23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3153 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_3153  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  393  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3550  kinase  52.47 
 
 
169 aa  171  5.999999999999999e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4617  kinase-like protein  53.29 
 
 
172 aa  169  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783253  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0946  hypothetical protein  51.23 
 
 
169 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518197  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0936  kinase-like protein  49.69 
 
 
190 aa  161  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9914  kinase  48.15 
 
 
175 aa  161  7e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.697691  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1977  hypothetical protein  53.64 
 
 
173 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409875  normal  0.79829 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4741  kinase  49.34 
 
 
175 aa  149  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1249  kinase-like  53.95 
 
 
195 aa  147  7e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5732  hypothetical protein  49.07 
 
 
170 aa  143  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2059  hypothetical protein  42.44 
 
 
198 aa  123  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.527237 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3550  hypothetical protein  43.71 
 
 
172 aa  100  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.256016 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0768  kinase-like  41.94 
 
 
97 aa  70.1  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00757142  hitchhiker  0.00428915 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3226  hypothetical protein  35.43 
 
 
182 aa  62.4  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3714  hypothetical protein  36.15 
 
 
194 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13961  hitchhiker  0.00508785 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1530  bifunctional sulfate adenylyltransferase subunit 1/adenylylsulfate kinase protein  30.9 
 
 
651 aa  48.5  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861038  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0371  hypothetical protein  35 
 
 
68 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.405494  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0370  hypothetical protein  46.67 
 
 
51 aa  44.7  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5262  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4540  hypothetical protein  55.26 
 
 
65 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0425  adenylylsulfate kinase  30.51 
 
 
493 aa  43.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1031  hypothetical protein  24.51 
 
 
182 aa  42.4  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0138831  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12130  hypothetical protein  35.77 
 
 
190 aa  42.4  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1232  hypothetical protein  30.88 
 
 
525 aa  42  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.100547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>