23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2828 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2828  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  352  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2376  hypothetical protein  44.97 
 
 
178 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0914  kinase-like protein  29.76 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0861  hypothetical protein  30.49 
 
 
532 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1031  hypothetical protein  28.77 
 
 
182 aa  55.5  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0138831  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_902  hypothetical protein  25.15 
 
 
200 aa  53.1  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00277515  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2811  hypothetical protein  36.43 
 
 
533 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00343166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0628  hypothetical protein  21.26 
 
 
174 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0684  hypothetical protein  27.78 
 
 
174 aa  45.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.357673  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0628  hypothetical protein  21.26 
 
 
174 aa  45.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0753  hypothetical protein  26.85 
 
 
174 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0773  hypothetical protein  21.26 
 
 
174 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000018677 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1873  hypothetical protein  28.74 
 
 
521 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.00595e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4584  hypothetical protein  25.93 
 
 
174 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.223628 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2047  hypothetical protein  26.23 
 
 
520 aa  43.5  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00434824  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0787  hypothetical protein  20 
 
 
169 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0718  hypothetical protein  27.88 
 
 
169 aa  42  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5732  hypothetical protein  51.28 
 
 
170 aa  41.6  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3292  hypothetical protein  26.99 
 
 
513 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.234842  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0491  chromatin associated protein KTI12  28.26 
 
 
255 aa  41.2  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1681  hypothetical protein  27.59 
 
 
166 aa  40.8  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2808  hypothetical protein  27.61 
 
 
513 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1882  adenylyl-sulfate kinase  38.2 
 
 
222 aa  40.8  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0221564 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>