More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0306 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0306  adenylate kinase  100 
 
 		 213 aa  427  1e-119  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0781  adenylate kinase  74.18 
 
 		 218 aa  328  4e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0382  adenylate kinase  71.36 
 
 		 217 aa  315  5e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1736  adenylate kinase  71.36 
 
 		 217 aa  315  5e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2513  adenylate kinase  70.89 
 
 		 217 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  57.28 
 
 		 216 aa  248  4e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0613  adenylate kinase  66.36 
 
 		 191 aa  247  9e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  55.4 
 
 		 216 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3554  adenylate kinase  55.24 
 
 		 229 aa  235  3e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0276  adenylate kinase  59.24 
 
 		 193 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0464579  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  54.67 
 
 		 216 aa  233  2.0000000000000002e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1332  adenylate kinase  57.01 
 
 		 215 aa  231  7.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.376737 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  51.64 
 
 		 213 aa  223  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1270  adenylate kinase  53.05 
 
 		 216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  51.64 
 
 		 224 aa  218  7e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  48.83 
 
 		 227 aa  210  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2797  adenylate kinase  52.8 
 
 		 219 aa  209  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5595  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  48.83 
 
 		 214 aa  208  5e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  48.83 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0509  adenylate kinase  49.53 
 
 		 229 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.131893 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  49.3 
 
 		 215 aa  205  5e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0578  adenylate kinase  49.28 
 
 		 217 aa  204  7e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2231  adenylate kinases  49.28 
 
 		 229 aa  204  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  48.83 
 
 		 214 aa  201  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  49.77 
 
 		 216 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  48.36 
 
 		 214 aa  199  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  46.48 
 
 		 214 aa  198  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  47.32 
 
 		 423 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  43.93 
 
 		 219 aa  196  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1635  adenylate kinase  50.23 
 
 		 189 aa  196  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205693  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1774  adenylate kinase  50.47 
 
 		 188 aa  196  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  0.285476 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  47.8 
 
 		 211 aa  192  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  46.01 
 
 		 213 aa  193  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  45.07 
 
 		 213 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  45.07 
 
 		 216 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  45.33 
 
 		 215 aa  190  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0270  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  44.76 
 
 		 211 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  46.26 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  43.46 
 
 		 217 aa  189  4e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  44.6 
 
 		 217 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  49.77 
 
 		 194 aa  186  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  43.19 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  45.07 
 
 		 217 aa  185  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  42.72 
 
 		 215 aa  184  6e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1117  adenylate kinase  44.39 
 
 		 218 aa  184  8e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.018146  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  41.31 
 
 		 217 aa  184  9e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  44.13 
 
 		 215 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  43.66 
 
 		 217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  44.13 
 
 		 217 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  43.19 
 
 		 217 aa  182  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1164  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  45.33 
 
 		 226 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000123796  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  47.44 
 
 		 205 aa  181  9.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  45.45 
 
 		 222 aa  180  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  42.52 
 
 		 217 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  40.65 
 
 		 215 aa  179  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  43.93 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1024  adenylate kinase  45.87 
 
 		 214 aa  179  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2380  adenylate kinase  40.65 
 
 		 215 aa  180  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000961521  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1398  adenylate kinase  41.12 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0974  adenylate kinase  42.58 
 
 		 214 aa  178  4e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2690  adenylate kinase  43.19 
 
 		 216 aa  179  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3035  adenylate kinase  43.58 
 
 		 214 aa  178  4.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  41.12 
 
 		 219 aa  178  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4005  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  45.54 
 
 		 226 aa  178  7e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000986709  hitchhiker  0.0000175975 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1784  adenylate kinase  46.61 
 
 		 219 aa  177  8e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  43.66 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  41.78 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  43.66 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1139  adenylate kinase  44.04 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.498003  unclonable  0.0000000226015 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  40.19 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  40.19 
 
 		 215 aa  176  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2893  adenylate kinase  44.04 
 
 		 214 aa  175  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1886  adenylate kinase  41.12 
 
 		 218 aa  175  4e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00135603  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1273  adenylate kinase  43.41 
 
 		 217 aa  174  6e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  41.78 
 
 		 214 aa  174  8e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1080  adenylate kinase  43.58 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0593  adenylate kinase  48.4 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1452  adenylate kinase  43.38 
 
 		 215 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0534  adenylate kinase  48.4 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0539  adenylate kinase  48.4 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.263643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0550  adenylate kinase  48.4 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.186562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0533  adenylate kinase  48.4 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  42.25 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  49.07 
 
 		 199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0769  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  42.25 
 
 		 215 aa  173  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.8085  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3003  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  44.81 
 
 		 222 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.192004  hitchhiker  0.00720085 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2157  adenylate kinase  46.48 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140182  normal  0.776532 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  40.38 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0566  adenylate kinase  48.13 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0567733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39280  Adenylate kinase  44.75 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2058  adenylate kinase  45.66 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000332952  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1977  adenylate kinase  45.97 
 
 		 194 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3136  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  48.13 
 
 		 214 aa  171  5e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0348  adenylate kinase  42.25 
 
 		 218 aa  171  5e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0290027  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0518  adenylate kinase  48.13 
 
 		 214 aa  171  5e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0222194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0513  adenylate kinase  48.13 
 
 		 214 aa  171  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3142  adenylate kinase  48.13 
 
 		 214 aa  171  5e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.207455  normal  0.0239561 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0551  adenylate kinase  48.13 
 
 		 214 aa  171  5e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0980412  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00430  hypothetical protein  48.13 
 
 		 214 aa  171  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16700  adenylate kinase  42.92 
 
 		 215 aa  172  5e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.528673  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>