More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2134 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2134  adenylate kinase  100 
 
 
208 aa  408  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.104545  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1234  adenylate kinase  53.3 
 
 
215 aa  201  6e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  47.66 
 
 
215 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6459  adenylate kinase  50.24 
 
 
213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  51.42 
 
 
211 aa  199  3e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  48.58 
 
 
215 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  47.64 
 
 
217 aa  192  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  46.23 
 
 
217 aa  193  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1107  adenylate kinase  46.92 
 
 
216 aa  188  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.211555 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  45.28 
 
 
215 aa  188  5e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  43.19 
 
 
216 aa  187  8e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  43.19 
 
 
216 aa  187  8e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  43.87 
 
 
214 aa  187  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  44.5 
 
 
213 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1361  adenylate kinase  46.73 
 
 
224 aa  185  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0736  adenylate kinase  46.48 
 
 
222 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  44.02 
 
 
213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  45.75 
 
 
217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  45.58 
 
 
216 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  45.07 
 
 
217 aa  181  6e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4300  adenylate kinase  47.64 
 
 
217 aa  180  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3003  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  45.97 
 
 
222 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.192004  hitchhiker  0.00720085 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2893  adenylate kinase  44.95 
 
 
214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  42.06 
 
 
214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1088  adenylate kinase  46.58 
 
 
215 aa  178  4.999999999999999e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.670242  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  44.81 
 
 
217 aa  178  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  41.98 
 
 
215 aa  176  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  41.98 
 
 
215 aa  176  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1024  adenylate kinase  44.04 
 
 
214 aa  177  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  42.45 
 
 
215 aa  176  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  43.19 
 
 
214 aa  176  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1256  adenylate kinase  50 
 
 
219 aa  176  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1854  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0806  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  47.03 
 
 
218 aa  176  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.248046  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1373  adenylate kinase  45.75 
 
 
220 aa  176  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000458386  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1313  adenylate kinase  45.75 
 
 
220 aa  176  3e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000294373  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0769  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  41.15 
 
 
215 aa  175  4e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.8085  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  47.32 
 
 
219 aa  175  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0974  adenylate kinase  44.39 
 
 
214 aa  175  5e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2690  adenylate kinase  46.01 
 
 
216 aa  174  6e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  45.54 
 
 
217 aa  174  7e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0270  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  42.11 
 
 
211 aa  174  9e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  42.92 
 
 
214 aa  173  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3035  adenylate kinase  43.58 
 
 
214 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  41.98 
 
 
215 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  40.38 
 
 
217 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1553  adenylate kinase  41.94 
 
 
218 aa  172  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.216762  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0954  adenylate kinase  44.04 
 
 
214 aa  172  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2894  adenylate kinase  44.04 
 
 
214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.290073  normal  0.0817579 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01105  adenylate kinase  46.79 
 
 
214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.474153  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3054  adenylate kinase  44.04 
 
 
214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3194  adenylate kinase  44.04 
 
 
214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.804867  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4486  adenylate kinase  47.34 
 
 
204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  45.75 
 
 
214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  44.34 
 
 
217 aa  171  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2513  adenylate kinase  43.4 
 
 
217 aa  171  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1001  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  43.13 
 
 
215 aa  171  5e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000583079  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1139  adenylate kinase  43.12 
 
 
214 aa  171  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.498003  unclonable  0.0000000226015 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65737  Adenylate kinase (ATP-AMP transphosphorylase)  43.46 
 
 
249 aa  171  5.999999999999999e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1117  adenylate kinase  42.72 
 
 
218 aa  171  6.999999999999999e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.018146  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  43.4 
 
 
217 aa  171  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4005  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  43.06 
 
 
226 aa  171  9e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000986709  hitchhiker  0.0000175975 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3231  adenylate kinase  43.58 
 
 
214 aa  171  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.103733  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  43.66 
 
 
217 aa  171  9e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3359  adenylate kinase  45.87 
 
 
215 aa  170  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848875  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1164  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  42.72 
 
 
226 aa  170  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000123796  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3974  adenylate kinase  44.44 
 
 
210 aa  171  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1080  adenylate kinase  43.58 
 
 
214 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2066  adenylate kinase  47.93 
 
 
214 aa  169  2e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0566  adenylate kinase  44.04 
 
 
234 aa  169  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0567733  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2232  adenylate kinase  45.83 
 
 
217 aa  170  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1784  adenylate kinase  45.45 
 
 
219 aa  170  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  41.78 
 
 
213 aa  170  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0286  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  42.65 
 
 
211 aa  170  2e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000626987  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1557  adenylate kinase  42.99 
 
 
218 aa  169  3e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000621346  normal  0.163414 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1256  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  50 
 
 
218 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.357832  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0957  adenylate kinases  43.58 
 
 
214 aa  169  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833948  normal  0.567564 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  43.87 
 
 
217 aa  169  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0550  adenylate kinase  44.04 
 
 
214 aa  168  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.186562  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0539  adenylate kinase  44.04 
 
 
214 aa  168  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.263643  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1739  adenylate kinases  43.44 
 
 
218 aa  168  4e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000022686  normal  0.166056 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0534  adenylate kinase  44.04 
 
 
214 aa  168  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0533  adenylate kinase  44.04 
 
 
214 aa  168  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0593  adenylate kinase  44.04 
 
 
214 aa  168  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  44.34 
 
 
220 aa  169  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00425  adenylate kinase  44.04 
 
 
214 aa  168  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3136  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  44.04 
 
 
214 aa  168  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0513  adenylate kinase  44.04 
 
 
214 aa  168  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.18608  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0551  adenylate kinase  44.04 
 
 
214 aa  168  5e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0980412  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3142  adenylate kinase  44.04 
 
 
214 aa  168  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.207455  normal  0.0239561 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1070  adenylate kinase  45.21 
 
 
216 aa  168  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.283029  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00430  hypothetical protein  44.04 
 
 
214 aa  168  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2312  adenylate kinase  41.83 
 
 
215 aa  168  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00140159  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0518  adenylate kinase  44.04 
 
 
214 aa  168  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0222194  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0406  adenylate kinase  44.04 
 
 
214 aa  168  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.395771  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1736  adenylate kinase  41.98 
 
 
217 aa  168  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0382  adenylate kinase  41.98 
 
 
217 aa  168  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01370  Adenylate kinase  40.74 
 
 
216 aa  168  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000615524  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1504  adenylate kinase  44.34 
 
 
217 aa  168  7e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.179397 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2058  adenylate kinase  44.04 
 
 
215 aa  167  8e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000332952  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  44.93 
 
 
217 aa  167  8e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>