More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1332 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1332  adenylate kinase  100 
 
 		 215 aa  433  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.376737 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1270  adenylate kinase  80.28 
 
 		 216 aa  352  4e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2797  adenylate kinase  77.46 
 
 		 219 aa  337  9e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5595  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2513  adenylate kinase  58.6 
 
 		 217 aa  247  9e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2987  adenylate kinase  54.67 
 
 		 219 aa  246  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.169242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1736  adenylate kinase  58.6 
 
 		 217 aa  245  4e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0382  adenylate kinase  58.6 
 
 		 217 aa  245  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.172355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  54.93 
 
 		 216 aa  243  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  58.88 
 
 		 224 aa  242  3e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0509  adenylate kinase  54.93 
 
 		 229 aa  241  7e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.131893 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2231  adenylate kinases  55.45 
 
 		 229 aa  239  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.603171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0578  adenylate kinase  55.45 
 
 		 217 aa  239  2e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  54.46 
 
 		 216 aa  237  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3554  adenylate kinase  53.99 
 
 		 229 aa  236  2e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0781  adenylate kinase  54.42 
 
 		 218 aa  236  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0306  adenylate kinase  57.01 
 
 		 213 aa  231  7.000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  53.05 
 
 		 213 aa  230  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1451  adenylate kinase  52.58 
 
 		 216 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176418  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  51.17 
 
 		 227 aa  223  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  51.66 
 
 		 214 aa  221  6e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  51.64 
 
 		 214 aa  219  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  51.16 
 
 		 214 aa  218  7e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  49.53 
 
 		 220 aa  216  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  48.83 
 
 		 216 aa  214  7e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  52.11 
 
 		 216 aa  212  2.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  48.83 
 
 		 213 aa  209  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  44.19 
 
 		 219 aa  204  6e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2847  adenylate kinase  47.91 
 
 		 217 aa  203  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.821791  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  47.42 
 
 		 217 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  46.48 
 
 		 217 aa  203  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  48.36 
 
 		 215 aa  203  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  45.58 
 
 		 217 aa  201  7e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4777  adenylate kinase  52.8 
 
 		 195 aa  200  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000251656 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1886  adenylate kinase  47.93 
 
 		 218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00135603  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  47.42 
 
 		 222 aa  198  6e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2690  adenylate kinase  45.07 
 
 		 216 aa  197  7e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0131862  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  46.48 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  44.19 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  44.19 
 
 		 215 aa  196  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  46.95 
 
 		 214 aa  196  3e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  45.97 
 
 		 213 aa  195  5.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  45.54 
 
 		 213 aa  193  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  45.71 
 
 		 423 aa  193  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  47.32 
 
 		 217 aa  192  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  44.19 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2380  adenylate kinase  45.12 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000961521  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  44.6 
 
 		 216 aa  192  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1635  adenylate kinase  49.3 
 
 		 189 aa  192  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.205693  normal  0.0186532 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1273  adenylate kinase  46.48 
 
 		 217 aa  191  5e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0144  adenylate kinase  44.6 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.24496e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0131  adenylate kinase  44.6 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000890423  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0131  adenylate kinase  44.6 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000156427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0127  adenylate kinase  44.6 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000429626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0125  adenylate kinase  44.6 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0141617  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0152  adenylate kinase  44.6 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00506864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0162  adenylate kinase  44.6 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0131  adenylate kinase  44.6 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000118062  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0126  adenylate kinase  44.6 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000253561  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0348  adenylate kinase  44.71 
 
 		 218 aa  189  4e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0290027  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5174  adenylate kinase  44.13 
 
 		 216 aa  189  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000620291  unclonable  1.1738e-25 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4935  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  44.93 
 
 		 218 aa  189  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000314171  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0518  Nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  44.71 
 
 		 220 aa  188  5e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.108305  unclonable  0.0000000000175387 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  46.12 
 
 		 217 aa  188  5.999999999999999e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1774  adenylate kinase  46.98 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.689429  normal  0.285476 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0613  adenylate kinase  50.93 
 
 		 191 aa  186  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  43.26 
 
 		 215 aa  184  6e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12518  predicted protein  45.02 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.966257  normal  0.823549 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  44.66 
 
 		 217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  43.19 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1528  adenylate kinase  47.71 
 
 		 227 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000135558  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  44.13 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0276  adenylate kinase  48.11 
 
 		 193 aa  182  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0464579  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1929  adenylate kinase  46.95 
 
 		 199 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.312303  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1540  adenylate kinase  45.41 
 
 		 214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0198359  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  43.72 
 
 		 219 aa  181  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0332  adenylate kinase  47.89 
 
 		 199 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.671813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  44.66 
 
 		 217 aa  181  8.000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  42.25 
 
 		 217 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0215  Adenylate kinase  42.93 
 
 		 214 aa  181  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1932  adenylate kinase  46.01 
 
 		 214 aa  180  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.791689 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2847  adenylate kinase  46.33 
 
 		 214 aa  180  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000688641  decreased coverage  0.00000000215669 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2584  adenylate kinase  45.41 
 
 		 214 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000261386  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1800  adenylate kinase  45.41 
 
 		 214 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0513592  hitchhiker  0.00000182488 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2297  adenylate kinase  46.33 
 
 		 214 aa  180  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000662759  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2546  adenylate kinase  45.41 
 
 		 214 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0993746  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1430  adenylate kinase  44.95 
 
 		 214 aa  179  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000051006  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  43.48 
 
 		 217 aa  180  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2661  adenylate kinase  45.41 
 
 		 214 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00427284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1315  adenylate kinase  46.33 
 
 		 214 aa  180  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0119239  normal  0.109595 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3359  adenylate kinase  45 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1111  adenylate kinase  41.78 
 
 		 214 aa  179  2.9999999999999997e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000158184  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1164  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  42.79 
 
 		 226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000123796  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0949  adenylate kinase  50 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.675303 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0559  adenylate kinase  47.62 
 
 		 193 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  39.44 
 
 		 216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  39.44 
 
 		 216 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2249  adenylate kinase  45.41 
 
 		 214 aa  178  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00010128  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2321  adenylate kinase  45.41 
 
 		 214 aa  178  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000464227  unclonable  0.0000372349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2441  adenylate kinase  45.41 
 
 		 214 aa  178  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000155817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1344  adenylate kinase  42.79 
 
 		 213 aa  178  4.999999999999999e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>