More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2143 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2143  adenylate kinase  100 
 
 
200 aa  390  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.796007 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2180  adenylate kinase  93 
 
 
200 aa  367  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.251193 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2458  adenylate kinase  92.5 
 
 
200 aa  366  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  81.03 
 
 
199 aa  306  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  80 
 
 
199 aa  305  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  75 
 
 
200 aa  296  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1375  adenylate kinase  67.54 
 
 
193 aa  263  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.465911  normal  0.134274 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4777  adenylate kinase  63.35 
 
 
195 aa  251  3e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000251656 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  62.57 
 
 
193 aa  251  6e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  60.5 
 
 
309 aa  245  3e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1385  adenylate kinase  63.87 
 
 
206 aa  244  8e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.365572 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1657  adenylate kinase  61.26 
 
 
194 aa  239  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.201865  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1566  adenylate kinase  59.9 
 
 
208 aa  238  4e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0263556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0783  adenylate kinase  61.46 
 
 
205 aa  236  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2316  adenylate kinase  60.2 
 
 
341 aa  230  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210297  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3163  adenylate kinase  61.26 
 
 
360 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  61.03 
 
 
367 aa  228  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1212  adenylate kinase  57.59 
 
 
194 aa  224  7e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1175  adenylate kinase  57.59 
 
 
194 aa  224  7e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0770986  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1977  adenylate kinase  57.59 
 
 
194 aa  223  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.100944  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1007  adenylate kinase  57.59 
 
 
192 aa  219  3e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.556108  normal  0.030357 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3427  adenylate kinase  59.49 
 
 
335 aa  214  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  58.79 
 
 
205 aa  211  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0719  adenylate kinase  54.17 
 
 
192 aa  211  5.999999999999999e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.428193  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6306  adenylate kinase  54.01 
 
 
192 aa  208  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2667  adenylate kinase  54.21 
 
 
195 aa  205  5e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  48.83 
 
 
216 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  47.64 
 
 
213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  47.69 
 
 
216 aa  193  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  45.54 
 
 
216 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1635  adenylate kinase  51.83 
 
 
189 aa  186  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205693  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20660  Adenylate kinase  50.26 
 
 
193 aa  185  3e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.598531  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  45.79 
 
 
217 aa  185  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  47.89 
 
 
224 aa  186  3e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4486  adenylate kinase  52.97 
 
 
204 aa  184  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  46.23 
 
 
213 aa  183  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0276  adenylate kinase  48.42 
 
 
193 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0464579  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  44.39 
 
 
220 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3302  adenylate kinase  46.63 
 
 
187 aa  180  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2625  adenylate kinase  48.91 
 
 
189 aa  180  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.155499  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  48.58 
 
 
216 aa  180  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  45.28 
 
 
214 aa  180  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1344  adenylate kinase  43.54 
 
 
213 aa  179  2e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  47.32 
 
 
217 aa  179  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  45.66 
 
 
219 aa  178  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3554  adenylate kinase  45.07 
 
 
229 aa  178  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  46.34 
 
 
217 aa  177  9e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  44.81 
 
 
227 aa  177  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  43.72 
 
 
215 aa  176  2e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  43.93 
 
 
215 aa  176  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  45.19 
 
 
214 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0240  adenylate kinase  47.83 
 
 
187 aa  176  3e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  43.75 
 
 
213 aa  175  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0210  adenylate kinase  47.83 
 
 
187 aa  175  4e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.389912  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  47.37 
 
 
423 aa  175  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3884  adenylate kinase  47.4 
 
 
191 aa  175  4e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2157  adenylate kinase  48.51 
 
 
208 aa  174  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140182  normal  0.776532 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1140  adenylate kinase  44.66 
 
 
208 aa  175  5e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000592914  normal  0.025222 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23590  Adenylate kinase  48.09 
 
 
201 aa  174  6e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  45.19 
 
 
217 aa  174  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2632  adenylate kinase  47.42 
 
 
192 aa  174  9e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  42.59 
 
 
216 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1348  adenylate kinase  48.09 
 
 
181 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  44.91 
 
 
214 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12518  predicted protein  45.02 
 
 
240 aa  174  9.999999999999999e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.966257  normal  0.823549 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  43.72 
 
 
215 aa  173  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1774  adenylate kinase  47.92 
 
 
188 aa  173  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  0.285476 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  43.72 
 
 
215 aa  173  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3122  adenylate kinase  47.15 
 
 
192 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  41.04 
 
 
216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  41.04 
 
 
216 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  45.1 
 
 
214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0578  adenylate kinase  48.04 
 
 
217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0613  adenylate kinase  49.48 
 
 
191 aa  172  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  43.13 
 
 
211 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3396  adenylate kinase  47.4 
 
 
181 aa  172  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  43.66 
 
 
217 aa  171  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  42.25 
 
 
219 aa  171  5e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1311  adenylate kinase  42.27 
 
 
195 aa  171  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165933  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2231  adenylate kinases  48.04 
 
 
229 aa  171  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603171  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2533  adenylate kinase  41.33 
 
 
222 aa  171  5.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.154116 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1270  adenylate kinase  45.07 
 
 
216 aa  171  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1024  adenylate kinase  45.62 
 
 
214 aa  171  9e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  44.88 
 
 
217 aa  170  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  43.27 
 
 
213 aa  170  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5021  adenylate kinase  46.45 
 
 
187 aa  170  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.416871 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  45.1 
 
 
217 aa  170  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2810  adenylate kinase  41.07 
 
 
222 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0112016  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  40.47 
 
 
215 aa  169  3e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05122  Adenylate kinase 1 (AK 1)(EC 2.7.4.3)(ATP-AMP transphosphorylase 1)(Adenylate kinase cytosolic and mitochondrial) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B2V8]  43.26 
 
 
259 aa  169  4e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2404  adenylate kinase  41.07 
 
 
222 aa  168  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4092  adenylate kinase  41.67 
 
 
190 aa  169  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0709  adenylate kinase  47.89 
 
 
191 aa  168  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1332  adenylate kinase  44.24 
 
 
215 aa  169  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.376737 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  39.62 
 
 
217 aa  169  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2797  adenylate kinase  42.72 
 
 
219 aa  168  5e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5595  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3194  adenylate kinase  44.7 
 
 
214 aa  168  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.804867  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0509  adenylate kinase  47.06 
 
 
229 aa  168  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.131893 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3054  adenylate kinase  44.7 
 
 
214 aa  168  6e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2894  adenylate kinase  44.7 
 
 
214 aa  168  6e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.290073  normal  0.0817579 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>