142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1431 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1431  hypothetical protein  100 
 
 		 527 aa  1077    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.882787  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1232  hypothetical protein  64.19 
 
 		 525 aa  674    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.100547 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2047  hypothetical protein  52.87 
 
 		 520 aa  558  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00434824  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2646  uncharacterized protein-like protein  51.43 
 
 		 518 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00596928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1588  aminoglycoside phosphotransferase  51.24 
 
 		 518 aa  514  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.062948 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2657  hypothetical protein  50.1 
 
 		 519 aa  496  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000160126  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2628  hypothetical protein  47.97 
 
 		 517 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0514  hypothetical protein  39.84 
 
 		 520 aa  383  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0345862  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1873  hypothetical protein  41.39 
 
 		 521 aa  382  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.00595e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_455  hypothetical protein  39.65 
 
 		 520 aa  382  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000133416  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0490  hypothetical protein  39.65 
 
 		 520 aa  382  1e-105  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.180685  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2780  hypothetical protein  35.06 
 
 		 523 aa  316  7e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2056  hypothetical protein  34.39 
 
 		 510 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1001  hypothetical protein  35.77 
 
 		 551 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0358581  hitchhiker  1.18173e-16 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3574  hypothetical protein  34.19 
 
 		 504 aa  300  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.662023 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4101  hypothetical protein  37.91 
 
 		 529 aa  299  7e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0750  hypothetical protein  35.96 
 
 		 520 aa  299  7e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000461346  decreased coverage  0.00000000000202029 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1406  hypothetical protein  38.12 
 
 		 520 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345988  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1197  hypothetical protein  34.19 
 
 		 530 aa  298  2e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.636152  normal  0.688701 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3522  adenylylsulfate kinase  33.53 
 
 		 508 aa  296  6e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0379  hypothetical protein  34.61 
 
 		 527 aa  295  1e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2165  aminoglycoside phosphotransferase  39.14 
 
 		 518 aa  292  8e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20279  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0976  hypothetical protein  35.86 
 
 		 512 aa  292  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0180634  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3292  hypothetical protein  33.07 
 
 		 513 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.234842  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2808  hypothetical protein  33.27 
 
 		 513 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0841  hypothetical protein  35.83 
 
 		 556 aa  291  3e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000255062  decreased coverage  0.0000936176 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4682  hypothetical protein  34.87 
 
 		 520 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000555746  hitchhiker  0.000000000000343402 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4548  hypothetical protein  36.25 
 
 		 533 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00671326  decreased coverage  0.0000000171948 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62230  hypothetical protein  34.29 
 
 		 520 aa  289  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.051332  normal  0.186531 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4793  hypothetical protein  36.53 
 
 		 518 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600328  unclonable  0.0000272859 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1190  hypothetical protein  34.71 
 
 		 518 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5417  hypothetical protein  34.3 
 
 		 520 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4684  hypothetical protein  36.67 
 
 		 502 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0278201  hitchhiker  0.000250166 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4308  hypothetical protein  34.74 
 
 		 518 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6932  hypothetical protein  39.54 
 
 		 523 aa  276  7e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42570  hypothetical protein  34.95 
 
 		 533 aa  276  8e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0138648  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0802  hypothetical protein  35.5 
 
 		 520 aa  276  8e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1271  hypothetical protein  37.29 
 
 		 516 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1725  hypothetical protein  34.18 
 
 		 508 aa  274  3e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1206  hypothetical protein  35.39 
 
 		 513 aa  273  4.0000000000000004e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128112 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1222  hypothetical protein  35.87 
 
 		 525 aa  272  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484175  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0678  hypothetical protein  33.27 
 
 		 526 aa  271  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.986431  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1571  hypothetical protein  33.14 
 
 		 540 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0913  hypothetical protein  34.55 
 
 		 516 aa  270  7e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0148  hypothetical protein  34.44 
 
 		 514 aa  268  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.79926 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1782  hypothetical protein  36.84 
 
 		 506 aa  268  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.632003  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0492  hypothetical protein  36.54 
 
 		 535 aa  265  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1458  hypothetical protein  34.61 
 
