More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0701 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0701  adenylate kinase  100 
 
 
220 aa  447  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0297411  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1367  adenylate kinase  65.09 
 
 
214 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00134255  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3307  adenylate kinase  61.95 
 
 
214 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0954  adenylate kinase  61.46 
 
 
214 aa  268  5.9999999999999995e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.338741  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0132  adenylate kinase  56.07 
 
 
216 aa  254  5e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00113447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2836  adenylate kinase  53.24 
 
 
217 aa  251  7e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1087  adenylate kinase  53.27 
 
 
217 aa  248  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0722  adenylate kinase  58.6 
 
 
216 aa  248  6e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.940289  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1725  adenylate kinase  55.66 
 
 
215 aa  242  3e-63  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477664  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0086  adenylate kinase  53.52 
 
 
215 aa  241  3.9999999999999997e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00306231  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0128  adenylate kinase  53.7 
 
 
217 aa  239  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1163  adenylate kinase  59.09 
 
 
211 aa  236  2e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0529729  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0583  adenylate kinase  53.77 
 
 
217 aa  236  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1576  adenylate kinases  53.3 
 
 
213 aa  236  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00457177  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0647  adenylate kinase  53.77 
 
 
222 aa  236  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00892777  hitchhiker  0.00000105788 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2256  adenylate kinase  51.64 
 
 
215 aa  234  8e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0268599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2297  adenylate kinase  51.64 
 
 
215 aa  234  8e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1338  adenylate kinase  51.47 
 
 
213 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.389991  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3646  adenylate kinase  55.05 
 
 
217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000547337  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1810  adenylate kinase  49.77 
 
 
215 aa  232  3e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1504  adenylate kinases  51.42 
 
 
215 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0125  adenylate kinase  50.93 
 
 
216 aa  231  7.000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000166818  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5174  adenylate kinase  50.46 
 
 
216 aa  229  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000620291  unclonable  1.1738e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0131  adenylate kinase  50.46 
 
 
216 aa  229  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000890423  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1237  adenylate kinase  51.96 
 
 
214 aa  229  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000920741  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0162  adenylate kinase  50.46 
 
 
216 aa  229  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000036841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0443  adenylate kinase  52.58 
 
 
217 aa  229  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0126  adenylate kinase  50.93 
 
 
216 aa  229  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000253561  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0354  adenylate kinase  58.06 
 
 
222 aa  228  4e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0603  adenylate kinase  52.94 
 
 
217 aa  228  5e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0152  adenylate kinase  50 
 
 
216 aa  228  6e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00506864  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0131  adenylate kinase  50 
 
 
216 aa  226  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000156427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0127  adenylate kinase  50 
 
 
216 aa  226  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000429626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0125  adenylate kinase  50 
 
 
216 aa  226  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0141617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0131  adenylate kinase  50 
 
 
216 aa  226  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000118062  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3359  adenylate kinase  57.45 
 
 
215 aa  227  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.848875  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0144  adenylate kinase  50 
 
 
216 aa  226  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.24496e-61 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2066  adenylate kinase  57.14 
 
 
214 aa  226  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1070  adenylate kinase  51.12 
 
 
216 aa  225  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.283029  normal  0.107455 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2584  adenylate kinase  50.46 
 
 
214 aa  225  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000261386  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1800  adenylate kinase  50.46 
 
 
214 aa  225  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0513592  hitchhiker  0.00000182488 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2546  adenylate kinase  50.46 
 
 
214 aa  225  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0993746  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3212  adenylate kinase  56.38 
 
 
217 aa  225  4e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2661  adenylate kinase  50.46 
 
 
214 aa  225  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00427284  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2297  adenylate kinase  50 
 
 
214 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000662759  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6028  adenylate kinase  51.96 
 
 
217 aa  224  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1315  adenylate kinase  55.32 
 
 
214 aa  224  6e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0119239  normal  0.109595 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2018  adenylate kinase  50 
 
 
214 aa  224  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2713  Adenylate kinase  51.96 
 
 
423 aa  223  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.690631  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0055  adenylate kinase  53.39 
 
 
218 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3902  adenylate kinase  50.46 
 
