More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2513 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2513  adenylate kinase  100 
 
 
217 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1736  adenylate kinase  96.76 
 
 
217 aa  424  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0382  adenylate kinase  96.76 
 
 
217 aa  424  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0781  adenylate kinase  76.17 
 
 
218 aa  336  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0306  adenylate kinase  70.89 
 
 
213 aa  311  4.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  58.14 
 
 
216 aa  260  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  58.69 
 
 
216 aa  255  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  57.67 
 
 
216 aa  254  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1332  adenylate kinase  58.6 
 
 
215 aa  247  9e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.376737 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  53.95 
 
 
224 aa  239  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0276  adenylate kinase  58.22 
 
 
193 aa  236  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0464579  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3554  adenylate kinase  53.05 
 
 
229 aa  229  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0613  adenylate kinase  59.15 
 
 
191 aa  228  6e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2797  adenylate kinase  54.46 
 
 
219 aa  226  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5595  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1270  adenylate kinase  52.31 
 
 
216 aa  224  6e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  52.11 
 
 
213 aa  221  8e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  51.16 
 
 
214 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  48.6 
 
 
219 aa  216  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0509  adenylate kinase  49.77 
 
 
229 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.131893 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  49.53 
 
 
227 aa  211  5.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  48.37 
 
 
215 aa  208  6e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  46.98 
 
 
423 aa  206  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  50.72 
 
 
214 aa  206  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  50.72 
 
 
214 aa  204  8e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2231  adenylate kinases  46.95 
 
 
229 aa  202  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603171  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0578  adenylate kinase  46.95 
 
 
217 aa  202  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  48.36 
 
 
214 aa  202  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2380  adenylate kinase  45.79 
 
 
215 aa  202  4e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000961521  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  51.64 
 
 
205 aa  201  5e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0270  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  45.71 
 
 
211 aa  201  6e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  47.39 
 
 
217 aa  201  6e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0348  adenylate kinase  47.89 
 
 
218 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0290027  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2690  adenylate kinase  47.42 
 
 
216 aa  201  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0518  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  47.89 
 
 
220 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108305  unclonable  0.0000000000175387 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  45.12 
 
 
215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  45.54 
 
 
216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  45.58 
 
 
215 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  46.26 
 
 
220 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  44.19 
 
 
217 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1117  adenylate kinase  46.01 
 
 
218 aa  194  6e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.018146  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  44.6 
 
 
219 aa  195  6e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  46.89 
 
 
213 aa  194  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  45.58 
 
 
217 aa  193  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  48.36 
 
 
216 aa  193  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  44.55 
 
 
214 aa  193  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  46.41 
 
 
213 aa  192  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  45.63 
 
 
217 aa  192  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  45.07 
 
 
215 aa  192  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  46.38 
 
 
217 aa  192  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  45.07 
 
 
213 aa  191  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  41.59 
 
 
215 aa  191  8e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0974  adenylate kinase  43.19 
 
 
214 aa  190  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  45.54 
 
 
217 aa  190  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  45.15 
 
 
217 aa  190  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  47.8 
 
 
211 aa  189  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3003  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  47.66 
 
 
222 aa  189  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.192004  hitchhiker  0.00720085 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  41.12 
 
 
215 aa  189  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  41.12 
 
 
215 aa  189  2e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1273  adenylate kinase  44.13 
 
 
217 aa  189  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1164  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  46.05 
 
 
226 aa  187  8e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000123796  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4935  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  45.33 
 
 
218 aa  187  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000314171  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1886  adenylate kinase  42.06 
 
 
218 aa  187  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00135603  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0954  adenylate kinase  47.71 
 
 
214 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1976  adenylate kinase  43.52 
 
 
215 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0593  adenylate kinase  47.71 
 
 
214 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0533  adenylate kinase  47.71 
 
 
214 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0539  adenylate kinase  47.71 
 
 
214 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.263643  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0534  adenylate kinase  47.71 
 
 
214 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0550  adenylate kinase  47.71 
 
 
214 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.186562  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1139  adenylate kinase  46.79 
 
 
214 aa  185  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.498003  unclonable  0.0000000226015 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0566  adenylate kinase  47.25 
 
 
234 aa  185  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0567733  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1774  adenylate kinase  46.76 
 
 
188 aa  185  5e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  0.285476 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  49.3 
 
 
194 aa  184  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00425  adenylate kinase  47.25 
 
 
214 aa  184  7e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3136  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  47.25 
 
 
214 aa  184  7e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0518  adenylate kinase  47.25 
 
 
214 aa  184  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0222194  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00430  hypothetical protein  47.25 
 
 
214 aa  184  7e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4005  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  46.01 
 
 
226 aa  184  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000986709  hitchhiker  0.0000175975 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0513  adenylate kinase  47.25 
 
 
214 aa  184  7e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0406  adenylate kinase  47.25 
 
 
214 aa  184  7e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.395771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3142  adenylate kinase  47.25 
 
 
214 aa  184  7e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.207455  normal  0.0239561 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0551  adenylate kinase  47.25 
 
 
214 aa  184  7e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0980412  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  43.46 
 
 
217 aa  184  8e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  42.79 
 
 
217 aa  184  8e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  44.81 
 
 
217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1635  adenylate kinase  47.37 
 
 
189 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205693  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2039  Adenylate kinase  45.97 
 
 
214 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1954  Adenylate kinase  46.01 
 
 
214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1361  adenylate kinase  48.36 
 
 
224 aa  182  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3035  adenylate kinase  45.37 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  41.23 
 
 
216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  41.23 
 
 
216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  43.46 
 
 
217 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1925  adenylate kinase  45.07 
 
 
214 aa  181  7e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1932  adenylate kinase  45.97 
 
 
214 aa  181  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1024  adenylate kinase  44.95 
 
 
214 aa  181  8.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  43.69 
 
 
217 aa  180  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0311  adenylate kinase  42.13 
 
 
217 aa  180  1e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000173731  unclonable  2.3199200000000003e-28 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  43.69 
 
 
217 aa  180  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  42.51 
 
 
217 aa  181  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>