37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3550 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3550  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  332  1e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.256016 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1977  hypothetical protein  42.69 
 
 		 173 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409875  normal  0.79829 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9914  kinase  38.42 
 
 		 175 aa  107  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.697691  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0946  hypothetical protein  39.05 
 
 		 169 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4741  kinase  41.33 
 
 		 175 aa  104  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0936  kinase-like protein  34.67 
 
 		 190 aa  103  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1249  kinase-like  40 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3153  hypothetical protein  43.62 
 
 		 204 aa  101  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3550  kinase  35.47 
 
 		 169 aa  99.8  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4617  kinase-like protein  35.67 
 
 		 172 aa  97.8  7e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783253  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5732  hypothetical protein  37.33 
 
 		 170 aa  97.4  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2059  hypothetical protein  33.93 
 
 		 198 aa  81.3  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.527237 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0768  kinase-like  46.25 
 
 		 97 aa  71.2  0.000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00757142  hitchhiker  0.00428915 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0787  hypothetical protein  29.17 
 
 		 169 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5228  hypothetical protein  38.14 
 
 		 137 aa  52  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.557629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0773  hypothetical protein  24.68 
 
 		 174 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000018677 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0753  hypothetical protein  29.51 
 
 		 174 aa  52  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0628  hypothetical protein  24.68 
 
 		 174 aa  52  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0718  hypothetical protein  24.68 
 
 		 169 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0628  hypothetical protein  29.17 
 
 		 174 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0684  hypothetical protein  24.68 
 
 		 174 aa  51.2  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.357673  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1431  hypothetical protein  29.73 
 
 		 527 aa  50.8  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.882787  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1681  hypothetical protein  29.61 
 
 		 166 aa  50.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4584  hypothetical protein  28.69 
 
 		 174 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.223628 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2047  hypothetical protein  27.01 
 
 		 520 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00434824  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2265  hypothetical protein  25.83 
 
 		 170 aa  48.9  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1232  hypothetical protein  31.62 
 
 		 525 aa  48.1  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.100547 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0634  hypothetical protein  31.2 
 
 		 498 aa  47.8  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.589487 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2379  hypothetical protein  32.23 
 
 		 509 aa  47.4  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0203614  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2646  uncharacterized protein-like protein  31.08 
 
 		 518 aa  45.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00596928  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0841  hypothetical protein  31.31 
 
 		 556 aa  42.4  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000255062  decreased coverage  0.0000936176 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0490  hypothetical protein  27.7 
 
 		 520 aa  42.4  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.180685  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0976  hypothetical protein  32.32 
 
 		 512 aa  41.6  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0180634  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1222  hypothetical protein  34.38 
 
 		 525 aa  41.2  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484175  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2221  hypothetical protein  36.15 
 
 		 520 aa  41.2  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0371  hypothetical protein  36.73 
 
 		 68 aa  41.2  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.405494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1195  hypothetical protein  29.6 
 
 		 482 aa  41.2  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>