More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0276 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0276  adenylate kinase  100 
 
 		 193 aa  390  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0464579  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0613  adenylate kinase  69.31 
 
 		 191 aa  255  2e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0781  adenylate kinase  58.77 
 
 		 218 aa  238  4e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2513  adenylate kinase  58.22 
 
 		 217 aa  236  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0306  adenylate kinase  59.24 
 
 		 213 aa  234  8e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0382  adenylate kinase  56.81 
 
 		 217 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1736  adenylate kinase  56.81 
 
 		 217 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  60.85 
 
 		 194 aa  223  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  49.76 
 
 		 216 aa  202  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1774  adenylate kinase  55.26 
 
 		 188 aa  202  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  0.285476 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4777  adenylate kinase  53.93 
 
 		 195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000251656 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  53.93 
 
 		 205 aa  194  8.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  50.81 
 
 		 193 aa  192  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  48.34 
 
 		 216 aa  192  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2667  adenylate kinase  51.31 
 
 		 195 aa  192  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  51.85 
 
 		 194 aa  191  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  51.85 
 
 		 194 aa  191  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3163  adenylate kinase  51.05 
 
 		 360 aa  190  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1977  adenylate kinase  52.38 
 
 		 194 aa  190  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  51.89 
 
 		 367 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2797  adenylate kinase  50.7 
 
 		 219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5595  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  47.39 
 
 		 216 aa  187  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1385  adenylate kinase  51.58 
 
 		 206 aa  188  5e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.365572 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1635  adenylate kinase  52.15 
 
 		 189 aa  188  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205693  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  51.31 
 
 		 199 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2316  adenylate kinase  51.32 
 
 		 341 aa  187  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210297  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  50 
 
 		 192 aa  186  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2143  adenylate kinase  48.42 
 
 		 200 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1566  adenylate kinase  49.21 
 
 		 208 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0263556  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1332  adenylate kinase  48.11 
 
 		 215 aa  182  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.376737 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1375  adenylate kinase  49.74 
 
 		 193 aa  182  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465911  normal  0.134274 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  48.42 
 
 		 200 aa  180  9.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  47.89 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2180  adenylate kinase  48.42 
 
 		 200 aa  180  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.251193 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2458  adenylate kinase  48.42 
 
 		 200 aa  180  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3554  adenylate kinase  45.07 
 
 		 229 aa  178  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2598  adenylate kinase  47.09 
 
 		 191 aa  177  9e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.179524  normal  0.692202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  48.95 
 
 		 309 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  45.02 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0719  adenylate kinase  48.68 
 
 		 192 aa  175  3e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.428193  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1846  adenylate kinase  46.28 
 
 		 197 aa  175  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  47.29 
 
 		 214 aa  173  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1139  adenylate kinase  46.3 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.498003  unclonable  0.0000000226015 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0954  adenylate kinase  46.3 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  45.95 
 
 		 187 aa  171  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0783  adenylate kinase  47.62 
 
 		 205 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3194  adenylate kinase  46.3 
 
 		 214 aa  171  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.804867  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3054  adenylate kinase  46.3 
 
 		 214 aa  171  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2894  adenylate kinase  46.3 
 
 		 214 aa  171  9e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.290073  normal  0.0817579 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1024  adenylate kinase  44.44 
 
 		 214 aa  170  9e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1270  adenylate kinase  45.75 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0566  adenylate kinase  45.83 
 
 		 234 aa  170  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0567733  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3035  adenylate kinase  43.06 
 
 		 214 aa  170  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00425  adenylate kinase  45.83 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3136  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  45.83 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0406  adenylate kinase  45.83 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.395771  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3142  adenylate kinase  45.83 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.207455  normal  0.0239561 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0551  adenylate kinase  45.83 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0980412  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00430  hypothetical protein  45.83 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02588  adenylate kinase  47.59 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0513  adenylate kinase  45.83 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0518  adenylate kinase  45.83 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0222194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  43.6 
 
 		 214 aa  169  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0533  adenylate kinase  45.37 
 
 		 214 aa  168  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0593  adenylate kinase  45.37 
 
 		 214 aa  168  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0539  adenylate kinase  45.37 
 
 		 214 aa  168  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.263643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6306  adenylate kinase  48.65 
 
 		 192 aa  168  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0534  adenylate kinase  45.37 
 
 		 214 aa  168  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0550  adenylate kinase  45.37 
 
 		 214 aa  168  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.186562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1974  adenylate kinase  43.62 
 
 		 183 aa  167  6e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  43.72 
 
 		 189 aa  167  8e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  44.71 
 
 		 224 aa  167  8e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0240  adenylate kinase  44.74 
 
 		 187 aa  167  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  44.34 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  43.69 
 
 		 211 aa  166  1e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1080  adenylate kinase  43.06 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  45.41 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0210  adenylate kinase  44.21 
 
 		 187 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.389912  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2893  adenylate kinase  42.13 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  43.96 
 
 		 213 aa  164  5e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  43.13 
 
 		 217 aa  164  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0357  adenylate kinase  42.86 
 
 		 183 aa  163  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.867099 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3231  adenylate kinase  42.4 
 
 		 214 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103733  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3427  adenylate kinase  49.21 
 
 		 335 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5094  adenylate kinase  42 
 
 		 202 aa  162  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1311  adenylate kinase  44.27 
 
 		 195 aa  161  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  43.81 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2886  adenylate kinase  44.15 
 
 		 183 aa  162  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.132721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  40.78 
 
 		 423 aa  160  9e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1088  adenylate kinase  45.16 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.670242  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1256  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  43.46 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.357832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2157  adenylate kinase  45.63 
 
 		 208 aa  158  5e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140182  normal  0.776532 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  43 
 
 		 214 aa  158  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  40.95 
 
 		 215 aa  157  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  41.31 
 
 		 213 aa  157  6e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1784  adenylate kinase  45.5 
 
 		 219 aa  158  6e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0420  adenylate kinase  40.93 
 
 		 190 aa  157  8e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01105  adenylate kinase  42.59 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0578  adenylate kinase  42.45 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2231  adenylate kinases  42.45 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603171  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>