836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4837  gluconate kinase  27.31 
 
 		 533 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6932  hypothetical protein  29.01 
 
 		 523 aa  141  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1431  hypothetical protein  27.59 
 
 		 527 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.882787  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1222  hypothetical protein  28.66 
 
 		 525 aa  139  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>