 
217 aa  223  1e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4294  adenylate kinase  50 
 
 
217 aa  223  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487166 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2249  adenylate kinase  50 
 
 
214 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00010128  normal  0.129794 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2321  adenylate kinase  50 
 
 
214 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000464227  unclonable  0.0000372349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2441  adenylate kinase  50 
 
 
214 aa  223  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000155817  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1207  adenylate kinase  52.45 
 
 
217 aa  222  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00730136 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1430  adenylate kinase  49.77 
 
 
214 aa  222  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000051006  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2693  adenylate kinase  48.11 
 
 
216 aa  222  3e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2378  adenylate kinase  48.11 
 
 
216 aa  222  3e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1540  adenylate kinase  49.54 
 
 
214 aa  222  4e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0198359  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2230  adenylate kinase  49.31 
 
 
214 aa  221  4.9999999999999996e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000387262  hitchhiker  0.000214204 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1528  adenylate kinase  50.23 
 
 
227 aa  221  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000135558  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1509  adenylate kinase  55.85 
 
 
215 aa  221  7e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1319  adenylate kinase  54.79 
 
 
215 aa  221  7e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.176093  hitchhiker  0.00352848 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1784  adenylate kinase  52.04 
 
 
219 aa  220  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1353  adenylate kinase  51.17 
 
 
216 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362467  normal  0.404671 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2439  adenylate kinase  50 
 
 
217 aa  220  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0857  adenylate kinase  50 
 
 
218 aa  220  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.258146  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1429  adenylate kinase  57.45 
 
 
218 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1718  adenylate kinase  50 
 
 
213 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1270  adenylate kinase  49.3 
 
 
216 aa  219  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1504  adenylate kinase  54.84 
 
 
217 aa  219  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.179397 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1490  adenylate kinase  49.53 
 
 
227 aa  219  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.480063  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0779  adenylate kinase  47.17 
 
 
214 aa  218  3.9999999999999997e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000192318  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0327  adenylate kinase  49.07 
 
 
217 aa  218  3.9999999999999997e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000417947 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1256  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  52 
 
 
218 aa  218  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.357832  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1864  adenylate kinase  48.84 
 
 
216 aa  218  6e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.492402  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5145  adenylate kinase  49.77 
 
 
219 aa  218  7.999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.498584 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1452  adenylate kinase  50 
 
 
215 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1753  adenylate kinase  51.78 
 
 
213 aa  218  7.999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000121762  normal  0.119807 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1925  adenylate kinase  51.64 
 
 
224 aa  217  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2404  adenylate kinase  54.26 
 
 
222 aa  216  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.239772  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2847  adenylate kinase  47.93 
 
 
214 aa  217  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000688641  decreased coverage  0.00000000215669 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2810  adenylate kinase  54.26 
 
 
222 aa  216  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0112016  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1332  adenylate kinase  49.53 
 
 
215 aa  216  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.376737 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1798  adenylate kinase  53.23 
 
 
214 aa  216  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000131299  hitchhiker  0.000000153174 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0025  adenylate kinase  48.83 
 
 
215 aa  216  2e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000610793  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2533  adenylate kinase  55.61 
 
 
222 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.154116 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004136  adenylate kinase  49.31 
 
 
214 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0535  adenylate kinase  54.92 
 
 
221 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180208  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16700  adenylate kinase  49.54 
 
 
215 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.528673  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1462  adenylate kinase  47.93 
 
 
219 aa  215  5e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000718997  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39280  Adenylate kinase  54.84 
 
 
215 aa  214  5.9999999999999996e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0806  nucleoside-triphosphate--adenylate kinase  48.87 
 
 
218 aa  214  7e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.248046  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0590  adenylate kinase  54.55 
 
 
221 aa  214  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.012564  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2058  adenylate kinase  47.95 
 
 
215 aa  214  8e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000332952  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2153  adenylate kinase  54.55 
 
 
218 aa  214  9e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0507  adenylate kinase  49.31 
 
 
214 aa  213  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0957  adenylate kinases  47.93 
 
 
214 aa  213  9.999999999999999e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.833948  normal  0.567564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1107  adenylate kinase  51.47 
 
 
216 aa  213  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.211555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>