60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0934 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0934  conserved hypothetical gluconokinase  100 
 
 		 159 aa  319  8e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000044285  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1232  hypothetical protein  31.11 
 
 		 525 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.100547 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2265  hypothetical protein  35.76 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0514  hypothetical protein  34.62 
 
 		 520 aa  66.2  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0345862  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_455  hypothetical protein  34.93 
 
 		 520 aa  63.9  0.0000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000133416  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1725  hypothetical protein  32 
 
 		 508 aa  62  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2047  hypothetical protein  30.3 
 
 		 520 aa  58.9  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00434824  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0490  hypothetical protein  32.05 
 
 		 520 aa  58.9  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.180685  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1001  hypothetical protein  31.13 
 
 		 551 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0358581  hitchhiker  1.18173e-16 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1244  hypothetical protein  32.74 
 
 		 522 aa  58.2  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2657  hypothetical protein  32 
 
 		 519 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000160126  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0750  hypothetical protein  32.67 
 
 		 520 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000461346  decreased coverage  0.00000000000202029 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1298  hypothetical protein  33.88 
 
 		 520 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0841  hypothetical protein  32.16 
 
 		 556 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000255062  decreased coverage  0.0000936176 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0379  hypothetical protein  31.13 
 
 		 527 aa  54.7  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1206  hypothetical protein  28.19 
 
 		 513 aa  54.3  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128112 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0651  aminoglycoside phosphotransferase  33.81 
 
 		 509 aa  53.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4684  hypothetical protein  33.11 
 
 		 502 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0278201  hitchhiker  0.000250166 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1195  hypothetical protein  31.47 
 
 		 482 aa  53.1  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4682  hypothetical protein  31.14 
 
 		 520 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000555746  hitchhiker  0.000000000000343402 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2783  hypothetical protein  28.95 
 
 		 523 aa  52.4  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.633184  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0914  kinase-like protein  29.93 
 
 		 200 aa  51.6  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3456  hypothetical protein  28.95 
 
 		 523 aa  52  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1313  hypothetical protein  31.62 
 
 		 499 aa  51.6  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.355493  normal  0.457249 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1588  aminoglycoside phosphotransferase  31.01 
 
 		 518 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.062948 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1458  hypothetical protein  28.57 
 
 		 509 aa  51.2  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0861  hypothetical protein  32.64 
 
 		 532 aa  51.6  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2646  uncharacterized protein-like protein  31.01 
 
 		 518 aa  51.2  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00596928  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1873  hypothetical protein  28.89 
 
 		 521 aa  50.4  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.00595e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3574  hypothetical protein  31.51 
 
 		 504 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.662023 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4548  hypothetical protein  32.43 
 
 		 533 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00671326  decreased coverage  0.0000000171948 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2628  hypothetical protein  28.67 
 
 		 517 aa  49.7  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1571  hypothetical protein  30 
 
 		 540 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0912  hypothetical protein  30.07 
 
 		 544 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0976  hypothetical protein  32.85 
 
 		 512 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0180634  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1031  hypothetical protein  32.37 
 
 		 182 aa  48.9  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0138831  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62230  hypothetical protein  30.14 
 
 		 520 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.051332  normal  0.186531 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0802  hypothetical protein  27.84 
 
 		 520 aa  48.5  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1431  hypothetical protein  28.67 
 
 		 527 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.882787  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4793  hypothetical protein  29.7 
 
 		 518 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600328  unclonable  0.0000272859 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1349  hypothetical protein  37.89 
 
 		 521 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0634  hypothetical protein  30.77 
 
 		 498 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1115  hypothetical protein  32.39 
 
 		 579 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.136038  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3522  adenylylsulfate kinase  33.57 
 
 		 508 aa  47.8  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42570  hypothetical protein  29.38 
 
 		 533 aa  47.4  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0138648  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5417  hypothetical protein  29.45 
 
 		 520 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2780  hypothetical protein  31.13 
 
 		 523 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3292  hypothetical protein  28.05 
 
 		 513 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.234842  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_902  hypothetical protein  28.57 
 
 		 200 aa  47  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00277515  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0913  hypothetical protein  36.56 
 
 		 516 aa  44.7  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1369  hypothetical protein  35.79 
 
 		 547 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4101  hypothetical protein  27.1 
 
 		 529 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4308  hypothetical protein  30.56 
 
 		 518 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4837  gluconate kinase  29.49 
 
 		 533 aa  44.7  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2379  hypothetical protein  30.82 
 
 		 509 aa  43.9  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0203614  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4721  hypothetical protein  31.69 
 
 		 519 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358451  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5125  hypothetical protein  28.99 
 
 		 497 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.864315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1197  hypothetical protein  27.97 
 
 		 530 aa  42  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.636152  normal  0.688701 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1230  hypothetical protein  30.5 
 
 		 504 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.022585  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1190  hypothetical protein  28.67 
 
 		 518 aa  40.8  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>