35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3561 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3561  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  0.0187655 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1420  hypothetical protein  58.9 
 
 		 170 aa  213  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1883  hypothetical protein  57.42 
 
 		 163 aa  195  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1747  hypothetical protein  55.13 
 
 		 177 aa  195  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.497705  normal  0.12531 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7516  hypothetical protein  57.24 
 
 		 181 aa  184  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1531  hypothetical protein  52.56 
 
 		 163 aa  179  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.348224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1180  hypothetical protein  51.3 
 
 		 161 aa  175  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3180  hypothetical protein  51.95 
 
 		 164 aa  166  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.942907  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2771  hypothetical protein  45.45 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380494 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0986  cell division protein ZipA  45.45 
 
 		 172 aa  141  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3271  cell division protein ZipA  46.2 
 
 		 184 aa  140  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1008  cell division protein ZipA  45.4 
 
 		 170 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3355  cell division protein ZipA  45.4 
 
 		 172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1847  cell division protein ZipA  40.37 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.630805  normal  0.844154 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1020  cell division protein ZipA  45.81 
 
 		 188 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.594259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3212  cell division protein ZipA  36.77 
 
 		 164 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4505  hypothetical protein  53.85 
 
 		 93 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06028  hypothetical protein  33.95 
 
 		 159 aa  86.7  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5693  hypothetical protein  55.07 
 
 		 112 aa  84  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.201068  normal  0.494471 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4301  hypothetical protein  29.56 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0177  hypothetical protein  28.66 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1232  hypothetical protein  30 
 
 		 525 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.100547 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2657  hypothetical protein  28.82 
 
 		 519 aa  52.8  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000160126  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4373  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.27 
 
 		 368 aa  51.2  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1431  hypothetical protein  27.39 
 
 		 527 aa  46.6  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.882787  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0861  hypothetical protein  33.33 
 
 		 532 aa  45.4  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3317  aminoglycoside phosphotransferase  29.05 
 
 		 586 aa  45.1  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.479259  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1725  hypothetical protein  26.09 
 
 		 508 aa  45.1  0.0006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0785  hypothetical protein  28.08 
 
 		 175 aa  44.7  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113287 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2332  hypothetical protein  27.86 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.440053  normal  0.950066 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0914  kinase-like protein  25.31 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0184467  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2379  hypothetical protein  29.28 
 
 		 509 aa  42  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0203614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1588  aminoglycoside phosphotransferase  28.93 
 
 		 518 aa  42  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.062948 
 
 
-
 
NC_002936  DET1031  hypothetical protein  26.23 
 
 		 182 aa  41.6  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0138831  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_902  hypothetical protein  24.29 
 
 		 200 aa  41.6  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00277515  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>