More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1576 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  100 
 
 
213 aa  431  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  58.02 
 
 
214 aa  277  8e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  61.79 
 
 
217 aa  276  1e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  59.15 
 
 
216 aa  275  4e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  62.94 
 
 
217 aa  272  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  58.22 
 
 
217 aa  271  6e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  58.49 
 
 
215 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  59.05 
 
 
213 aa  268  4e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  56.34 
 
 
216 aa  266  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  56.34 
 
 
216 aa  266  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  57.21 
 
 
213 aa  265  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  59.43 
 
 
214 aa  263  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  56.6 
 
 
217 aa  259  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  56.13 
 
 
215 aa  258  4e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  58.22 
 
 
216 aa  258  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  56.13 
 
 
215 aa  258  6e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  56.13 
 
 
215 aa  258  6e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  56.13 
 
 
215 aa  257  7e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  58.22 
 
 
214 aa  257  9e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  58.49 
 
 
214 aa  257  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  55.87 
 
 
216 aa  256  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0126  adenylate kinase  55.87 
 
 
216 aa  255  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000253561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0131  adenylate kinase  54.93 
 
 
216 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000890423  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0152  adenylate kinase  54.93 
 
 
216 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00506864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0162  adenylate kinase  54.93 
 
 
216 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  55.4 
 
 
222 aa  252  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  56.81 
 
 
217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5174  adenylate kinase  54.46 
 
 
216 aa  252  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000620291  unclonable  1.1738e-25 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0131  adenylate kinase  54.46 
 
 
216 aa  251  7e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000156427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0127  adenylate kinase  54.46 
 
 
216 aa  251  7e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000429626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0125  adenylate kinase  54.46 
 
 
216 aa  251  7e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0141617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0131  adenylate kinase  54.46 
 
 
216 aa  251  7e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000118062  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0144  adenylate kinase  54.46 
 
 
216 aa  251  7e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.24496e-61 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  55.5 
 
 
423 aa  251  8.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1273  adenylate kinase  56.37 
 
 
217 aa  249  3e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  59.38 
 
 
215 aa  248  4e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01370  Adenylate kinase  51.17 
 
 
216 aa  246  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000615524  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  55.29 
 
 
214 aa  245  4.9999999999999997e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  53.52 
 
 
217 aa  244  6e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  55.66 
 
 
214 aa  244  6.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  52.36 
 
 
217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  52.17 
 
 
217 aa  237  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  53.3 
 
 
220 aa  236  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  52.58 
 
 
217 aa  235  3e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  53.17 
 
 
211 aa  234  7e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  51.17 
 
 
219 aa  234  7e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2690  adenylate kinase  52.58 
 
 
216 aa  234  9e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  52.66 
 
 
217 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2312  adenylate kinase  51.89 
 
 
215 aa  233  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00140159  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1976  adenylate kinase  52.11 
 
 
215 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  50.72 
 
 
217 aa  232  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  51.49 
 
 
217 aa  231  6e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0739  adenylate kinase  54.79 
 
 
220 aa  231  6e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139033  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0887  adenylate kinase  52.11 
 
 
217 aa  231  6e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.037956  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3212  adenylate kinase  53.64 
 
 
217 aa  231  7.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2154  adenylate kinase  53.42 
 
 
220 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.181354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1049  adenylate kinase  53.42 
 
 
220 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000082609  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2066  adenylate kinase  52.29 
 
 
214 aa  230  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0924  adenylate kinase  53.42 
 
 
220 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.123931  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2277  adenylate kinase  53.42 
 
 
220 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00000360285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1080  adenylate kinase  53.42 
 
 
220 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0446063  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0763  adenylate kinase  53.88 
 
 
221 aa  229  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758811  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  51.89 
 
 
215 aa  229  2e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0927  adenylate kinase  53.42 
 
 
220 aa  229  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0572  adenylate kinase  53.42 
 
 
220 aa  229  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148537  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  50.23 
 
 
213 aa  229  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1111  adenylate kinase  53.88 
 
 
216 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4111  adenylate kinase  53.88 
 
 
216 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1506  adenylate kinase  53.42 
 
 
216 aa  228  5e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.614097  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  51.69 
 
 
217 aa  228  5e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4216  adenylate kinase  53.42 
 
 
216 aa  228  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.584278 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3199  adenylate kinase  53.88 
 
 
221 aa  228  7e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2404  adenylate kinase  51.79 
 
 
222 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  50.72 
 
 
217 aa  226  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2810  adenylate kinase  51.79 
 
 
222 aa  226  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0112016  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2572  adenylate kinase  54.13 
 
 
220 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.601307 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0748  adenylate kinase  54.13 
 
 
220 aa  226  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.552209  normal  0.468478 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1936  adenylate kinase  54.13 
 
 
220 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0745182  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2548  adenylate kinase  54.13 
 
 
220 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0952  adenylate kinase  50.46 
 
 
225 aa  225  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5879  adenylate kinase  53.36 
 
 
220 aa  225  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276122  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  49.77 
 
 
219 aa  225  3e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2153  adenylate kinase  53.39 
 
 
218 aa  226  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2297  adenylate kinase  53 
 
 
214 aa  225  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000662759  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  50.47 
 
 
217 aa  224  5.0000000000000005e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2488  adenylate kinase  52.49 
 
 
217 aa  224  7e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317591  normal  0.964457 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0535  adenylate kinase  53.18 
 
 
221 aa  224  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2466  adenylate kinase  53.67 
 
 
220 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2596  adenylate kinase  53.67 
 
 
220 aa  223  1e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  50.7 
 
 
224 aa  223  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2157  adenylate kinase  53.05 
 
 
208 aa  223  2e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140182  normal  0.776532 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1540  adenylate kinase  52.07 
 
 
214 aa  223  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0198359  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09780  Adenylate kinase  53.27 
 
 
209 aa  223  2e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103651 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2584  adenylate kinase  52.07 
 
 
214 aa  222  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000261386  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1361  adenylate kinase  51.17 
 
 
224 aa  222  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1430  adenylate kinase  52.75 
 
 
214 aa  222  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000051006  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2546  adenylate kinase  52.07 
 
 
214 aa  222  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0993746  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1800  adenylate kinase  52.07 
 
 
214 aa  222  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0513592  hitchhiker  0.00000182488 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2661  adenylate kinase  52.07 
 
 
214 aa  222  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00427284  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2018  adenylate kinase  52.07 
 
 
214 aa  221  6e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>