133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4837 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4837  gluconate kinase  100 
 
 
533 aa  1070    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2811  hypothetical protein  62.5 
 
 
533 aa  498  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00343166  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6932  hypothetical protein  51.25 
 
 
523 aa  440  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2257  hypothetical protein  46.52 
 
 
584 aa  400  9.999999999999999e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197929  hitchhiker  0.00613294 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1074  hypothetical protein  47.71 
 
 
523 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1090  hypothetical protein  47.71 
 
 
523 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142592  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1101  hypothetical protein  47.71 
 
 
523 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0319349  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6936  hypothetical protein  48.64 
 
 
494 aa  363  4e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441597  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1384  hypothetical protein  46.42 
 
 
490 aa  359  5e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.112089  normal  0.696176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0263  hypothetical protein  45.19 
 
 
490 aa  355  2e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.168433  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4063  hypothetical protein  42.41 
 
 
575 aa  353  4e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12036  hypothetical protein  44.3 
 
 
498 aa  348  1e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1970  hypothetical protein  46.84 
 
 
529 aa  345  8.999999999999999e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.971424  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3252  hypothetical protein  45.42 
 
 
534 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2657  hypothetical protein  34.95 
 
 
519 aa  259  6e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000160126  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2047  hypothetical protein  32.77 
 
 
520 aa  258  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00434824  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3574  hypothetical protein  31.99 
 
 
504 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.662023 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3522  adenylylsulfate kinase  32.74 
 
 
508 aa  248  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2808  hypothetical protein  30.08 
 
 
513 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3292  hypothetical protein  29.88 
 
 
513 aa  247  4e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.234842  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2056  hypothetical protein  31.77 
 
 
510 aa  246  6e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1431  hypothetical protein  36.86 
 
 
527 aa  246  8e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.882787  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4101  hypothetical protein  35.76 
 
 
529 aa  246  9e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1232  hypothetical protein  34.39 
 
 
525 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.100547 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1222  hypothetical protein  34.9 
 
 
525 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484175  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1588  aminoglycoside phosphotransferase  35.71 
 
 
518 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.062948 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0490  hypothetical protein  30.64 
 
 
520 aa  240  5.999999999999999e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.180685  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1873  hypothetical protein  36.34 
 
 
521 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.00595e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_455  hypothetical protein  31.63 
 
 
520 aa  236  8e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000133416  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0514  hypothetical protein  30.62 
 
 
520 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0345862  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2165  aminoglycoside phosphotransferase  37.17 
 
 
518 aa  235  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.20279  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2628  hypothetical protein  34.59 
 
 
517 aa  233  5e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2646  uncharacterized protein-like protein  35.13 
 
 
518 aa  232  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00596928  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0678  hypothetical protein  32.25 
 
 
526 aa  226  8e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.986431  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62230  hypothetical protein  33.48 
 
 
520 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.051332  normal  0.186531 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1001  hypothetical protein  32.71 
 
 
551 aa  224  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0358581  hitchhiker  1.18173e-16 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5417  hypothetical protein  33.79 
 
 
520 aa  224  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2780  hypothetical protein  30.9 
 
 
523 aa  224  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0379  hypothetical protein  30.78 
 
 
527 aa  223  9e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0976  hypothetical protein  32.22 
 
 
512 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0180634  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4308  hypothetical protein  33.19 
 
 
518 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0750  hypothetical protein  33.47 
 
 
520 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000461346  decreased coverage  0.00000000000202029 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4684  hypothetical protein  32.76 
 
 
502 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0278201  hitchhiker  0.000250166 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1206  hypothetical protein  34.05 
 
 
513 aa  218  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.128112 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2379  hypothetical protein  35.76 
 
 
509 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0203614  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4793  hypothetical protein  31.95 
 
 
518 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600328  unclonable  0.0000272859 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4682  hypothetical protein  32.54 
 
 
520 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000555746  hitchhiker  0.000000000000343402 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4548  hypothetical protein  31.82 
 
 
533 aa  213  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00671326  decreased coverage  0.0000000171948 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42570  hypothetical protein  33.62 
 
