23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4741 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4741  kinase  100 
 
 
175 aa  349  1e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5732  hypothetical protein  53.75 
 
 
170 aa  169  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3550  kinase  49.09 
 
 
169 aa  168  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0936  kinase-like protein  48.82 
 
 
190 aa  166  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9914  kinase  50.31 
 
 
175 aa  157  8e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.697691  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1249  kinase-like  51.97 
 
 
195 aa  152  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1977  hypothetical protein  47.83 
 
 
173 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409875  normal  0.79829 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3153  hypothetical protein  49.32 
 
 
204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4617  kinase-like protein  44.44 
 
 
172 aa  144  8.000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783253  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2059  hypothetical protein  45.73 
 
 
198 aa  143  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.527237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0946  hypothetical protein  46.5 
 
 
169 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518197  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3550  hypothetical protein  41.33 
 
 
172 aa  100  8e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.256016 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0768  kinase-like  43.75 
 
 
97 aa  77.4  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00757142  hitchhiker  0.00428915 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3226  hypothetical protein  31.87 
 
 
182 aa  59.3  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3714  hypothetical protein  33.59 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13961  hitchhiker  0.00508785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0371  hypothetical protein  46.67 
 
 
68 aa  52  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.405494  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0370  hypothetical protein  52.27 
 
 
51 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5262  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4540  hypothetical protein  48.98 
 
 
65 aa  47  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1153  Sulfate adenylyltransferase, large subunit  28.22 
 
 
642 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0824  sulfate adenylyltransferase, large subunit  29.45 
 
 
636 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.533102  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0753  hypothetical protein  25 
 
 
174 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1681  hypothetical protein  30.95 
 
 
166 aa  41.2  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1042  adenylylsulfate kinase  27.27 
 
 
642 aa  40.8  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>