 		 509 aa  263  6.999999999999999e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0861  hypothetical protein  33.14 
 
 		 532 aa  261  2e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0912  hypothetical protein  33.91 
 
 		 544 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2379  hypothetical protein  34.01 
 
 		 509 aa  259  6e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0203614  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4837  gluconate kinase  36.86 
 
 		 533 aa  246  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5125  hypothetical protein  32.99 
 
 		 497 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.864315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1244  hypothetical protein  30.68 
 
 		 522 aa  238  2e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2257  hypothetical protein  32.15 
 
 		 584 aa  235  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  hitchhiker  0.00613294 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0651  aminoglycoside phosphotransferase  36.29 
 
 		 509 aa  235  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13151  hypothetical protein  31.09 
 
 		 556 aa  235  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.309836 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1195  hypothetical protein  34.06 
 
 		 482 aa  233  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3456  hypothetical protein  33.54 
 
 		 523 aa  231  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0423  conserved hypothetical gluconokinase  39.24 
 
 		 325 aa  231  2e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3305  hypothetical protein  31.76 
 
 		 537 aa  228  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2811  hypothetical protein  36.04 
 
 		 533 aa  227  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00343166  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2783  hypothetical protein  32.86 
 
 		 523 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.633184  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6936  hypothetical protein  37.95 
 
 		 494 aa  215  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441597  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4063  hypothetical protein  35.68 
 
 		 575 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0634  hypothetical protein  33.54 
 
 		 498 aa  213  4.9999999999999996e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1230  hypothetical protein  31.71 
 
 		 504 aa  213  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.022585  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1298  hypothetical protein  29.82 
 
 		 520 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1115  hypothetical protein  31.98 
 
 		 579 aa  211  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0263  hypothetical protein  33.33 
 
 		 490 aa  209  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.168433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5918  hypothetical protein  32.48 
 
 		 536 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.223446  normal  0.571754 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2066  hypothetical protein  33.05 
 
 		 514 aa  206  7e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.695789 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1868  hypothetical protein  32.05 
 
 		 549 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0299085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1074  hypothetical protein  32.68 
 
 		 523 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1090  hypothetical protein  32.68 
 
 		 523 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142592  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1101  hypothetical protein  32.68 
 
 		 523 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0319349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12036  hypothetical protein  33.99 
 
 		 498 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1384  hypothetical protein  30.24 
 
 		 490 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.112089  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0792  hypothetical protein  32 
 
 		 528 aa  196  9e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.346746 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4549  hypothetical protein  30.51 
 
 		 516 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.954799  normal  0.0134652 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4416  hypothetical protein  30.51 
 
 		 516 aa  192  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.768574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8077  aminoglycoside phosphotransferase  31.63 
 
 		 526 aa  189  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0981512  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3211  hypothetical protein  33.18 
 
 		 603 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6171  aminoglycoside phosphotransferase  31.42 
 
 		 524 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2603  hypothetical protein  30.59 
 
 		 542 aa  182  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.28783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1424  hypothetical protein  32.2 
 
 		 569 aa  181  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0668  hypothetical protein  30.51 
 
 		 544 aa  180  5.999999999999999e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.854444 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3085  hypothetical protein  33.41 
 
 		 603 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2028  hypothetical protein  33.18 
 
 		 600 aa  179  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1052  hypothetical protein  33.18 
 
 		 600 aa  179  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1338  hypothetical protein  33.18 
 
 		 600 aa  179  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2318  hypothetical protein  33.18 
 
 		 600 aa  179  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.469586  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6183  hypothetical protein  31.23 
 
 		 514 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.814041  normal  0.433204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1970  hypothetical protein  32.21 
 
 		 529 aa  176  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.971424  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2613  hypothetical protein  30.6 
 
 		 512 aa  170  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.209456  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0917  hypothetical protein  34.88 
 
 		 358 aa  169  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1313  hypothetical protein  31.77 
 
 		 499 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355493  normal  0.457249 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2314  hypothetical protein  31.91 
 
 		 613 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5756  hypothetical protein  29.76 
 
 		 518 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1349  hypothetical protein  31.79 
 
 		 521 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>