 
533 aa  209  8e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0138648  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0802  hypothetical protein  33.61 
 
 
520 aa  209  9e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1458  hypothetical protein  33.47 
 
 
509 aa  209  1e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0841  hypothetical protein  30.98 
 
 
556 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000255062  decreased coverage  0.0000936176 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1190  hypothetical protein  30.94 
 
 
518 aa  207  4e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0634  hypothetical protein  34.43 
 
 
498 aa  206  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0913  hypothetical protein  30.04 
 
 
516 aa  204  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1195  hypothetical protein  34.38 
 
 
482 aa  204  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1244  hypothetical protein  30.62 
 
 
522 aa  203  7e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1725  hypothetical protein  33.55 
 
 
508 aa  202  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1298  hypothetical protein  31.17 
 
 
520 aa  201  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0148  hypothetical protein  31.4 
 
 
514 aa  201  3.9999999999999996e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.79926 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0492  hypothetical protein  33.97 
 
 
535 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1197  hypothetical protein  27.78 
 
 
530 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.636152  normal  0.688701 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1406  hypothetical protein  35.49 
 
 
520 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.345988  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1571  hypothetical protein  30.3 
 
 
540 aa  193  5e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0912  hypothetical protein  33.19 
 
 
544 aa  191  4e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0651  aminoglycoside phosphotransferase  31.63 
 
 
509 aa  188  3e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2066  hypothetical protein  32.49 
 
 
514 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.695789 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5125  hypothetical protein  32.1 
 
 
497 aa  183  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.864315  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1230  hypothetical protein  31.65 
 
 
504 aa  183  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.022585  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2783  hypothetical protein  33.12 
 
 
523 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.633184  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1782  hypothetical protein  31.32 
 
 
506 aa  180  7e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.632003  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1868  hypothetical protein  34.24 
 
 
549 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0299085  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3456  hypothetical protein  32.83 
 
 
523 aa  178  2e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2122  hypothetical protein  34.24 
 
 
505 aa  176  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6171  aminoglycoside phosphotransferase  33.91 
 
 
524 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0470  hypothetical protein  34.03 
 
 
505 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8077  aminoglycoside phosphotransferase  33.84 
 
 
526 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0981512  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3305  hypothetical protein  31.89 
 
 
537 aa  171  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1271  hypothetical protein  31.07 
 
 
516 aa  169  8e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0792  hypothetical protein  30.8 
 
 
528 aa  169  8e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.346746 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0861  hypothetical protein  29.23 
 
 
532 aa  168  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13151  hypothetical protein  29.76 
 
 
556 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.309836 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1313  hypothetical protein  31.13 
 
 
499 aa  167  4e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355493  normal  0.457249 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0917  hypothetical protein  38.22 
 
 
358 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2392  kinase-like protein  32.78 
 
 
505 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42432  normal  0.238047 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2613  hypothetical protein  31.4 
 
 
512 aa  162  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.209456  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1369  hypothetical protein  30.92 
 
 
547 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4549  hypothetical protein  30.11 
 
 
516 aa  162  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.954799  normal  0.0134652 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4416  hypothetical protein  30.11 
 
 
516 aa  162  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.768574  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0668  hypothetical protein  29.72 
 
 
544 aa  160  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.854444 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4047  hypothetical protein  28.83 
 
 
526 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.237674  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0391  hypothetical protein  34.41 
 
 
345 aa  156  8e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0661  aminoglycoside phosphotransferase  30.1 
 
 
515 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0314986 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1115  hypothetical protein  31.03 
 
 
579 aa  154  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136038  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1349  hypothetical protein  30.89 
 
 
521 aa  153  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1466  hypothetical protein  35.74 
 
 
345 aa  151  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3211  hypothetical protein  31.53 
 
 
603 aa  151  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2221  hypothetical protein  30.22 
 
 
520 aa  151  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1732  hypothetical protein  36.88 
 
 
372 aa  150  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105491  normal  0.994205 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5926  hypothetical protein  37.86 
 
 
358 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.768295 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>