More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2441 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2249  adenylate kinase  100 
 
 
214 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00010128  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2321  adenylate kinase  100 
 
 
214 aa  433  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000464227  unclonable  0.0000372349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2441  adenylate kinase  100 
 
 
214 aa  433  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000155817  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2018  adenylate kinase  99.07 
 
 
214 aa  429  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2661  adenylate kinase  97.2 
 
 
214 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00427284  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2584  adenylate kinase  97.2 
 
 
214 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000261386  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1800  adenylate kinase  97.2 
 
 
214 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0513592  hitchhiker  0.00000182488 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2546  adenylate kinase  97.2 
 
 
214 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0993746  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2297  adenylate kinase  97.2 
 
 
214 aa  421  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000662759  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1540  adenylate kinase  93.93 
 
 
214 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0198359  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1430  adenylate kinase  93.43 
 
 
214 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000051006  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1315  adenylate kinase  91.55 
 
 
214 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0119239  normal  0.109595 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2847  adenylate kinase  89.2 
 
 
214 aa  395  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000688641  decreased coverage  0.00000000215669 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2230  adenylate kinase  88.73 
 
 
214 aa  390  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000387262  hitchhiker  0.000214204 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1528  adenylate kinase  87.32 
 
 
227 aa  389  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000135558  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1798  adenylate kinase  87.79 
 
 
214 aa  385  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000131299  hitchhiker  0.000000153174 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0373  adenylate kinase  81.34 
 
 
220 aa  353  1e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0957  adenylate kinases  76.06 
 
 
214 aa  343  8.999999999999999e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833948  normal  0.567564 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01105  adenylate kinase  77 
 
 
214 aa  340  7e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1024  adenylate kinase  77 
 
 
214 aa  340  1e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3194  adenylate kinase  76.06 
 
 
214 aa  335  3.9999999999999995e-91  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.804867  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3900  adenylate kinase  75.7 
 
 
214 aa  335  3.9999999999999995e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000914412  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2894  adenylate kinase  76.06 
 
 
214 aa  335  3.9999999999999995e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.290073  normal  0.0817579 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3054  adenylate kinase  76.06 
 
 
214 aa  335  3.9999999999999995e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2893  adenylate kinase  75.59 
 
 
214 aa  334  5e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3035  adenylate kinase  75.12 
 
 
214 aa  332  2e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0507  adenylate kinase  75.12 
 
 
214 aa  331  5e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1139  adenylate kinase  74.18 
 
 
214 aa  329  2e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.498003  unclonable  0.0000000226015 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01328  adenylate kinase  73.71 
 
 
214 aa  328  3e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004136  adenylate kinase  73.24 
 
 
214 aa  328  4e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1080  adenylate kinase  74.65 
 
 
214 aa  324  8.000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3231  adenylate kinase  73.71 
 
 
214 aa  322  3e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103733  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0539  adenylate kinase  73.71 
 
 
214 aa  321  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.263643  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0593  adenylate kinase  73.71 
 
 
214 aa  321  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0534  adenylate kinase  73.71 
 
 
214 aa  321  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0550  adenylate kinase  73.71 
 
 
214 aa  321  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.186562  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0533  adenylate kinase  73.71 
 
 
214 aa  321  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0566  adenylate kinase  72.77 
 
 
234 aa  318  3e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0567733  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0513  adenylate kinase  72.77 
 
 
214 aa  318  5e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00425  adenylate kinase  72.77 
 
 
214 aa  318  5e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3136  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  72.77 
 
 
214 aa  318  5e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3142  adenylate kinase  72.77 
 
 
214 aa  318  5e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.207455  normal  0.0239561 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00430  hypothetical protein  72.77 
 
 
214 aa  318  5e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0406  adenylate kinase  72.77 
 
 
214 aa  318  5e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.395771  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0518  adenylate kinase  72.77 
 
 
214 aa  318  5e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0222194  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0551  adenylate kinase  72.77 
 
 
214 aa  318  5e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0980412  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0815  adenylate kinase  72.43 
 
 
215 aa  317  1e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0954  adenylate kinase  71.83 
 
 
214 aa  317  1e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0354  adenylate kinase  70.37 
 
