12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0371 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0371  hypothetical protein  100 
 
 
68 aa  142  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.405494  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5732  hypothetical protein  44.44 
 
 
170 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1977  hypothetical protein  50 
 
 
173 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409875  normal  0.79829 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3550  kinase  46.94 
 
 
169 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4741  kinase  48 
 
 
175 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9914  kinase  46.94 
 
 
175 aa  50.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.697691  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1249  kinase-like  42.86 
 
 
195 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0946  hypothetical protein  44.9 
 
 
169 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518197  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0936  kinase-like protein  40 
 
 
190 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4617  kinase-like protein  35.48 
 
 
172 aa  43.5  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783253  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3153  hypothetical protein  35.42 
 
 
204 aa  43.5  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3550  hypothetical protein  36.73 
 
 
172 aa  40.8  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.256016 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>