98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1249 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1249  kinase-like  100 
 
 		 195 aa  385  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0936  kinase-like protein  54.82 
 
 		 190 aa  198  3.9999999999999996e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1977  hypothetical protein  56.36 
 
 		 173 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409875  normal  0.79829 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4617  kinase-like protein  54.88 
 
 		 172 aa  181  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783253  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9914  kinase  50.9 
 
 		 175 aa  174  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.697691  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3550  kinase  56.79 
 
 		 169 aa  173  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0946  hypothetical protein  54.55 
 
 		 169 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5732  hypothetical protein  52.47 
 
 		 170 aa  169  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4741  kinase  51.97 
 
 		 175 aa  152  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3153  hypothetical protein  53.69 
 
 		 204 aa  144  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2059  hypothetical protein  46.79 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.527237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3550  hypothetical protein  40 
 
 		 172 aa  95.9  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.256016 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0768  kinase-like  45.54 
 
 		 97 aa  85.5  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00757142  hitchhiker  0.00428915 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2646  uncharacterized protein-like protein  31.49 
 
 		 518 aa  55.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00596928  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3714  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13961  hitchhiker  0.00508785 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1588  aminoglycoside phosphotransferase  30.94 
 
 		 518 aa  54.7  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.062948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8587  Adenylylsulfate kinase and related kinase-like protein  29.38 
 
 		 409 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.941247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3226  hypothetical protein  32.7 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2613  hypothetical protein  34.07 
 
 		 512 aa  53.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.209456  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1369  hypothetical protein  36.3 
 
 		 547 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4540  hypothetical protein  54.72 
 
 		 65 aa  51.2  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0425  adenylylsulfate kinase  30.63 
 
 		 493 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1681  hypothetical protein  27.92 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0753  hypothetical protein  30.89 
 
 		 174 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0787  hypothetical protein  25.64 
 
 		 169 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3137  adenylylsulfate kinase  31.25 
 
 		 405 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.447276  normal  0.113923 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4584  hypothetical protein  30.89 
 
 		 174 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.223628 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0162  adenylylsulfate kinase  31.25 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.627546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0371  hypothetical protein  42.86 
 
 		 68 aa  48.1  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.405494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0488  kinase-like protein  31.69 
 
 		 155 aa  47.8  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3456  hypothetical protein  34.29 
 
 		 523 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.542634 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06310  midasin, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12150)  38.55 
 
 		 4917 aa  46.6  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.589937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0210  hypothetical protein  36.67 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0684  hypothetical protein  30.08 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.357673  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3522  adenylylsulfate kinase  30.88 
 
 		 508 aa  47  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0773  hypothetical protein  30.33 
 
 		 174 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000018677 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0718  hypothetical protein  30.83 
 
 		 169 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0628  hypothetical protein  30.33 
 
 		 174 aa  46.6  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6984  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  29.79 
 
 		 636 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1184  chromatin associated protein KTI12  25.85 
 
 		 264 aa  45.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.18154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0628  hypothetical protein  29.51 
 
 		 174 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11312  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  30.65 
 
 		 614 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2783  hypothetical protein  33.52 
 
 		 523 aa  45.4  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.633184  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4721  hypothetical protein  31.85 
 
 		 519 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358451  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5417  hypothetical protein  35.65 
 
 		 520 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0720  putative ATP-ase  27.78 
 
 		 198 aa  45.4  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4548  hypothetical protein  30.22 
 
 		 533 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00671326  decreased coverage  0.0000000171948 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2066  hypothetical protein  35.71 
 
 		 514 aa  45.1  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.695789 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0087  hypothetical protein  27.33 
 
 		 345 aa  44.7  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.955525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3574  hypothetical protein  26.63 
 
 		 504 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.662023 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4684  hypothetical protein  30.22 
 
 		 502 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0278201  hitchhiker  0.000250166 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1915  hypothetical protein  30.5 
 
 		 526 aa  43.9  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294472  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0904  gluconate kinase  28.68 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.119231  decreased coverage  0.0000000668063 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2139  phosphotransferase (aminonucleoside antibiotic resistance)  26.46 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.203222  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1001  hypothetical protein  33.87 
 
 		 551 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0358581  hitchhiker  1.18173e-16 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34920  predicted protein  31.4 
 
 		 275 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4205  adenylylsulfate kinase  28.18 
 
 		 670 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0824  sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.73 
 
 		 636 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.533102  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1532  sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.73 
 
 		 647 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1349  hypothetical protein  31.85 
 
 		 521 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4047  hypothetical protein  31.65 
 
 		 526 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.237674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6306  adenylylsulfate kinase  31.62 
 
 		 187 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_902  hypothetical protein  28.46 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00277515  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0976  hypothetical protein  34.23 
 
 		 512 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0180634  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0065  adenylylsulfate kinase  29.38 
 
 		 527 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0939575 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0734  chromatin associated protein KTI12  24.19 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.394826 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1873  hypothetical protein  32.35 
 
 		 521 aa  42.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.00595e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0379  hypothetical protein  26.67 
 
 		 527 aa  42.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3292  hypothetical protein  37.74 
 
 		 513 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.234842  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2799  adenylylsulfate kinase  36 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0637  adenylylsulfate kinase  36 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62230  hypothetical protein  34.78 
 
 		 520 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.051332  normal  0.186531 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4709  adenylylsulfate kinase  30.34 
 
 		 196 aa  43.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0634  hypothetical protein  31.46 
 
 		 498 aa  42.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0263  hypothetical protein  42.55 
 
 		 490 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.168433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02217  hypothetical protein  29 
 
 		 129 aa  42.7  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0370  hypothetical protein  47.92 
 
 		 51 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2811  hypothetical protein  51.35 
 
 		 533 aa  42.4  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00343166  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1690  adenylylsulfate kinase  36 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.228231  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2808  hypothetical protein  37.74 
 
 		 513 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2733  adenylylsulfate kinase  36 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.57754  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2676  adenylylsulfate kinase  36 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.607978  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4682  hypothetical protein  34.78 
 
 		 520 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000555746  hitchhiker  0.000000000000343402 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2912  adenylylsulfate kinase  36 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137451  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2375  adenylylsulfate kinase  36 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755803  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1031  hypothetical protein  27.88 
 
 		 182 aa  42.7  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0138831  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4422  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  29.82 
 
 		 618 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3995  hypothetical protein  30.83 
 
 		 181 aa  41.6  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0087  seryl-tRNA(Sec) kinase  25.85 
 
 		 255 aa  41.6  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1363  adenylyl-sulfate kinase  28.02 
 
 		 204 aa  41.6  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2332  hypothetical protein  32.54 
 
 		 179 aa  41.6  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.440053  normal  0.950066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0750  hypothetical protein  33.87 
 
 		 520 aa  41.6  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000461346  decreased coverage  0.00000000000202029 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3695  hypothetical protein  32.61 
 
 		 186 aa  41.6  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2252  putative serine protease  32.26 
 
 		 198 aa  41.6  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000202856 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1532  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  44.23 
 
 		 776 aa  41.6  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.846759 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2780  hypothetical protein  41.67 
 
 		 523 aa  41.2  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2272  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  32.43 
 
 		 618 aa  41.2  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1986  adenylate kinase, conjectural  33.07 
 
 		 170 aa  41.2  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.975431  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>