37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2332 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2332  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  368  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.440053  normal  0.950066 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3317  aminoglycoside phosphotransferase  34.42 
 
 		 586 aa  82  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.479259  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06028  hypothetical protein  24.49 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0177  hypothetical protein  27.33 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3731  hypothetical protein  32.21 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0684  adenylate kinase, conjectural  33.07 
 
 		 170 aa  55.8  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0979482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1531  hypothetical protein  25.16 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.348224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1657  adenylate kinase, conjectural  30.47 
 
 		 170 aa  48.9  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.160746  hitchhiker  0.0066831 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1420  hypothetical protein  26.83 
 
 		 170 aa  48.1  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0488  kinase-like protein  50 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0802  hypothetical protein  27.04 
 
 		 520 aa  45.8  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0912  hypothetical protein  28.47 
 
 		 544 aa  46.2  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0491  chromatin associated protein KTI12  22.67 
 
 		 255 aa  46.2  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.126391  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1232  hypothetical protein  28.36 
 
 		 525 aa  45.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.100547 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1986  adenylate kinase, conjectural  30.16 
 
 		 170 aa  45.4  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.975431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3574  hypothetical protein  30.06 
 
 		 504 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.662023 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_902  hypothetical protein  23.93 
 
 		 200 aa  44.7  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00277515  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1725  hypothetical protein  29.88 
 
 		 508 aa  44.3  0.0009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7516  hypothetical protein  28.39 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2783  hypothetical protein  29.13 
 
 		 523 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.633184  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0379  hypothetical protein  25 
 
 		 527 aa  43.9  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3456  hypothetical protein  28 
 
 		 523 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6984  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  68.97 
 
 		 636 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0555  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  31.06 
 
 		 167 aa  43.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1681  hypothetical protein  25.87 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3561  hypothetical protein  27.86 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  0.0187655 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2059  hypothetical protein  28.91 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.527237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4338  hypothetical protein  27.21 
 
 		 717 aa  42.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0734  chromatin associated protein KTI12  24.49 
 
 		 257 aa  42  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.394826 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1184  chromatin associated protein KTI12  25.17 
 
 		 264 aa  41.6  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.18154  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0904  gluconate kinase  27.74 
 
 		 184 aa  42  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.119231  decreased coverage  0.0000000668063 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1249  kinase-like  32.54 
 
 		 195 aa  41.6  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0594  adenylate kinase  40.91 
 
 		 167 aa  41.6  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2265  hypothetical protein  22.46 
 
 		 170 aa  41.6  0.007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0087  seryl-tRNA(Sec) kinase  23.18 
 
 		 255 aa  41.6  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3271  cell division protein ZipA  25.49 
 
 		 184 aa  41.2  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2634  hypothetical protein  28.3 
 
 		 190 aa  41.2  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>