More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3302 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  100 
 
 
187 aa  366  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02588  adenylate kinase  75.56 
 
 
182 aa  270  6e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0240  adenylate kinase  69.73 
 
 
187 aa  264  5e-70  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0210  adenylate kinase  69.73 
 
 
187 aa  263  8e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.389912  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2632  adenylate kinase  52.69 
 
 
192 aa  201  7e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  49.28 
 
 
217 aa  195  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3122  adenylate kinase  53.51 
 
 
192 aa  195  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  52.72 
 
 
205 aa  193  1e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  49.73 
 
 
189 aa  192  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20660  Adenylate kinase  52.22 
 
 
193 aa  191  4e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.598531  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2667  adenylate kinase  49.73 
 
 
192 aa  191  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23590  Adenylate kinase  50 
 
 
201 aa  191  6e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  50.26 
 
 
193 aa  190  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1774  adenylate kinase  51.08 
 
 
188 aa  189  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  0.285476 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4777  adenylate kinase  54.55 
 
 
195 aa  189  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000251656 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1992  adenylate kinase  50 
 
 
197 aa  189  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499697  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2955  adenylate kinase  50.27 
 
 
192 aa  189  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.913577  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0272  adenylate kinase  47.31 
 
 
186 aa  187  9e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  47.62 
 
 
219 aa  187  9e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1635  adenylate kinase  49.19 
 
 
189 aa  187  9e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205693  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1728  adenylate kinase  48.92 
 
 
186 aa  187  9e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0507539  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  46.05 
 
 
216 aa  186  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  49.48 
 
 
200 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1273  adenylate kinase  48.04 
 
 
217 aa  186  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0709  adenylate kinase  49.46 
 
 
191 aa  186  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  48.19 
 
 
199 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16960  Adenylate kinase  48.37 
 
 
205 aa  185  4e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.466629  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1348  adenylate kinase  52.97 
 
 
181 aa  185  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  46.08 
 
 
423 aa  184  5e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1375  adenylate kinase  50.8 
 
 
193 aa  184  6e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465911  normal  0.134274 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1148  adenylate kinase  48.65 
 
 
181 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2667  adenylate kinase  50.56 
 
 
195 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  51.34 
 
 
192 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  46.26 
 
 
224 aa  183  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  48.19 
 
 
199 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5021  adenylate kinase  51.89 
 
 
187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  52.41 
 
 
194 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  45.32 
 
 
215 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  51.34 
 
 
194 aa  182  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  51.34 
 
 
194 aa  182  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  43.19 
 
 
214 aa  182  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  42.92 
 
 
215 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1977  adenylate kinase  51.34 
 
 
194 aa  181  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2458  adenylate kinase  47.67 
 
 
200 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  44.61 
 
 
213 aa  181  6e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  48.97 
 
 
309 aa  181  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2180  adenylate kinase  47.67 
 
 
200 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.251193 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1311  adenylate kinase  47.22 
 
 
195 aa  180  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165933  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2143  adenylate kinase  46.63 
 
 
200 aa  180  1e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  45.59 
 
 
211 aa  180  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  44.5 
 
 
216 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1974  adenylate kinase  47.83 
 
 
183 aa  179  2e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3685  adenylate kinase  47.57 
 
 
184 aa  179  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00243015  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3396  adenylate kinase  48.62 
 
 
181 aa  179  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0507  adenylate kinase  45.62 
 
 
214 aa  178  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  50.8 
 
 
367 aa  178  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3884  adenylate kinase  46.49 
 
 
191 aa  178  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  42.72 
 
 
213 aa  177  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29530  Adenylate kinase  49.46 
 
 
194 aa  177  5.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.754676  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1075  adenylate kinase  50.27 
 
 
181 aa  177  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1504  adenylate kinase  45.91 
 
 
217 aa  177  5.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.179397 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2213  adenylate kinase  47.03 
 
 
186 aa  177  5.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04190  Adenylate kinase  46.74 
 
 
184 aa  177  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1047  adenylate kinase  50.27 
 
 
181 aa  177  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275542  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1063  adenylate kinase  50.27 
 
 
181 aa  177  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.67008  normal  0.276891 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3554  adenylate kinase  46.51 
 
 
229 aa  177  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16591  adenylate kinase  46.2 
 
 
186 aa  177  7e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.761674  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2039  Adenylate kinase  47.74 
 
 
214 aa  177  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  41.31 
 
 
214 aa  177  8e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10747  adenylate kinase  48.65 
 
 
181 aa  177  8e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.188337 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1256  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  44.8 
 
 
218 aa  177  9e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.357832  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  44.34 
 
 
214 aa  176  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4486  adenylate kinase  46.6 
 
 
204 aa  176  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1954  Adenylate kinase  47.09 
 
 
214 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1925  adenylate kinase  46.48 
 
 
214 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  44.81 
 
 
227 aa  176  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0631  adenylate kinase  47.85 
 
 
197 aa  176  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  44.5 
 
 
216 aa  176  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0648  adenylate kinase  48.11 
 
 
211 aa  175  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4092  adenylate kinase  44.39 
 
 
190 aa  176  3e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0608  adenylate kinase  47.09 
 
 
195 aa  175  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16700  adenylate kinase  45.41 
 
 
215 aa  175  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.528673  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1452  adenylate kinase  45.41 
 
 
215 aa  175  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1932  adenylate kinase  46.73 
 
 
214 aa  174  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0783  adenylate kinase  49.21 
 
 
205 aa  174  5e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  42.72 
 
 
213 aa  174  6e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1846  adenylate kinase  46.84 
 
 
197 aa  174  7e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6593  adenylate kinase  46.52 
 
 
183 aa  174  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  44.13 
 
 
217 aa  174  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1385  adenylate kinase  49.73 
 
 
206 aa  174  8e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.365572 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  41.23 
 
 
215 aa  174  8e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1070  adenylate kinase  43.38 
 
 
216 aa  174  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.283029  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1509  adenylate kinase  43.12 
 
 
215 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0357  adenylate kinase  47.78 
 
 
183 aa  173  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.867099 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1784  adenylate kinase  45.25 
 
 
219 aa  173  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6459  adenylate kinase  45.41 
 
 
213 aa  173  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  42.45 
 
 
213 aa  173  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3163  adenylate kinase  47.94 
 
 
360 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0281  adenylate kinase  42.22 
 
 
221 aa  172  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1566  adenylate kinase  48.63 
 
 
208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0263556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>