54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3550 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3550  kinase  100 
 
 		 169 aa  342  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9914  kinase  56.21 
 
 		 175 aa  197  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.697691  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0946  hypothetical protein  56.89 
 
 		 169 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1977  hypothetical protein  54.71 
 
 		 173 aa  184  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409875  normal  0.79829 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4617  kinase-like protein  50.92 
 
 		 172 aa  175  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783253  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1249  kinase-like  56.79 
 
 		 195 aa  173  9e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4741  kinase  53.02 
 
 		 175 aa  168  3e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3153  hypothetical protein  56.08 
 
 		 204 aa  167  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5732  hypothetical protein  54.36 
 
 		 170 aa  166  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0936  kinase-like protein  46.34 
 
 		 190 aa  166  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2059  hypothetical protein  45.68 
 
 		 198 aa  138  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.527237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3550  hypothetical protein  35.47 
 
 		 172 aa  92.8  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.256016 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0768  kinase-like  47.5 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00757142  hitchhiker  0.00428915 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3226  hypothetical protein  31.15 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4540  hypothetical protein  57.69 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3714  hypothetical protein  31.69 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13961  hitchhiker  0.00508785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0370  hypothetical protein  57.78 
 
 		 51 aa  54.3  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0371  hypothetical protein  46.94 
 
 		 68 aa  53.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.405494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2646  uncharacterized protein-like protein  29.81 
 
 		 518 aa  52.4  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00596928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1588  aminoglycoside phosphotransferase  27.95 
 
 		 518 aa  48.9  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.062948 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0753  hypothetical protein  28.33 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0396  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  28.18 
 
 		 619 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.668452  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4584  hypothetical protein  28.33 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.223628 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0387  adenylylsulfate kinase / sulfate adenylyltransferase subunit 1  28.18 
 
 		 619 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.232364  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0375  sulfate adenylyltransferase subunit 1 / adenylylsulfate kinase  27.87 
 
 		 619 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0435522  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1222  hypothetical protein  28.09 
 
 		 525 aa  45.1  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484175  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0861  hypothetical protein  35.71 
 
 		 532 aa  44.3  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00795594  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3574  hypothetical protein  28.4 
 
 		 504 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.662023 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0824  sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.32 
 
 		 636 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.533102  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0263  hypothetical protein  37.7 
 
 		 490 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.168433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2780  hypothetical protein  60 
 
 		 523 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281623 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0787  hypothetical protein  26.72 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0210  hypothetical protein  28.75 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0628  hypothetical protein  26.67 
 
 		 174 aa  42.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1500  adenylylsulfate kinase  27.78 
 
 		 198 aa  42  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0684  hypothetical protein  27.42 
 
 		 174 aa  41.6  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.357673  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1197  hypothetical protein  30.47 
 
 		 530 aa  41.6  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.636152  normal  0.688701 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02217  hypothetical protein  58.06 
 
 		 129 aa  41.6  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0773  hypothetical protein  27.42 
 
 		 174 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000018677 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0628  hypothetical protein  27.42 
 
 		 174 aa  41.6  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1369  hypothetical protein  29.28 
 
 		 547 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0802  hypothetical protein  41.18 
 
 		 520 aa  41.2  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1571  hypothetical protein  28.95 
 
 		 540 aa  41.2  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1298  hypothetical protein  28.95 
 
 		 520 aa  40.8  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0718  hypothetical protein  28.33 
 
 		 169 aa  40.8  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1042  adenylylsulfate kinase  28.99 
 
 		 642 aa  40.8  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4101  hypothetical protein  29.01 
 
 		 529 aa  40.8  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.293917 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2375  adenylylsulfate kinase  28.49 
 
 		 206 aa  40.8  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755803  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2912  adenylylsulfate kinase  28.49 
 
 		 206 aa  40.8  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137451  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2676  adenylylsulfate kinase  28.49 
 
 		 206 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.607978  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2799  adenylylsulfate kinase  28.49 
 
 		 204 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0637  adenylylsulfate kinase  28.49 
 
 		 204 aa  40.8  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2733  adenylylsulfate kinase  28.49 
 
 		 206 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.57754  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1690  adenylylsulfate kinase  28.49 
 
 		 206 aa  40.8  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.228231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>