More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0332 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  100 
 
 
199 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  88.44 
 
 
199 aa  343  8.999999999999999e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2143  adenylate kinase  80 
 
 
200 aa  305  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2180  adenylate kinase  76.88 
 
 
200 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.251193 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2458  adenylate kinase  76.88 
 
 
200 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  76.96 
 
 
200 aa  295  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  67.02 
 
 
193 aa  270  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4777  adenylate kinase  68.59 
 
 
195 aa  263  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000251656 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1385  adenylate kinase  67.54 
 
 
206 aa  255  3e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.365572 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1375  adenylate kinase  65.97 
 
 
193 aa  254  5e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465911  normal  0.134274 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1566  adenylate kinase  64.92 
 
 
208 aa  252  3e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0263556  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  64.95 
 
 
309 aa  251  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3163  adenylate kinase  64.95 
 
 
360 aa  245  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2316  adenylate kinase  65.46 
 
 
341 aa  245  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210297  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  64.06 
 
 
192 aa  245  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  62.83 
 
 
194 aa  243  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  62.83 
 
 
194 aa  243  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1977  adenylate kinase  62.83 
 
 
194 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  65.78 
 
 
367 aa  240  9e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0783  adenylate kinase  64.17 
 
 
205 aa  234  7e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3427  adenylate kinase  62.05 
 
 
335 aa  228  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  59.69 
 
 
194 aa  228  5e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  59.38 
 
 
205 aa  214  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2667  adenylate kinase  54.45 
 
 
195 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0719  adenylate kinase  57.59 
 
 
192 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.428193  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  53 
 
 
216 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6306  adenylate kinase  56.54 
 
 
192 aa  208  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  50.46 
 
 
216 aa  202  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  50.46 
 
 
216 aa  201  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  48.36 
 
 
213 aa  197  9e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  50.7 
 
 
224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  47.44 
 
 
227 aa  192  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  48.58 
 
 
214 aa  189  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1635  adenylate kinase  52.88 
 
 
189 aa  189  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205693  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  46.51 
 
 
220 aa  188  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  50.23 
 
 
216 aa  188  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  50 
 
 
217 aa  188  5e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0276  adenylate kinase  51.31 
 
 
193 aa  187  5.999999999999999e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0464579  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2157  adenylate kinase  50.72 
 
 
208 aa  187  8e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140182  normal  0.776532 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  47.69 
 
 
219 aa  186  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  46.3 
 
 
217 aa  185  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1270  adenylate kinase  48.83 
 
 
216 aa  184  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0509  adenylate kinase  49.04 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.131893 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0578  adenylate kinase  47.42 
 
 
217 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  48.19 
 
 
187 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  47.22 
 
 
216 aa  182  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1332  adenylate kinase  47.89 
 
 
215 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.376737 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2231  adenylate kinases  47.42 
 
 
229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603171  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  47.14 
 
 
214 aa  181  5.0000000000000004e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4486  adenylate kinase  51.08 
 
 
204 aa  181  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  47.62 
 
 
214 aa  181  6e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  45.54 
 
 
213 aa  181  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2797  adenylate kinase  46.73 
 
 
219 aa  180  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5595  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  46.95 
 
 
217 aa  180  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3554  adenylate kinase  45.79 
 
 
229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20660  Adenylate kinase  50.26 
 
 
193 aa  179  2.9999999999999997e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.598531  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0240  adenylate kinase  49.48 
 
 
187 aa  178  4e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  46.7 
 
 
222 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0210  adenylate kinase  48.96 
 
 
187 aa  177  8e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.389912  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  45.5 
 
 
215 aa  177  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  47.57 
 
 
189 aa  176  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3884  adenylate kinase  49.2 
 
 
191 aa  175  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1348  adenylate kinase  47.12 
 
 
181 aa  175  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1140  adenylate kinase  44.17 
 
 
208 aa  174  7e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000592914  normal  0.025222 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  44.08 
 
 
211 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6459  adenylate kinase  45.97 
 
 
213 aa  174  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  43.4 
 
 
217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  43.33 
 
 
213 aa  172  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0306  adenylate kinase  49.07 
 
 
213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3212  adenylate kinase  45.95 
 
 
217 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1139  adenylate kinase  46.33 
 
 
214 aa  172  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.498003  unclonable  0.0000000226015 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  41.94 
 
 
219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2632  adenylate kinase  47.67 
 
 
192 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  43.72 
 
 
216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0126  adenylate kinase  44.19 
 
 
216 aa  171  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000253561  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1976  adenylate kinase  46.01 
 
 
215 aa  171  5e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1344  adenylate kinase  42.86 
 
 
213 aa  171  5.999999999999999e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  43.87 
 
 
214 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04190  Adenylate kinase  49.21 
 
 
184 aa  171  6.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0131  adenylate kinase  43.72 
 
 
216 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000156427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0127  adenylate kinase  43.72 
 
 
216 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000429626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0125  adenylate kinase  43.72 
 
 
216 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0141617  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1070  adenylate kinase  51.08 
 
 
216 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.283029  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0131  adenylate kinase  43.72 
 
 
216 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000118062  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0144  adenylate kinase  43.72 
 
 
216 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.24496e-61 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1784  adenylate kinase  45 
 
 
219 aa  171  7.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3035  adenylate kinase  45.21 
 
 
214 aa  170  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0131  adenylate kinase  43.72 
 
 
216 aa  170  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000890423  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  45.1 
 
 
423 aa  170  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0162  adenylate kinase  43.72 
 
 
216 aa  170  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5174  adenylate kinase  43.72 
 
 
216 aa  170  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000620291  unclonable  1.1738e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0152  adenylate kinase  43.72 
 
 
216 aa  170  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00506864  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  39.25 
 
 
216 aa  170  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  39.25 
 
 
216 aa  170  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1774  adenylate kinase  49.21 
 
 
188 aa  170  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  0.285476 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1024  adenylate kinase  46.79 
 
 
214 aa  169  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0613  adenylate kinase  51.31 
 
 
191 aa  169  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  42.72 
 
 
217 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  45.28 
 
 
217 aa  169  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  44.81 
 
 
217 aa  169  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>