More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3396 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3396  adenylate kinase  100 
 
 
181 aa  365  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3685  adenylate kinase  74.3 
 
 
184 aa  268  4e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00243015  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04190  Adenylate kinase  63.89 
 
 
184 aa  236  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1075  adenylate kinase  61.88 
 
 
181 aa  232  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1047  adenylate kinase  61.88 
 
 
181 aa  232  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.275542  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1063  adenylate kinase  61.88 
 
 
181 aa  232  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.67008  normal  0.276891 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5021  adenylate kinase  61.33 
 
 
187 aa  228  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10747  adenylate kinase  61.33 
 
 
181 aa  228  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.188337 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1348  adenylate kinase  62.57 
 
 
181 aa  228  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1148  adenylate kinase  61.45 
 
 
181 aa  225  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6593  adenylate kinase  61.45 
 
 
183 aa  223  9e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3884  adenylate kinase  55.91 
 
 
191 aa  206  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0521  adenylate kinase  48.9 
 
 
185 aa  194  5.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2213  adenylate kinase  56.41 
 
 
186 aa  194  7e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23590  Adenylate kinase  55.62 
 
 
201 aa  193  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0709  adenylate kinase  52.17 
 
 
191 aa  190  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  52.97 
 
 
189 aa  187  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  45.33 
 
 
215 aa  187  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2578  adenylate kinase  54.84 
 
 
184 aa  185  2e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  42.92 
 
 
216 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  42.92 
 
 
216 aa  186  2e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05570  adenylate kinase  47.59 
 
 
367 aa  185  4e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2667  adenylate kinase  51.11 
 
 
192 aa  184  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4486  adenylate kinase  49.74 
 
 
204 aa  184  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2955  adenylate kinase  51.11 
 
 
192 aa  182  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.913577  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0952  adenylate kinase  45.25 
 
 
225 aa  180  8.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  46.23 
 
 
217 aa  179  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  45.19 
 
 
216 aa  180  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2993  adenylate kinase  45.74 
 
 
191 aa  180  1e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0710  adenylate kinase  53.85 
 
 
184 aa  179  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000807977  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  48.62 
 
 
187 aa  179  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3722  adenylate kinase  53.59 
 
 
187 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1992  adenylate kinase  48.65 
 
 
197 aa  178  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499697  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20660  Adenylate kinase  50.81 
 
 
193 aa  176  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.598531  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4300  adenylate kinase  45.41 
 
 
217 aa  176  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  46.7 
 
 
217 aa  176  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1728  adenylate kinase  48.39 
 
 
186 aa  176  2e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0507539  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  46.23 
 
 
217 aa  175  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0240  adenylate kinase  47.03 
 
 
187 aa  174  5e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  48.39 
 
 
217 aa  174  5e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3122  adenylate kinase  49.73 
 
 
192 aa  174  7e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0210  adenylate kinase  47.03 
 
 
187 aa  174  8e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.389912  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2632  adenylate kinase  48.91 
 
 
192 aa  173  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  41.12 
 
 
214 aa  173  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  43.75 
 
 
213 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  46.07 
 
 
193 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  45.28 
 
 
217 aa  172  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  44.86 
 
 
219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2143  adenylate kinase  47.4 
 
 
200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  39.44 
 
 
215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  42.72 
 
 
215 aa  171  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  43.4 
 
 
214 aa  171  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  40.85 
 
 
215 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1107  adenylate kinase  45.02 
 
 
216 aa  171  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.211555 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0272  adenylate kinase  48.13 
 
 
186 aa  171  5e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  44.39 
 
 
217 aa  171  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  46.24 
 
 
217 aa  171  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  45.28 
 
 
217 aa  171  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  41.04 
 
 
213 aa  171  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  44.09 
 
 
215 aa  170  7.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  43.4 
 
 
217 aa  170  9e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  46.77 
 
 
217 aa  170  9e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  45.16 
 
 
217 aa  170  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29530  Adenylate kinase  50 
 
 
194 aa  169  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.754676  normal  0.534773 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0648  adenylate kinase  48.91 
 
 
211 aa  169  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0739  adenylate kinase  41.7 
 
 
220 aa  168  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139033  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  44.44 
 
 
205 aa  167  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  44.79 
 
 
200 aa  166  1e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1974  adenylate kinase  44.2 
 
 
183 aa  166  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.236397  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  46.45 
 
 
199 aa  166  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02588  adenylate kinase  44.51 
 
 
182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  48.39 
 
 
216 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  41.9 
 
 
217 aa  165  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2180  adenylate kinase  46.35 
 
 
200 aa  165  4e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.251193 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16960  Adenylate kinase  45 
 
 
205 aa  164  5e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.466629  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23240  Adenylate kinase  43.96 
 
 
208 aa  164  5.9999999999999996e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112414 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0927  adenylate kinase  40.81 
 
 
220 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2277  adenylate kinase  40.81 
 
 
220 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00000360285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1080  adenylate kinase  40.81 
 
 
220 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0446063  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1049  adenylate kinase  40.81 
 
 
220 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000082609  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0924  adenylate kinase  40.81 
 
 
220 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.123931  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0608  adenylate kinase  49.21 
 
 
195 aa  164  5.9999999999999996e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2154  adenylate kinase  40.81 
 
 
220 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.181354  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0572  adenylate kinase  40.81 
 
 
220 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148537  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  41.78 
 
 
215 aa  164  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0615  adenylate kinase  49.16 
 
 
188 aa  164  6.9999999999999995e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000660087  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  41.78 
 
 
215 aa  164  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1311  adenylate kinase  48.73 
 
 
195 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165933  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2572  adenylate kinase  40.36 
 
 
220 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.601307 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2458  adenylate kinase  45.83 
 
 
200 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16591  adenylate kinase  45 
 
 
186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.761674  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1936  adenylate kinase  40.36 
 
 
220 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0745182  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2548  adenylate kinase  40.36 
 
 
220 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  46.45 
 
 
199 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  44.92 
 
 
194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4092  adenylate kinase  41.49 
 
 
190 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  44.92 
 
 
194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  42.92 
 
 
217 aa  162  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  44.92 
 
 
309 aa  162  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09780  Adenylate kinase  43.75 
 
 
209 aa  162  3e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>