More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0270 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0270  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  100 
 
 
211 aa  430  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  56.15 
 
 
211 aa  229  2e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0286  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  52.38 
 
 
211 aa  226  1e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000626987  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  54.55 
 
 
215 aa  226  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  46.67 
 
 
217 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  50.48 
 
 
216 aa  223  1e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  54.27 
 
 
214 aa  222  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0769  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  49.28 
 
 
215 aa  220  9.999999999999999e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.8085  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  49.05 
 
 
213 aa  218  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  49.52 
 
 
215 aa  214  5e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  48.1 
 
 
214 aa  214  7e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  47.62 
 
 
215 aa  214  8e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  47.62 
 
 
214 aa  214  9e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  46.19 
 
 
216 aa  212  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  46.19 
 
 
216 aa  212  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  48.66 
 
 
217 aa  211  5.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  45.93 
 
 
219 aa  209  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0741  adenylate kinase  56.91 
 
 
212 aa  209  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0160086  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  45.37 
 
 
217 aa  209  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  50.8 
 
 
217 aa  209  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1107  adenylate kinase  48.98 
 
 
216 aa  209  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.211555 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1070  adenylate kinase  52.45 
 
 
216 aa  207  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.283029  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  49.73 
 
 
214 aa  207  9e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01370  Adenylate kinase  43.33 
 
 
216 aa  207  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000615524  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  44.88 
 
 
217 aa  206  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  46.19 
 
 
215 aa  206  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1553  adenylate kinase  45.24 
 
 
218 aa  206  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.216762  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  50.8 
 
 
220 aa  206  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  46.19 
 
 
217 aa  206  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  45.71 
 
 
214 aa  206  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  48.66 
 
 
216 aa  205  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0348  adenylate kinase  48.69 
 
 
218 aa  205  4e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0290027  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  43.87 
 
 
227 aa  205  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  49.46 
 
 
217 aa  205  4e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  49.21 
 
 
215 aa  205  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  49.21 
 
 
215 aa  205  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1088  adenylate kinase  52.08 
 
 
215 aa  204  6e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.670242  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3359  adenylate kinase  53.03 
 
 
215 aa  203  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848875  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1164  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  47.69 
 
 
226 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000123796  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1319  adenylate kinase  54.89 
 
 
215 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.176093  hitchhiker  0.00352848 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0518  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  48.17 
 
 
220 aa  203  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108305  unclonable  0.0000000000175387 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1001  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  52.88 
 
 
215 aa  202  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000583079  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16700  adenylate kinase  51.44 
 
 
215 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.528673  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4005  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  48.21 
 
 
226 aa  202  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000986709  hitchhiker  0.0000175975 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1313  adenylate kinase  44.65 
 
 
220 aa  202  4e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000294373  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1373  adenylate kinase  44.65 
 
 
220 aa  202  4e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000458386  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  45.71 
 
 
222 aa  202  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  47.62 
 
 
215 aa  202  4e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1361  adenylate kinase  46.19 
 
 
224 aa  202  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  42.86 
 
 
217 aa  201  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1452  adenylate kinase  51.44 
 
 
215 aa  201  5e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2893  adenylate kinase  48.37 
 
 
214 aa  201  5e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0507  adenylate kinase  49.3 
 
 
214 aa  201  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0167  adenylate kinases  46.67 
 
 
228 aa  201  5e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0999685  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2513  adenylate kinase  45.71 
 
 
217 aa  201  6e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  48.37 
 
 
213 aa  201  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1736  adenylate kinase  48.21 
 
 
217 aa  201  8e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0382  adenylate kinase  48.21 
 
 
217 aa  201  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1509  adenylate kinase  55.43 
 
 
215 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  44.88 
 
 
217 aa  200  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  47.96 
 
 
217 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01105  adenylate kinase  54.35 
 
 
214 aa  200  9.999999999999999e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  45.24 
 
 
217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0535  adenylate kinase  53.76 
 
 
221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  45.24 
 
 
214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2058  adenylate kinase  47.69 
 
 
215 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000332952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  44.76 
 
 
217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  47.45 
 
 
217 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1256  adenylate kinase  54.3 
 
 
219 aa  199  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1854  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  46.94 
 
 
217 aa  199  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0590  adenylate kinase  50 
 
 
221 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.012564  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0806  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  54.21 
 
 
218 aa  199  3e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.248046  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0532  adenylate kinase  50 
 
 
221 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00589344  hitchhiker  0.0000489496 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0354  adenylate kinase  53.55 
 
 
222 aa  199  3e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2297  adenylate kinase  47.91 
 
 
214 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000662759  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1506  adenylate kinase  50 
 
 
216 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.614097  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2153  adenylate kinase  52.17 
 
 
218 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4216  adenylate kinase  50 
 
 
216 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1800  adenylate kinase  47.91 
 
 
214 aa  198  5e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0513592  hitchhiker  0.00000182488 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2584  adenylate kinase  47.91 
 
 
214 aa  198  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000261386  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2546  adenylate kinase  47.91 
 
 
214 aa  198  5e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0993746  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2661  adenylate kinase  47.91 
 
 
214 aa  198  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00427284  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2066  adenylate kinase  50.53 
 
 
214 aa  198  6e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  49.46 
 
 
214 aa  197  7.999999999999999e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3554  adenylate kinase  44.08 
 
 
229 aa  197  7.999999999999999e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3212  adenylate kinase  51.81 
 
 
217 aa  197  9e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  45.24 
 
 
217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1111  adenylate kinase  50 
 
 
216 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4111  adenylate kinase  50 
 
 
216 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1112  adenylate kinase  53.09 
 
 
209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2018  adenylate kinase  47.44 
 
 
214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1256  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  49.5 
 
 
218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.357832  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3003  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  46.67 
 
 
222 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.192004  hitchhiker  0.00720085 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  48.4 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2230  adenylate kinase  50.49 
 
 
214 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000387262  hitchhiker  0.000214204 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0739  adenylate kinase  49.28 
 
 
220 aa  196  3e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139033  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2235  adenylate kinase  49.02 
 
 
218 aa  196  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00391254  hitchhiker  0.0000168537 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2249  adenylate kinase  47.44 
 
 
214 aa  195  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00010128  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  47.59 
 
 
213 aa  195  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2441  adenylate kinase  47.44 
 
 
214 aa  195  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000155817  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>