More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_29530 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_29530  Adenylate kinase  100 
 
 
194 aa  376  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.754676  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0608  adenylate kinase  76.29 
 
 
195 aa  291  4e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2632  adenylate kinase  69.84 
 
 
192 aa  251  4.0000000000000004e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0648  adenylate kinase  62.77 
 
 
211 aa  234  8e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20660  Adenylate kinase  58.33 
 
 
193 aa  219  9.999999999999999e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.598531  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  56.99 
 
 
189 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2667  adenylate kinase  56.02 
 
 
192 aa  209  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2955  adenylate kinase  56.32 
 
 
192 aa  209  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.913577  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3884  adenylate kinase  57.22 
 
 
191 aa  206  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3122  adenylate kinase  58.42 
 
 
192 aa  205  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0709  adenylate kinase  58.6 
 
 
191 aa  204  5e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1992  adenylate kinase  55.73 
 
 
197 aa  204  6e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499697  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23590  Adenylate kinase  55.38 
 
 
201 aa  200  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16960  Adenylate kinase  54.3 
 
 
205 aa  195  3e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.466629  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  50.93 
 
 
219 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0631  adenylate kinase  50.54 
 
 
197 aa  186  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1728  adenylate kinase  51.34 
 
 
186 aa  186  2e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0507539  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0272  adenylate kinase  49.73 
 
 
186 aa  185  3e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4486  adenylate kinase  51.02 
 
 
204 aa  184  6e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1107  adenylate kinase  47.93 
 
 
216 aa  184  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.211555 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4300  adenylate kinase  47.93 
 
 
217 aa  184  9e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0490  adenylate kinase  46.88 
 
 
374 aa  182  3e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6593  adenylate kinase  53.23 
 
 
183 aa  179  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  47.22 
 
 
217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  49.46 
 
 
187 aa  177  7e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  46.95 
 
 
217 aa  177  9e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04190  Adenylate kinase  52.41 
 
 
184 aa  177  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5021  adenylate kinase  54.55 
 
 
187 aa  174  6e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2886  adenylate kinase  48.11 
 
 
183 aa  174  9e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.132721  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0240  adenylate kinase  47.31 
 
 
187 aa  171  5e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1075  adenylate kinase  52.15 
 
 
181 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1047  adenylate kinase  52.15 
 
 
181 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275542  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1063  adenylate kinase  52.15 
 
 
181 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.67008  normal  0.276891 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0210  adenylate kinase  47.31 
 
 
187 aa  171  6.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.389912  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10747  adenylate kinase  51.61 
 
 
181 aa  171  6.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.188337 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  42.72 
 
 
217 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1348  adenylate kinase  54.01 
 
 
181 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0420  adenylate kinase  46.32 
 
 
190 aa  170  1e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3396  adenylate kinase  50 
 
 
181 aa  169  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05570  adenylate kinase  46.07 
 
 
367 aa  169  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  46.01 
 
 
217 aa  166  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  45.54 
 
 
217 aa  166  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3685  adenylate kinase  49.46 
 
 
184 aa  166  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00243015  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1311  adenylate kinase  44.79 
 
 
195 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165933  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2213  adenylate kinase  48.13 
 
 
186 aa  164  9e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0952  adenylate kinase  43.36 
 
 
225 aa  162  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02588  adenylate kinase  46.15 
 
 
182 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  44.7 
 
 
217 aa  161  5.0000000000000005e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2578  adenylate kinase  49.73 
 
 
184 aa  160  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  42.25 
 
 
214 aa  157  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2134  adenylate kinase  46.15 
 
 
208 aa  156  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.104545  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  43.58 
 
 
217 aa  155  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0710  adenylate kinase  47.59 
 
 
184 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000807977  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1148  adenylate kinase  47.31 
 
 
181 aa  154  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  42.2 
 
 
217 aa  154  9e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  45.5 
 
 
205 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  42.72 
 
 
211 aa  152  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0079  adenylate kinase  40.28 
 
 
212 aa  150  8.999999999999999e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000187867  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1974  adenylate kinase  42.63 
 
 
183 aa  150  8.999999999999999e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0521  adenylate kinase  40.53 
 
 
185 aa  150  8.999999999999999e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  38.46 
 
 
219 aa  150  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0216  adenylate kinase  45.6 
 
 
187 aa  150  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1117  adenylate kinase  40.09 
 
 
218 aa  149  2e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.018146  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  37.96 
 
 
215 aa  149  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  39.44 
 
 
216 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  39.44 
 
 
216 aa  149  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3722  adenylate kinase  46.41 
 
 
187 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0357  adenylate kinase  42.86 
 
 
183 aa  149  3e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.867099 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16591  adenylate kinase  41.8 
 
 
186 aa  148  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.761674  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1774  adenylate kinase  44.92 
 
 
188 aa  148  4e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  0.285476 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  38.68 
 
 
214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  38.97 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1886  adenylate kinase  39.25 
 
 
218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00135603  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2598  adenylate kinase  42.33 
 
 
191 aa  146  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.179524  normal  0.692202 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  43.62 
 
 
194 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  37.38 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2380  adenylate kinase  37.68 
 
 
215 aa  145  3e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000961521  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0974  adenylate kinase  39.15 
 
 
214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  38.97 
 
 
215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  38.6 
 
 
215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0276  adenylate kinase  40.44 
 
 
193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0464579  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23240  Adenylate kinase  41.06 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112414 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1140  adenylate kinase  41.06 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000592914  normal  0.025222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1937  adenylate kinase  44.51 
 
 
199 aa  145  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.119403 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  37.5 
 
 
215 aa  145  5e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6459  adenylate kinase  43.75 
 
 
213 aa  144  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  38.89 
 
 
216 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  44.32 
 
 
199 aa  144  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  39.02 
 
 
423 aa  144  9e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1313  adenylate kinase  40.93 
 
 
220 aa  144  9e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000294373  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1373  adenylate kinase  40.93 
 
 
220 aa  144  9e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000458386  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  43.15 
 
 
309 aa  143  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0783  adenylate kinase  41.41 
 
 
205 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0791  adenylate kinase  37.57 
 
 
194 aa  143  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0615  adenylate kinase  38.54 
 
 
188 aa  143  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000660087  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2157  adenylate kinase  42.23 
 
 
208 aa  142  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140182  normal  0.776532 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  36.74 
 
 
215 aa  142  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  38.5 
 
 
213 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2143  adenylate kinase  41.84 
 
 
200 aa  142  4e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3381  adenylate kinase  39.36 
 
 
189 aa  141  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>