13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0768 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0768  kinase-like  100 
 
 
97 aa  192  9e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00757142  hitchhiker  0.00428915 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5732  hypothetical protein  44.57 
 
 
170 aa  90.5  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1249  kinase-like  45.54 
 
 
195 aa  85.5  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0936  kinase-like protein  45.45 
 
 
190 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4617  kinase-like protein  46.25 
 
 
172 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783253  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3550  kinase  47.5 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4741  kinase  43.75 
 
 
175 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0946  hypothetical protein  43.21 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518197  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1977  hypothetical protein  36.96 
 
 
173 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409875  normal  0.79829 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3550  hypothetical protein  46.25 
 
 
172 aa  70.9  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.256016 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9914  kinase  39.76 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.697691  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3153  hypothetical protein  44.3 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2059  hypothetical protein  30.11 
 
 
198 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.527237 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>