37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1977 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1977  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  338  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409875  normal  0.79829 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_9914  kinase  69.09 
 
 
175 aa  232  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.697691  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0946  hypothetical protein  71.26 
 
 
169 aa  231  3e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.518197  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3550  kinase  54.71 
 
 
169 aa  184  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1249  kinase-like  56.36 
 
 
195 aa  181  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4617  kinase-like protein  51.18 
 
 
172 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783253  normal  0.329127 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5732  hypothetical protein  51.28 
 
 
170 aa  168  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0936  kinase-like protein  50.99 
 
 
190 aa  165  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3153  hypothetical protein  53.69 
 
 
204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.406153 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2059  hypothetical protein  47.09 
 
 
198 aa  150  8.999999999999999e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.527237 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4741  kinase  49.01 
 
 
175 aa  148  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3550  hypothetical protein  42.69 
 
 
172 aa  107  8.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.256016 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0768  kinase-like  36.96 
 
 
97 aa  73.6  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00757142  hitchhiker  0.00428915 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0371  hypothetical protein  50 
 
 
68 aa  56.6  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.405494  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3226  hypothetical protein  36.13 
 
 
182 aa  55.1  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3714  hypothetical protein  34.45 
 
 
194 aa  54.3  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.13961  hitchhiker  0.00508785 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0753  hypothetical protein  27.43 
 
 
174 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0787  hypothetical protein  27.33 
 
 
169 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4584  hypothetical protein  27.43 
 
 
174 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.223628 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4540  hypothetical protein  47.27 
 
 
65 aa  52.4  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2646  uncharacterized protein-like protein  32.97 
 
 
518 aa  52.4  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00596928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1588  aminoglycoside phosphotransferase  31.89 
 
 
518 aa  51.2  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.062948 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0684  hypothetical protein  25.31 
 
 
174 aa  51.2  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.357673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0718  hypothetical protein  25.95 
 
 
169 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0773  hypothetical protein  24.69 
 
 
174 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000018677 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0628  hypothetical protein  24.69 
 
 
174 aa  48.5  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2628  hypothetical protein  29.05 
 
 
517 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0210  hypothetical protein  34.94 
 
 
197 aa  47  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0628  hypothetical protein  25.75 
 
 
174 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0263  hypothetical protein  53.66 
 
 
490 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.168433  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0488  kinase-like protein  34.17 
 
 
155 aa  44.3  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5228  hypothetical protein  39.56 
 
 
137 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.557629  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0370  hypothetical protein  54.35 
 
 
51 aa  43.9  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.5262  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3292  hypothetical protein  45.95 
 
 
513 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.234842  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2808  hypothetical protein  45.95 
 
 
513 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3522  adenylylsulfate kinase  50 
 
 
508 aa  43.1  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2780  hypothetical protein  36.92 
 
 
523 aa  42  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.281623 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>