More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05570 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_05570  adenylate kinase  100 
 
 
367 aa  745    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0490  adenylate kinase  55.01 
 
 
374 aa  423  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0420  adenylate kinase  59.47 
 
 
190 aa  230  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0838  adenylate kinase  56.84 
 
 
195 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4092  adenylate kinase  53.19 
 
 
190 aa  204  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5094  adenylate kinase  51.01 
 
 
202 aa  199  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3381  adenylate kinase  51.32 
 
 
189 aa  194  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0791  adenylate kinase  45.79 
 
 
194 aa  185  1.0000000000000001e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3396  adenylate kinase  47.59 
 
 
181 aa  185  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0068  adenylate kinase  50 
 
 
200 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0521  adenylate kinase  45.26 
 
 
185 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0421  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  47.4 
 
 
176 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3685  adenylate kinase  48.11 
 
 
184 aa  175  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00243015  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1311  adenylate kinase  43.68 
 
 
195 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165933  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1774  adenylate kinase  44.39 
 
 
188 aa  172  6.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  0.285476 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1148  adenylate kinase  47.03 
 
 
181 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3884  adenylate kinase  43.55 
 
 
191 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16960  Adenylate kinase  44.39 
 
 
205 aa  171  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.466629  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23590  Adenylate kinase  45.41 
 
 
201 aa  170  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5021  adenylate kinase  48.66 
 
 
187 aa  169  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2955  adenylate kinase  43.85 
 
 
192 aa  169  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.913577  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  43.19 
 
 
215 aa  170  5e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  43.78 
 
 
189 aa  169  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2667  adenylate kinase  43.85 
 
 
192 aa  169  6e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1348  adenylate kinase  48.13 
 
 
181 aa  169  6e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29530  Adenylate kinase  46.07 
 
 
194 aa  169  9e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.754676  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3003  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  41.12 
 
 
222 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.192004  hitchhiker  0.00720085 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1863  adenylate kinase  44.68 
 
 
389 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  42.03 
 
 
211 aa  167  2e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1992  adenylate kinase  42.63 
 
 
197 aa  168  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499697  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2213  adenylate kinase  42.78 
 
 
186 aa  167  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20660  Adenylate kinase  41.58 
 
 
193 aa  166  5.9999999999999996e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.598531  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6908  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.35 
 
 
181 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.146925 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0608  adenylate kinase  43.52 
 
 
195 aa  163  4.0000000000000004e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1728  adenylate kinase  46.11 
 
 
186 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0507539  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1974  adenylate kinase  44.97 
 
 
183 aa  163  5.0000000000000005e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  43.78 
 
 
187 aa  163  6e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  41.23 
 
 
216 aa  162  7e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  41.23 
 
 
216 aa  162  7e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04190  Adenylate kinase  43.92 
 
 
184 aa  162  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0266  hypothetical protein  40 
 
 
193 aa  162  8.000000000000001e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.500283 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0272  adenylate kinase  42.16 
 
 
186 aa  162  1e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1075  adenylate kinase  46.77 
 
 
181 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4486  adenylate kinase  42.41 
 
 
204 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1047  adenylate kinase  46.77 
 
 
181 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275542  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1063  adenylate kinase  46.77 
 
 
181 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.67008  normal  0.276891 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02588  adenylate kinase  42.08 
 
 
182 aa  160  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4300  adenylate kinase  40.76 
 
 
217 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6593  adenylate kinase  45.41 
 
 
183 aa  160  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5350  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  45.93 
 
 
184 aa  160  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10747  adenylate kinase  44.39 
 
 
181 aa  160  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.188337 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  39.32 
 
 
217 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0613  adenylate kinase  41.67 
 
 
191 aa  157  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1553  adenylate kinase  41.23 
 
 
218 aa  157  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.216762  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1107  adenylate kinase  39.52 
 
 
216 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.211555 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0710  adenylate kinase  42.78 
 
 
184 aa  156  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000807977  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  40.19 
 
 
215 aa  156  6e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2993  adenylate kinase  41.54 
 
 
191 aa  156  6e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2886  adenylate kinase  44.02 
 
 
183 aa  155  7e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.132721  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  39.89 
 
 
205 aa  155  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  41.71 
 
 
194 aa  155  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  40.87 
 
 
213 aa  155  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  38.39 
 
 
217 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2578  adenylate kinase  44.92 
 
 
184 aa  154  2e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23240  Adenylate kinase  40.78 
 
 
208 aa  154  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112414 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  38.86 
 
 
214 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  39.15 
 
 
217 aa  154  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  40.28 
 
 
214 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3122  adenylate kinase  42.39 
 
 
192 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  39.15 
 
 
219 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0276  adenylate kinase  41.58 
 
 
193 aa  153  4e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0464579  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2632  adenylate kinase  40.86 
 
 
192 aa  153  5e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2598  adenylate kinase  42.39 
 
 
191 aa  153  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.179524  normal  0.692202 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  39.62 
 
 
215 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1846  adenylate kinase  41.58 
 
 
197 aa  153  5.9999999999999996e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  39.81 
 
 
215 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  35.98 
 
 
224 aa  152  7e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  40.47 
 
 
215 aa  152  8e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0709  adenylate kinase  40.11 
 
 
191 aa  152  8e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  39.81 
 
 
217 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3722  adenylate kinase  41.27 
 
 
187 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0240  adenylate kinase  40 
 
 
187 aa  152  1e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  40.47 
 
 
215 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  40.47 
 
 
215 aa  151  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1001  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  40.28 
 
 
215 aa  151  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000583079  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3554  adenylate kinase  38.03 
 
 
229 aa  151  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2667  adenylate kinase  40.54 
 
 
195 aa  150  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  44.62 
 
 
217 aa  150  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0210  adenylate kinase  38.92 
 
 
187 aa  149  5e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.389912  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0044  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
179 aa  150  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.137994 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1361  adenylate kinase  37.38 
 
 
224 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1164  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  36.92 
 
 
226 aa  149  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000123796  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2134  adenylate kinase  40.1 
 
 
208 aa  149  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.104545  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23221  adenylate kinase  41.08 
 
 
182 aa  149  8e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4777  adenylate kinase  41.85 
 
 
195 aa  149  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000251656 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  38.1 
 
 
217 aa  149  9e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  35.35 
 
 
216 aa  149  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0270  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  41.88 
 
 
211 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  36.49 
 
 
217 aa  148  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  41.67 
 
 
216 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>