More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4486 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4486  adenylate kinase  100 
 
 
204 aa  407  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  66.15 
 
 
189 aa  257  6e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1107  adenylate kinase  61.11 
 
 
216 aa  249  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.211555 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  59.91 
 
 
217 aa  244  4.9999999999999997e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  57.14 
 
 
219 aa  242  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4300  adenylate kinase  61.79 
 
 
217 aa  239  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  58.33 
 
 
217 aa  237  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  59.91 
 
 
217 aa  234  5.0000000000000005e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  57.87 
 
 
217 aa  231  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  57.01 
 
 
217 aa  228  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  57.14 
 
 
217 aa  228  5e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  56.22 
 
 
217 aa  224  5.0000000000000005e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2955  adenylate kinase  54.87 
 
 
192 aa  213  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.913577  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2667  adenylate kinase  53.33 
 
 
192 aa  210  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3122  adenylate kinase  58.12 
 
 
192 aa  210  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20660  Adenylate kinase  56.19 
 
 
193 aa  209  3e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.598531  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0952  adenylate kinase  49.33 
 
 
225 aa  205  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  48.11 
 
 
217 aa  202  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0709  adenylate kinase  56.61 
 
 
191 aa  201  9e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1047  adenylate kinase  54.21 
 
 
181 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275542  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1075  adenylate kinase  54.21 
 
 
181 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1063  adenylate kinase  54.21 
 
 
181 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.67008  normal  0.276891 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1348  adenylate kinase  53.16 
 
 
181 aa  198  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  48.15 
 
 
216 aa  198  6e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  46.73 
 
 
214 aa  197  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  47.64 
 
 
215 aa  197  7e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  46.26 
 
 
214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23590  Adenylate kinase  53.97 
 
 
201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1992  adenylate kinase  52.11 
 
 
197 aa  195  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499697  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5021  adenylate kinase  51.58 
 
 
187 aa  196  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  49.06 
 
 
217 aa  195  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04190  Adenylate kinase  55.56 
 
 
184 aa  195  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  45.75 
 
 
214 aa  193  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3359  adenylate kinase  48.86 
 
 
215 aa  193  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848875  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  46.23 
 
 
216 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  46.23 
 
 
216 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  47.17 
 
 
217 aa  192  2e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  46.01 
 
 
215 aa  192  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  49.51 
 
 
222 aa  192  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  43.78 
 
 
217 aa  192  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  46.01 
 
 
215 aa  192  3e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3884  adenylate kinase  52.85 
 
 
191 aa  192  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  46.01 
 
 
215 aa  191  5e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6593  adenylate kinase  52.63 
 
 
183 aa  191  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  47.57 
 
 
211 aa  190  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  47.29 
 
 
215 aa  190  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2632  adenylate kinase  53.3 
 
 
192 aa  189  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  44.81 
 
 
215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3685  adenylate kinase  50 
 
 
184 aa  188  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00243015  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0648  adenylate kinase  50.52 
 
 
211 aa  188  5e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  45.62 
 
 
217 aa  187  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  50.78 
 
 
200 aa  187  7e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1140  adenylate kinase  48.48 
 
 
208 aa  187  1e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000592914  normal  0.025222 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  46.51 
 
 
220 aa  187  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  47.17 
 
 
214 aa  186  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  46.23 
 
 
215 aa  186  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0608  adenylate kinase  51.78 
 
 
195 aa  186  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  47.55 
 
 
216 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29530  Adenylate kinase  51.02 
 
 
194 aa  184  7e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.754676  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3396  adenylate kinase  49.74 
 
 
181 aa  184  7e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2143  adenylate kinase  52.97 
 
 
200 aa  184  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  50.52 
 
 
199 aa  184  9e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1509  adenylate kinase  47.25 
 
 
215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0272  adenylate kinase  47.37 
 
 
186 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1070  adenylate kinase  45.21 
 
 
216 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.283029  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  46.01 
 
 
217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1319  adenylate kinase  45.87 
 
 
215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.176093  hitchhiker  0.00352848 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1375  adenylate kinase  50.27 
 
 
193 aa  182  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465911  normal  0.134274 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16700  adenylate kinase  44.95 
 
 
215 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.528673  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2458  adenylate kinase  51.3 
 
 
200 aa  181  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5879  adenylate kinase  45.54 
 
 
220 aa  181  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276122  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  51.08 
 
 
199 aa  181  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1452  adenylate kinase  45.87 
 
 
215 aa  181  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2533  adenylate kinase  46.9 
 
 
222 aa  180  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.154116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2180  adenylate kinase  52.43 
 
 
200 aa  180  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.251193 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0748  adenylate kinase  45.54 
 
 
220 aa  180  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.468478 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  45.75 
 
 
214 aa  179  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0354  adenylate kinase  46.02 
 
 
222 aa  179  2e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16960  Adenylate kinase  47.5 
 
 
205 aa  179  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.466629  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39280  Adenylate kinase  45.41 
 
 
215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  44.86 
 
 
214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1148  adenylate kinase  51.58 
 
 
181 aa  179  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  49.2 
 
 
194 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2232  adenylate kinase  50 
 
 
217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1936  adenylate kinase  45.09 
 
 
220 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0745182  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1361  adenylate kinase  43.87 
 
 
224 aa  178  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2572  adenylate kinase  45.09 
 
 
220 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.601307 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2548  adenylate kinase  45.09 
 
 
220 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  45.92 
 
 
216 aa  177  7e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10747  adenylate kinase  48.42 
 
 
181 aa  177  7e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.188337 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2312  adenylate kinase  47.96 
 
 
215 aa  177  7e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00140159  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1541  adenylate kinase  45.74 
 
 
218 aa  177  9e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0259287  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1506  adenylate kinase  44.29 
 
 
216 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.614097  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2066  adenylate kinase  45.16 
 
 
214 aa  176  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01370  Adenylate kinase  41.12 
 
 
216 aa  177  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000615524  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  49.02 
 
 
217 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4216  adenylate kinase  44.29 
 
 
216 aa  176  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1080  adenylate kinase  45.54 
 
 
220 aa  176  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0446063  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  44.84 
 
 
423 aa  176  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0783  adenylate kinase  48.5 
 
 
205 aa  176  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>