More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1929 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  100 
 
 		 199 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  88.44 
 
 		 199 aa  343  8.999999999999999e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2143  adenylate kinase  81.03 
 
 		 200 aa  306  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2458  adenylate kinase  77.89 
 
 		 200 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2180  adenylate kinase  77.89 
 
 		 200 aa  304  7e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.251193 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  79.35 
 
 		 200 aa  294  7e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  68.06 
 
 		 193 aa  268  5e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1375  adenylate kinase  68.23 
 
 		 193 aa  261  4.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465911  normal  0.134274 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4777  adenylate kinase  67.02 
 
 		 195 aa  255  3e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000251656 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1385  adenylate kinase  65.62 
 
 		 206 aa  253  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.365572 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  66.3 
 
 		 309 aa  249  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1566  adenylate kinase  63.1 
 
 		 208 aa  244  8e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0263556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0783  adenylate kinase  65.03 
 
 		 205 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  63.45 
 
 		 367 aa  241  5e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3163  adenylate kinase  62.37 
 
 		 360 aa  241  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2316  adenylate kinase  62.89 
 
 		 341 aa  240  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210297  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  59.69 
 
 		 194 aa  234  6e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  59.69 
 
 		 194 aa  234  6e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1977  adenylate kinase  59.69 
 
 		 194 aa  234  8e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  60.21 
 
 		 192 aa  231  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3427  adenylate kinase  63.87 
 
 		 335 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  59.69 
 
 		 194 aa  228  4e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0719  adenylate kinase  57.07 
 
 		 192 aa  219  3e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.428193  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2667  adenylate kinase  56.84 
 
 		 195 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6306  adenylate kinase  55.98 
 
 		 192 aa  207  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  57.59 
 
 		 205 aa  207  9e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  52.31 
 
 		 216 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  51.85 
 
 		 216 aa  206  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  49.51 
 
 		 213 aa  197  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  47.22 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  49.54 
 
 		 216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1635  adenylate kinase  52.36 
 
 		 189 aa  192  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205693  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  46.05 
 
 		 220 aa  192  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20660  Adenylate kinase  52.11 
 
 		 193 aa  187  8e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.598531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  46.48 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  47.66 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1270  adenylate kinase  48.36 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  48.19 
 
 		 187 aa  186  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  46.36 
 
 		 227 aa  186  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  47.55 
 
 		 214 aa  184  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4486  adenylate kinase  50.52 
 
 		 204 aa  184  8e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1332  adenylate kinase  46.95 
 
 		 215 aa  182  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.376737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1047  adenylate kinase  48.19 
 
 		 181 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275542  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1075  adenylate kinase  48.19 
 
 		 181 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  49.76 
 
 		 219 aa  181  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1063  adenylate kinase  48.19 
 
 		 181 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.67008  normal  0.276891 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  46.23 
 
 		 222 aa  180  9.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  48.56 
 
 		 216 aa  180  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0276  adenylate kinase  47.89 
 
 		 193 aa  180  1e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0464579  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1348  adenylate kinase  48.7 
 
 		 181 aa  180  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0240  adenylate kinase  48.17 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  49.75 
 
 		 217 aa  179  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2797  adenylate kinase  46.98 
 
 		 219 aa  179  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5595  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  44.19 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  45.37 
 
 		 216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2157  adenylate kinase  51.31 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140182  normal  0.776532 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  44.19 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1344  adenylate kinase  46.35 
 
 		 213 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12518  predicted protein  45.75 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.966257  normal  0.823549 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23590  Adenylate kinase  48.44 
 
 		 201 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  46.57 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0210  adenylate kinase  48.17 
 
 		 187 aa  178  4e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.389912  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  48.11 
 
 		 189 aa  176  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  43.87 
 
 		 213 aa  176  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  43.4 
 
 		 215 aa  175  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5021  adenylate kinase  46.11 
 
 		 187 aa  175  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  45.19 
 
 		 217 aa  175  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  43.26 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2632  adenylate kinase  49.18 
 
 		 192 aa  173  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1774  adenylate kinase  48.13 
 
 		 188 aa  174  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  0.285476 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3554  adenylate kinase  46.53 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3884  adenylate kinase  48.37 
 
 		 191 aa  173  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05122  Adenylate kinase 1 (AK 1)(EC 2.7.4.3)(ATP-AMP transphosphorylase 1)(Adenylate kinase cytosolic and mitochondrial) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B2V8]  46.19 
 
 		 259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  43.75 
 
 		 217 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0838  adenylate kinase  43.88 
 
 		 195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  44.12 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1311  adenylate kinase  44.33 
 
 		 195 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  43.72 
 
 		 216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0126  adenylate kinase  44.19 
 
 		 216 aa  171  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000253561  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16960  Adenylate kinase  49.18 
 
 		 205 aa  171  5e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.466629  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  39.62 
 
 		 216 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  39.62 
 
 		 216 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1140  adenylate kinase  42.72 
 
 		 208 aa  171  6.999999999999999e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000592914  normal  0.025222 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1070  adenylate kinase  50 
 
 		 216 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.283029  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  43.27 
 
 		 214 aa  171  9e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0131  adenylate kinase  43.72 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000156427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0127  adenylate kinase  43.72 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000429626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0125  adenylate kinase  43.72 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0141617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0131  adenylate kinase  43.72 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000118062  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  44.81 
 
 		 217 aa  170  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0144  adenylate kinase  43.72 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.24496e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0131  adenylate kinase  43.72 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000890423  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  41.01 
 
 		 219 aa  170  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5174  adenylate kinase  43.72 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000620291  unclonable  1.1738e-25 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0613  adenylate kinase  48.66 
 
 		 191 aa  169  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0162  adenylate kinase  43.72 
 
 		 216 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0152  adenylate kinase  43.72 
 
 		 216 aa  169  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00506864  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6593  adenylate kinase  44.56 
 
 		 183 aa  169  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0509  adenylate kinase  45.67 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.131893 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2667  adenylate kinase  45.16 
 
 		 192 aa  169  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>