More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1385 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1385  adenylate kinase  100 
 
 		 206 aa  407  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.365572 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1566  adenylate kinase  86.6 
 
 		 208 aa  337  5e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0263556  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3163  adenylate kinase  79.06 
 
 		 360 aa  306  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2316  adenylate kinase  77.49 
 
 		 341 aa  300  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210297  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  76.44 
 
 		 367 aa  293  9e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  75.39 
 
 		 309 aa  291  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3427  adenylate kinase  78.53 
 
 		 335 aa  283  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  66.49 
 
 		 200 aa  256  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  67.54 
 
 		 199 aa  255  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  65.62 
 
 		 199 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  64.4 
 
 		 193 aa  251  6e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2143  adenylate kinase  63.87 
 
 		 200 aa  244  8e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4777  adenylate kinase  65.97 
 
 		 195 aa  241  7.999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000251656 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1375  adenylate kinase  62.5 
 
 		 193 aa  238  2.9999999999999997e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465911  normal  0.134274 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2180  adenylate kinase  62.83 
 
 		 200 aa  237  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.251193 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2458  adenylate kinase  62.83 
 
 		 200 aa  237  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  61.78 
 
 		 192 aa  233  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  59.8 
 
 		 205 aa  229  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0783  adenylate kinase  60.82 
 
 		 205 aa  228  7e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1977  adenylate kinase  58.12 
 
 		 194 aa  224  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  58.12 
 
 		 194 aa  224  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  58.12 
 
 		 194 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0719  adenylate kinase  57.59 
 
 		 192 aa  213  9.999999999999999e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.428193  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2667  adenylate kinase  55.79 
 
 		 195 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6306  adenylate kinase  56.02 
 
 		 192 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  55.15 
 
 		 194 aa  204  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  49.54 
 
 		 224 aa  203  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  50.23 
 
 		 216 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1635  adenylate kinase  53.48 
 
 		 189 aa  198  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205693  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  48.37 
 
 		 216 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  50.23 
 
 		 216 aa  191  5e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  46.01 
 
 		 215 aa  189  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0276  adenylate kinase  51.58 
 
 		 193 aa  188  5.999999999999999e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0464579  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1270  adenylate kinase  49.3 
 
 		 216 aa  187  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  45.28 
 
 		 213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  45.07 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  46.7 
 
 		 214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  48.58 
 
 		 227 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  47.89 
 
 		 214 aa  179  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0509  adenylate kinase  47.2 
 
 		 229 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.131893 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1273  adenylate kinase  46.26 
 
 		 217 aa  178  4e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0578  adenylate kinase  46.73 
 
 		 217 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2231  adenylate kinases  46.73 
 
 		 229 aa  178  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1332  adenylate kinase  46.95 
 
 		 215 aa  177  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.376737 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  47.42 
 
 		 214 aa  177  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4092  adenylate kinase  45.99 
 
 		 190 aa  176  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  44.6 
 
 		 217 aa  176  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  43.4 
 
 		 216 aa  175  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  44.39 
 
 		 214 aa  174  8e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  44.76 
 
 		 423 aa  174  9e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  49.73 
 
 		 187 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02588  adenylate kinase  50 
 
 		 182 aa  173  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  46.15 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2513  adenylate kinase  47.44 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0613  adenylate kinase  51.31 
 
 		 191 aa  171  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0306  adenylate kinase  46.48 
 
 		 213 aa  171  6.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  41.1 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  45.19 
 
 		 217 aa  170  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1344  adenylate kinase  40.95 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  43.87 
 
 		 213 aa  170  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1736  adenylate kinase  45.16 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  42.65 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  44.23 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0382  adenylate kinase  45.16 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0055  adenylate kinase  42.53 
 
 		 218 aa  168  5e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3212  adenylate kinase  41.18 
 
 		 217 aa  168  6e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1140  adenylate kinase  44.17 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000592914  normal  0.025222 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  48.11 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2797  adenylate kinase  44.24 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5595  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3554  adenylate kinase  46.8 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  39.15 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  39.15 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1774  adenylate kinase  47.12 
 
 		 188 aa  166  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  0.285476 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  44.13 
 
 		 217 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1070  adenylate kinase  47.31 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.283029  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  44.86 
 
 		 217 aa  165  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  43.41 
 
 		 217 aa  165  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2235  adenylate kinase  42.34 
 
 		 218 aa  165  5e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00391254  hitchhiker  0.0000168537 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  43.19 
 
 		 219 aa  165  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0781  adenylate kinase  43.72 
 
 		 218 aa  164  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12518  predicted protein  41.98 
 
 		 240 aa  164  6.9999999999999995e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.966257  normal  0.823549 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  41.78 
 
 		 219 aa  164  9e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  42.52 
 
 		 214 aa  164  9e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1311  adenylate kinase  46.84 
 
 		 195 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20660  Adenylate kinase  47.89 
 
 		 193 aa  164  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.598531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0354  adenylate kinase  45.99 
 
 		 222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2533  adenylate kinase  45.99 
 
 		 222 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.154116 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  41.78 
 
 		 214 aa  162  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  45.63 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  42.93 
 
 		 217 aa  162  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6459  adenylate kinase  43.27 
 
 		 213 aa  162  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1319  adenylate kinase  42.66 
 
 		 215 aa  162  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.176093  hitchhiker  0.00352848 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0710  adenylate kinase  47.37 
 
 		 184 aa  162  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000807977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4486  adenylate kinase  45.64 
 
 		 204 aa  162  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2404  adenylate kinase  45.74 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0419  adenylate kinase  47 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0590  adenylate kinase  45.21 
 
 		 221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.012564  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0240  adenylate kinase  47.06 
 
 		 187 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2810  adenylate kinase  45.74 
 
 		 222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0112016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1063  adenylate kinase  46.99 
 
 		 181 aa  161  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.67008  normal  0.276891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>