58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2059 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2059  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  404  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.527237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0946  hypothetical protein  47.34 
 
 		 169 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9914  kinase  44.57 
 
 		 175 aa  153  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.697691  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1977  hypothetical protein  47.09 
 
 		 173 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409875  normal  0.79829 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3550  kinase  45.68 
 
 		 169 aa  138  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4617  kinase-like protein  41.52 
 
 		 172 aa  134  7.000000000000001e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783253  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4741  kinase  45.39 
 
 		 175 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1249  kinase-like  46.79 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5732  hypothetical protein  42.5 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0936  kinase-like protein  39.51 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3153  hypothetical protein  45.64 
 
 		 204 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3550  hypothetical protein  33.93 
 
 		 172 aa  75.5  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.256016 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3714  hypothetical protein  29.95 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13961  hitchhiker  0.00508785 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0768  kinase-like  30.11 
 
 		 97 aa  52  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00757142  hitchhiker  0.00428915 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0411  adenylylsulfate kinase  28.07 
 
 		 201 aa  51.2  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3226  hypothetical protein  29.3 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1291  adenylylsulfate kinase  27.49 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0787  hypothetical protein  29.31 
 
 		 169 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0753  hypothetical protein  28.45 
 
 		 174 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18790  adenylylsulfate kinase ApsK  31.46 
 
 		 376 aa  48.9  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0334  adenylyl-sulfate kinase  30 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4584  hypothetical protein  28.45 
 
 		 174 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.223628 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4540  hypothetical protein  56.86 
 
 		 65 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3866  adenylylsulfate kinase  26.9 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036848 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3137  adenylylsulfate kinase  31.07 
 
 		 405 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.447276  normal  0.113923 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2185  adenylylsulfate kinase  28.07 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0939  adenylylsulfate kinase  30.06 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3831  adenylyl-sulfate kinase  28.9 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000161314  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1546  adenylylsulfate kinase  26.32 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3519  adenylate sulfate kinase protein  28.98 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1346  adenylyl-sulfate kinase  26.32 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0712  adenylyl-sulfate kinase  26.55 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000090997  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1787  chloramphenicol phosphotransferase family protein  25.23 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305646 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1478  adenylylsulfate kinase  25.73 
 
 		 197 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3574  hypothetical protein  26.83 
 
 		 504 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.662023 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0628  hypothetical protein  26.72 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1584  adenylylsulfate kinase  26.32 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0773  hypothetical protein  26.72 
 
 		 174 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000018677 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0684  hypothetical protein  26.72 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.357673  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0628  hypothetical protein  25.86 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1306  adenylylsulfate kinase  26.32 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0718  hypothetical protein  26.72 
 
 		 169 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01831  adenylylsulfate kinase  29.61 
 
 		 217 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.573546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1862  adenylylsulfate kinase  29.17 
 
 		 208 aa  42.7  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.310492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1145  adenylyl-sulfate kinase  25.15 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1305  adenylylsulfate kinase  26.32 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1021  adenylylsulfate kinase  30.11 
 
 		 495 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3030  adenylyl-sulfate kinase  28.65 
 
 		 239 aa  42.4  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1514  adenylylsulfate kinase  25.73 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000229121 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1442  adenylylsulfate kinase  25.73 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1532  sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.99 
 
 		 647 aa  42.4  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2332  hypothetical protein  28.91 
 
 		 179 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.440053  normal  0.950066 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1332  adenylylsulfate kinase  25.73 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4172  adenylylsulfate kinase  29.07 
 
 		 508 aa  42.4  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3191  adenylyl-sulfate kinase  30.81 
 
 		 228 aa  42.4  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.942826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0038  adenylylsulfate kinase  24.59 
 
 		 185 aa  42.4  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9629  sulfate adenylate transferase subunit 1  31.32 
 
 		 636 aa  41.6  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2576  adenylylsulfate kinase  29.89 
 
 		 220 aa  41.2  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>