41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06028 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06028  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  333  5e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3561  hypothetical protein  33.95 
 
 		 185 aa  86.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248722  normal  0.0187655 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0177  hypothetical protein  30.26 
 
 		 172 aa  85.1  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1847  cell division protein ZipA  28.66 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.630805  normal  0.844154 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1180  hypothetical protein  29.14 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.214399 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1420  hypothetical protein  26.45 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1531  hypothetical protein  26.92 
 
 		 163 aa  70.5  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.348224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4373  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.92 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.742659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4301  hypothetical protein  27.04 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2332  hypothetical protein  24.49 
 
 		 179 aa  64.3  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.440053  normal  0.950066 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7516  hypothetical protein  27.67 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3731  hypothetical protein  29.73 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1747  hypothetical protein  26.45 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.497705  normal  0.12531 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3212  cell division protein ZipA  23.87 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0986  cell division protein ZipA  29.14 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1008  cell division protein ZipA  29.14 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3355  cell division protein ZipA  29.14 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3317  aminoglycoside phosphotransferase  28.66 
 
 		 586 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.479259  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3180  hypothetical protein  26.62 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.942907  normal  0.672833 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1020  cell division protein ZipA  28.57 
 
 		 188 aa  57.4  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.594259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1883  hypothetical protein  27.03 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3271  cell division protein ZipA  25.17 
 
 		 184 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2771  hypothetical protein  24.32 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00380494 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0410  hypothetical protein  26.8 
 
 		 153 aa  51.2  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1681  hypothetical protein  25.52 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3574  hypothetical protein  24.4 
 
 		 504 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.662023 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2628  hypothetical protein  28.26 
 
 		 517 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0634  hypothetical protein  28.68 
 
 		 498 aa  47.8  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0488  kinase-like protein  23.87 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4505  hypothetical protein  30.68 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0912  hypothetical protein  26.56 
 
 		 544 aa  44.7  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1195  hypothetical protein  29.37 
 
 		 482 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2808  hypothetical protein  26.81 
 
 		 513 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3292  hypothetical protein  30.3 
 
 		 513 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.234842  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1271  hypothetical protein  30.49 
 
 		 516 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0492  hypothetical protein  28.21 
 
 		 535 aa  42.4  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0678  hypothetical protein  27.1 
 
 		 526 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.986431  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3456  hypothetical protein  27.78 
 
 		 523 aa  42  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418547  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0861  hypothetical protein  24.83 
 
 		 532 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2538  kinase-like protein  25.58 
 
 		 335 aa  40.8  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2047  hypothetical protein  26.4 
 
 		 520 aa  40.8  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00434824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>