More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2231 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2231  adenylate kinases  100 
 
 
229 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603171  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0578  adenylate kinase  99.54 
 
 
217 aa  424  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0509  adenylate kinase  91.7 
 
 
229 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.131893 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3554  adenylate kinase  69.43 
 
 
229 aa  313  9.999999999999999e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  69.09 
 
 
227 aa  305  3e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1270  adenylate kinase  56.87 
 
 
216 aa  253  2.0000000000000002e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  54.67 
 
 
216 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  53.95 
 
 
219 aa  245  4.9999999999999997e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  55.19 
 
 
213 aa  244  9e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  55.61 
 
 
216 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  55.56 
 
 
224 aa  241  5e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1332  adenylate kinase  55.45 
 
 
215 aa  239  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.376737 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2797  adenylate kinase  55.61 
 
 
219 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5595  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  53.08 
 
 
216 aa  236  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  55.19 
 
 
216 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  55.17 
 
 
214 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  50.72 
 
 
214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  50.72 
 
 
423 aa  211  7e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0781  adenylate kinase  48.15 
 
 
218 aa  211  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  48.82 
 
 
222 aa  210  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  50.74 
 
 
214 aa  208  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  47.64 
 
 
213 aa  208  7e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1273  adenylate kinase  49.77 
 
 
217 aa  204  7e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  48.34 
 
 
220 aa  204  7e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  48.57 
 
 
217 aa  204  9e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0306  adenylate kinase  49.28 
 
 
213 aa  204  9e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  47.87 
 
 
217 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  46.45 
 
 
217 aa  203  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1736  adenylate kinase  46.95 
 
 
217 aa  202  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0382  adenylate kinase  46.95 
 
 
217 aa  202  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2513  adenylate kinase  46.95 
 
 
217 aa  202  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  46.48 
 
 
217 aa  202  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  50.26 
 
 
215 aa  202  5e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  48.78 
 
 
217 aa  202  5e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  47.83 
 
 
211 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  43.72 
 
 
215 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  47.29 
 
 
214 aa  198  7e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  45.79 
 
 
217 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  42.45 
 
 
216 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  41.51 
 
 
216 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  41.51 
 
 
216 aa  195  5.000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  47.62 
 
 
217 aa  194  7e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5174  adenylate kinase  41.98 
 
 
216 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000620291  unclonable  1.1738e-25 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  47.18 
 
 
213 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0162  adenylate kinase  41.51 
 
 
216 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0131  adenylate kinase  41.51 
 
 
216 aa  193  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000890423  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0131  adenylate kinase  41.51 
 
 
216 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000156427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0127  adenylate kinase  41.51 
 
 
216 aa  193  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000429626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0125  adenylate kinase  41.51 
 
 
216 aa  193  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0141617  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  43.26 
 
 
215 aa  193  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0131  adenylate kinase  41.51 
 
 
216 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000118062  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  46.8 
 
 
217 aa  193  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0144  adenylate kinase  41.51 
 
 
216 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.24496e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0152  adenylate kinase  41.51 
 
 
216 aa  192  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00506864  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1164  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  44.44 
 
 
226 aa  192  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000123796  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  41.04 
 
 
216 aa  192  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  45.85 
 
 
217 aa  192  5e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  44.08 
 
 
213 aa  191  7e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37399  predicted protein  45.21 
 
 
239 aa  191  8e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.889133  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0348  adenylate kinase  46.92 
 
 
218 aa  191  9e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0290027  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1932  adenylate kinase  45.28 
 
 
214 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0126  adenylate kinase  41.04 
 
 
216 aa  190  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000253561  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0518  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  46.92 
 
 
220 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108305  unclonable  0.0000000000175387 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  41.86 
 
 
219 aa  190  1e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  45.81 
 
 
217 aa  189  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39280  Adenylate kinase  47.39 
 
 
215 aa  189  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2690  adenylate kinase  45.32 
 
 
216 aa  189  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1954  Adenylate kinase  45.33 
 
 
214 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  46.34 
 
 
217 aa  188  5e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1925  adenylate kinase  45.33 
 
 
214 aa  188  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  44.39 
 
 
217 aa  187  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  44.13 
 
 
214 aa  187  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4005  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  43.48 
 
 
226 aa  187  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000000986709  hitchhiker  0.0000175975 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  46.19 
 
 
193 aa  187  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3212  adenylate kinase  46.01 
 
 
217 aa  187  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2039  Adenylate kinase  44.86 
 
 
214 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5049  adenylate kinase  48.37 
 
 
309 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449278  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  41.98 
 
 
217 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3646  adenylate kinase  50.48 
 
 
367 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251255  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3359  adenylate kinase  45.97 
 
 
215 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848875  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  45.85 
 
 
217 aa  185  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2312  adenylate kinase  47.18 
 
 
215 aa  185  6e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00140159  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2197  adenylate kinase  49.52 
 
 
200 aa  184  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.56266  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1024  adenylate kinase  46.54 
 
 
214 aa  184  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  43.84 
 
 
214 aa  184  9e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2924  adenylate kinase  41.98 
 
 
217 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3035  adenylate kinase  45.62 
 
 
214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3003  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  45.41 
 
 
222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.192004  hitchhiker  0.00720085 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1361  adenylate kinase  45.89 
 
 
224 aa  182  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0270  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  41.51 
 
 
211 aa  182  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1070  adenylate kinase  48.4 
 
 
216 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.283029  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3163  adenylate kinase  47.64 
 
 
360 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.203317  normal  0.331525 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2316  adenylate kinase  47.39 
 
 
341 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.210297  normal  0.170199 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  47.42 
 
 
199 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0354  adenylate kinase  44.8 
 
 
222 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  41.4 
 
 
215 aa  181  9.000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2757  adenylate kinase  46.23 
 
 
205 aa  180  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.779372  normal  0.255113 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01370  Adenylate kinase  39.62 
 
 
216 aa  180  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000615524  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2157  adenylate kinase  48.72 
 
 
208 aa  179  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140182  normal  0.776532 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16700  adenylate kinase  43.66 
 
 
215 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.528673  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>