 
222 aa  313  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0648  adenylate kinase  70.89 
 
 
214 aa  313  9.999999999999999e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0373092  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1111  adenylate kinase  70.7 
 
 
216 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4111  adenylate kinase  70.7 
 
 
216 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3212  adenylate kinase  69.59 
 
 
217 aa  305  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1506  adenylate kinase  70.23 
 
 
216 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.614097  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4216  adenylate kinase  70.23 
 
 
216 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2066  adenylate kinase  68.54 
 
 
214 aa  303  1.0000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0055  adenylate kinase  68.66 
 
 
218 aa  302  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1256  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  68.2 
 
 
218 aa  301  4.0000000000000003e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.357832  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1551  adenylate kinase  68.06 
 
 
218 aa  301  5.000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399055  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2308  adenylate kinase  68.06 
 
 
218 aa  301  5.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00367216  normal  0.15407 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2561  adenylate kinase  68.52 
 
 
218 aa  301  7.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.072453  decreased coverage  0.00219618 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1452  adenylate kinase  67.76 
 
 
215 aa  300  8.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2638  adenylate kinase  70.73 
 
 
218 aa  299  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.517304  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3359  adenylate kinase  68.22 
 
 
215 aa  299  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848875  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16700  adenylate kinase  67.29 
 
 
215 aa  299  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.528673  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2952  adenylate kinase  77.42 
 
 
218 aa  298  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1070  adenylate kinase  66.05 
 
 
216 aa  296  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.283029  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1509  adenylate kinase  68.22 
 
 
215 aa  296  2e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39280  Adenylate kinase  66.82 
 
 
215 aa  295  4e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0857  adenylate kinase  66.36 
 
 
218 aa  295  5e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1784  adenylate kinase  66.82 
 
 
219 aa  293  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0535  adenylate kinase  64.71 
 
 
221 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2488  adenylate kinase  68.98 
 
 
217 aa  292  3e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317591  normal  0.964457 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0763  adenylate kinase  65.16 
 
 
221 aa  291  4e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758811  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1256  adenylate kinase  67.74 
 
 
219 aa  291  4e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1854  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1504  adenylate kinase  66.2 
 
 
217 aa  291  5e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.179397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3567  adenylate kinase  75.82 
 
 
218 aa  291  7e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00563334  normal  0.0126858 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4895  adenylate kinase  66.2 
 
 
218 aa  290  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.351979 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2558  adenylate kinase  68.06 
 
 
217 aa  290  1e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00195471 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0927  adenylate kinase  65 
 
 
220 aa  289  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0572  adenylate kinase  65 
 
 
220 aa  289  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148537  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2277  adenylate kinase  65 
 
 
220 aa  289  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00000360285  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1319  adenylate kinase  66.82 
 
 
215 aa  289  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.176093  hitchhiker  0.00352848 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1049  adenylate kinase  65 
 
 
220 aa  289  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000082609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1080  adenylate kinase  65 
 
 
220 aa  289  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0446063  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0739  adenylate kinase  65 
 
 
220 aa  289  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139033  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0924  adenylate kinase  65 
 
 
220 aa  289  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.123931  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0281  adenylate kinase  64.71 
 
 
221 aa  290  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2154  adenylate kinase  65 
 
 
220 aa  289  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.181354  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0748  adenylate kinase  65.45 
 
 
220 aa  289  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.468478 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2404  adenylate kinase  64.25 
 
 
222 aa  288  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1920  adenylate kinase  66.67 
 
 
218 aa  288  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5879  adenylate kinase  65.45 
 
 
220 aa  288  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276122  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3158  adenylate kinase  67.13 
 
 
218 aa  288  4e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.350521  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2235  adenylate kinase  65.9 
 
 
218 aa  288  4e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00391254  hitchhiker  0.0000168537 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3199  adenylate kinase  64.25 
 
 
221 aa  287  6e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0532  adenylate kinase  64.71 
 
 
221 aa  287  8e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00589344  hitchhiker  0.0000489496 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2810  adenylate kinase  63.8 
 
 
222 aa  287  9e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0112016  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0590  adenylate kinase  64.25 
 
 
221 aa  287  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.012564  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0309  adenylate kinase  64.25 
 
 
221 aa  286  1e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>